Evaluating and optimizing the performance of software commonly used for the taxonomic classification of DNA metabarcoding sequence data.

Richardson, Rodney T; Bengtsson-Palme, Johan; Johnson, Reed M

Richardson, Rodney T; Bengtsson-Palme, Johan; Johnson, Reed M.

Afiliação

Richardson RT; Department of Entomology, The Ohio State University-Ohio Agricultural Research and Development Center, 1680 Madison Ave., Wooster, OH, 44691, USA.
Bengtsson-Palme J; Department of Infectious Diseases, The Sahlgrenska Academy, University of Gothenburg, Guldhedsgatan 10, Göteborg, SE-413 46, Sweden.
Johnson RM; Centre for Antibiotic Resistance Research (CARe), University of Gothenburg, PO Box 440, SE-405 30, Gothenburg, Sweden.

Mol Ecol Resour ; 17(4): 760-769, 2017 Jul.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27797448

Assuntos

Código de Barras de DNA Taxonômico/métodos; Software; Teorema de Bayes; Simulação por Computador

Palavras-chave

rtax; utax; DNA barcoding; DNA metabarcoding; rdp Naïve Bayesian Classifier; taxonomic assignment

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Código de Barras de DNA Taxonômico Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Mol Ecol Resour Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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