Reducing animal sequencing redundancy by preferentially selecting animals with low-frequency haplotypes.

Bickhart, D M; Hutchison, J L; Null, D J; VanRaden, P M; Cole, J B

Bickhart, D M; Hutchison, J L; Null, D J; VanRaden, P M; Cole, J B.

Afiliação

Bickhart DM; Animal Genomics and Improvement Laboratory, Agricultural Research Service, USDA, Beltsville, MD 20705-2350. Electronic address: derek.bickhart@ars.usda.gov.
Hutchison JL; Animal Genomics and Improvement Laboratory, Agricultural Research Service, USDA, Beltsville, MD 20705-2350.
Null DJ; Animal Genomics and Improvement Laboratory, Agricultural Research Service, USDA, Beltsville, MD 20705-2350.
VanRaden PM; Animal Genomics and Improvement Laboratory, Agricultural Research Service, USDA, Beltsville, MD 20705-2350.
Cole JB; Animal Genomics and Improvement Laboratory, Agricultural Research Service, USDA, Beltsville, MD 20705-2350.

J Dairy Sci ; 99(7): 5526-5534, 2016 Jul.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27085415

Assuntos

Bovinos/genética; Haplótipos/genética; Análise de Sequência/veterinária; Algoritmos; Animais; Custos e Análise de Custo; Frequência do Gene/genética; Genótipo; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/veterinária; Homozigoto; Humanos; Polimorfismo de Nucleotídeo Único; Análise de Sequência/economia

Palavras-chave

haplotype; inverse weight selection; redundancy; whole-genome sequencing

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Contexto em Saúde: 1_ASSA2030 Problema de saúde: 1_financiamento_saude Assunto principal: Haplótipos / Bovinos / Análise de Sequência Tipo de estudo: Health_economic_evaluation Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: J Dairy Sci Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

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