Gap-Sensitive Colinear Chaining Algorithms for Acyclic Pangenome Graphs.

Chandra, Ghanshyam; Jain, Chirag

Chandra, Ghanshyam; Jain, Chirag.

Afiliación

Chandra G; Department of Computational and Data Sciences, Indian Institute of Science Bengaluru, India.
Jain C; Department of Computational and Data Sciences, Indian Institute of Science Bengaluru, India.

J Comput Biol ; 30(11): 1182-1197, 2023 11.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-37902967

Asunto(s)

Algoritmos; Genoma; Humanos; Genómica; Análisis de Secuencia de ADN; Alineación de Secuencia

Palabras clave

minimum path cover; sequence alignment; sparse dynamic programming; variation graph

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Algoritmos / Genoma Límite: Humans Idioma: En Revista: J Comput Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / INFORMATICA MEDICA Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: India

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