MS Annika 2.0 Identifies Cross-Linked Peptides in MS2-MS3-Based Workflows at High Sensitivity and Specificity.

Birklbauer, Micha J; Matzinger, Manuel; Müller, Fränze; Mechtler, Karl; Dorfer, Viktoria

Birklbauer, Micha J; Matzinger, Manuel; Müller, Fränze; Mechtler, Karl; Dorfer, Viktoria.

Afiliación

Birklbauer MJ; Bioinformatics Research Group, University of Applied Sciences Upper Austria, Softwarepark 11, 4232 Hagenberg, Austria.
Matzinger M; Research Institute of Molecular Pathology (IMP), Vienna BioCenter (VBC), Campus-Vienna-Biocenter 1, 1030 Vienna, Austria.
Müller F; Research Institute of Molecular Pathology (IMP), Vienna BioCenter (VBC), Campus-Vienna-Biocenter 1, 1030 Vienna, Austria.
Mechtler K; Research Institute of Molecular Pathology (IMP), Vienna BioCenter (VBC), Campus-Vienna-Biocenter 1, 1030 Vienna, Austria.
Dorfer V; Institute of Molecular Biotechnology (IMBA), Austrian Academy of Sciences, Vienna BioCenter (VBC), Dr. Bohr-Gasse 3, 1030 Vienna, Austria.

J Proteome Res ; 22(9): 3009-3021, 2023 09 01.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-37566781

Asunto(s)

Péptidos; Motor de Búsqueda; Flujo de Trabajo; Péptidos/análisis; Espectrometría de Masas/métodos; Motor de Búsqueda/métodos; Algoritmos; Reactivos de Enlaces Cruzados/química

Palabras clave

MS3; PPI; XL-MS; bioinformatics; cross-linking; protein-protein interaction; search engine

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Péptidos / Motor de Búsqueda Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Idioma: En Revista: J Proteome Res Asunto de la revista: BIOQUIMICA Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: Austria

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