Computational methods for RNA modification detection from nanopore direct RNA sequencing data.

Furlan, Mattia; Delgado-Tejedor, Anna; Mulroney, Logan; Pelizzola, Mattia; Novoa, Eva Maria; Leonardi, Tommaso

Furlan, Mattia; Delgado-Tejedor, Anna; Mulroney, Logan; Pelizzola, Mattia; Novoa, Eva Maria; Leonardi, Tommaso.

Afiliación

Furlan M; Center for Genomic Science of IIT@SEMM, Fondazione Istituto Italiano di Tecnologia, Milano, Italy.
Delgado-Tejedor A; Centre for Genomic Regulation (CRG), The Barcelona Institute of Science and Technology, Dr. Aiguader 88, Barcelona 08003 Spain.
Mulroney L; Universitat Pompeu Fabra, Barcelona, Spain.
Pelizzola M; Center for Genomic Science of IIT@SEMM, Fondazione Istituto Italiano di Tecnologia, Milano, Italy.
Novoa EM; European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute, Wellcome Genome Campus, Hinxton, Cambridge, UK.
Leonardi T; Center for Genomic Science of IIT@SEMM, Fondazione Istituto Italiano di Tecnologia, Milano, Italy.

RNA Biol ; 18(sup1): 31-40, 2021 10 15.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-34559589

Asunto(s)

Algoritmos; Biología Computacional/métodos; Secuenciación de Nanoporos/métodos; Procesamiento Postranscripcional del ARN; ARN/química; ARN/genética; Transcriptoma; Animales; Humanos; Programas Informáticos

Palabras clave

RNA modifications; direct rna sequencing; epitranscriptome; nanopore; software

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Algoritmos / ARN / Procesamiento Postranscripcional del ARN / Biología Computacional / Transcriptoma / Secuenciación de Nanoporos Tipo de estudio: Diagnostic_studies Límite: Animals / Humans Idioma: En Revista: RNA Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Italia

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