Bayesian Phylogenetic Analysis of Avipoxviruses from North American Wild Birds Demonstrates New Insights into Host Specificity and Interspecies Transmission.

RESUMEN

El análisis filogenético bayesiano de los avipoxvirus de las aves silvestres de América del Norte demuestra nuevos conocimientos sobre la especificidad del huésped y la transmisión interespecífica. La viruela aviar se diagnostica comúnmente en una variedad de aves silvestres y domésticas de América del Norte, pero se sabe poco sobre las relaciones evolutivas entre los poxvirus. Este estudio tuvo como objetivo determinar las relaciones filogenéticas entre aislamientos identificados en diferentes especies de hospedadores aviares para caracterizar mejor el rango de hospedadores de cepas virales específicas y comparar la variabilidad genética dentro y entre los clados virales. Se incluyeron en este estudio lesiones cutáneas que eran consistentes macro y microscópicamente con la infección por poxvirus de 82 aves recolectadas en Canadá, Estados Unidos y las Islas Vírgenes de los Estados Unidos. Un total de 12 especies de aves fueron representadas; las especies más comunes en la muestra fueron los pavos silvestres (Meleagris gallopavo), huilota común (Zenaida macroura) y cuervos americanos (Corvus brachyrhynchos). Las muestras de poxvirus de estas aves fueron genotipadas mediante PCR que se enfocó en el gene de la proteína central 4b seguido de secuenciación de amplicón. Los análisis filogenéticos bayesianos de estos virus, junto con las secuencias disponibles públicamente, que representan cepas de avipoxvirus de seis continentes revelaron clados monofiléticos estadísticamente significativos basados en distancias genéticas de las secuencias dentro y entre los clados observados. La variación genética dentro del clado de la viruela del pollo fue baja en comparación con el clado de virus de canario. El huésped y los orígenes geográficos de los aislamientos virales revelaron un agrupamiento general de cepas virales dentro de las especies aviares, con algunas excepciones. No se observaron diferencias genéticas entre los virus de Canadá y los Estados Unidos dentro de las especies individuales. Estos resultados son novedosos en la caracterización y comparación de las relaciones filogenéticas de los aislados de poxvirus en especies de aves silvestres de América del Norte. Además, se proporcionan nuevos datos sobre el nivel de especificidad del huésped y las cepas específicas que circulan en América del Norte. Key words: Bayesian analysis, mourning dove, phylogenetic, poxvirus, sequencing, wild turkey, 4b gene.