Scaling up genome annotation using MAKER and work queue.

Thrasher, Andrew; Musgrave, Zachary; Kachmarck, Brian; Thain, Douglas; Emrich, Scott

Thrasher, Andrew; Musgrave, Zachary; Kachmarck, Brian; Thain, Douglas; Emrich, Scott.

Afiliação

Thrasher A; Department of Computer Science and Engineering, University of Notre Dame, Notre Dame, IN, USA.
Musgrave Z; Yelp, Inc., San Francisco, CA, USA.
Kachmarck B; Department of Computer Science and Engineering, University of Notre Dame, Notre Dame, IN, USA.
Thain D; Department of Computer Science and Engineering, University of Notre Dame, Notre Dame, IN, USA.
Emrich S; Department of Computer Science and Engineering, University of Notre Dame, Notre Dame, IN, USA.

Int J Bioinform Res Appl ; 10(4-5): 447-60, 2014.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-24989862

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Genoma; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Algoritmos; Animais; Anopheles/genética; Caenorhabditis/genética; Análise por Conglomerados; Sistemas Computacionais; Software; Moscas Tsé-Tsé/genética

Palavras-chave

Caenorhabditis japonica; bioinformatics; cloud computing; clusters; distributed computing; explicit data transfer; genome annotation; grid computing; next generation sequencing; work queue

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genoma / Biologia Computacional / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Limite: Animals Idioma: En Revista: Int J Bioinform Res Appl Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2014 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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