SUPPA2: fast, accurate, and uncertainty-aware differential splicing analysis across multiple conditions.

Trincado, Juan L; Entizne, Juan C; Hysenaj, Gerald; Singh, Babita; Skalic, Miha; Elliott, David J; Eyras, Eduardo

Trincado, Juan L; Entizne, Juan C; Hysenaj, Gerald; Singh, Babita; Skalic, Miha; Elliott, David J; Eyras, Eduardo.

Afiliação

Trincado JL; Pompeu Fabra University, E08003, Barcelona, Spain.
Entizne JC; University of Dundee, Invergowrie, Dundee, DD2 5DA, UK.
Hysenaj G; Institute of Genetic Medicine, Newcastle University, Central Parkway, Newcastle, NE1 3BZ, UK.
Singh B; Pompeu Fabra University, E08003, Barcelona, Spain.
Skalic M; Pompeu Fabra University, E08003, Barcelona, Spain.
Elliott DJ; Institute of Genetic Medicine, Newcastle University, Central Parkway, Newcastle, NE1 3BZ, UK.
Eyras E; Pompeu Fabra University, E08003, Barcelona, Spain. eduardo.eyras@upf.edu.

Genome Biol ; 19(1): 40, 2018 03 23.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29571299

Assuntos

Processamento Alternativo; Análise de Sequência de RNA; Linhagem Celular; Eritroblastos/metabolismo; Éxons; Humanos; Neurônios/metabolismo; Software

Palavras-chave

Alternative splicing; Biological variability; Differential splicing; Differentiation; RNA-seq; Uncertainty

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Análise de Sequência de RNA / Processamento Alternativo Tipo de estudo: Evaluation_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Genome Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Espanha

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