diffBUM-HMM: a robust statistical modeling approach for detecting RNA flexibility changes in high-throughput structure probing data.

Marangio, Paolo; Law, Ka Ying Toby; Sanguinetti, Guido; Granneman, Sander

Marangio, Paolo; Law, Ka Ying Toby; Sanguinetti, Guido; Granneman, Sander.

Afiliación

Marangio P; School of Informatics, The University of Edinburgh, Edinburgh, UK.
Law KYT; SISSA Data Science Excellence Department Initiative, Trieste, Italy.
Sanguinetti G; Centre for Synthetic and Systems Biology, The University of Edinburgh, Edinburgh, UK.
Granneman S; Centre for Synthetic and Systems Biology, The University of Edinburgh, Edinburgh, UK. gsanguin@sissa.it.

Genome Biol ; 22(1): 165, 2021 05 27.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-34044851

Asunto(s)

Algoritmos; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Cadenas de Markov; Modelos Estadísticos; ARN/química; ARN/genética; Secuencia de Bases; Sitios de Unión; Bases de Datos Genéticas; Modelos Teóricos; Mutación/genética; Nucleótidos/genética; Unión Proteica; Precursores del ARN/genética; ARN Largo no Codificante/genética; Ribosomas/metabolismo

Palabras clave

Hidden Markov model; High-throughput RNA structure probing; RNA structural changes

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Algoritmos / ARN / Cadenas de Markov / Modelos Estadísticos / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Tipo de estudio: Health_economic_evaluation / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: Genome Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Reino Unido

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