Identification of bacterial and fungal pathogens directly from clinical blood cultures using whole genome sequencing.

Peterson, S W; Demczuk, W; Martin, I; Adam, H; Bharat, A; Mulvey, M R

Peterson, S W; Demczuk, W; Martin, I; Adam, H; Bharat, A; Mulvey, M R.

Afiliação

Peterson SW; National Microbiology Laboratory, Public Health Agency of Canada, Winnipeg, Manitoba, Canada.
Demczuk W; National Microbiology Laboratory, Public Health Agency of Canada, Winnipeg, Manitoba, Canada.
Martin I; National Microbiology Laboratory, Public Health Agency of Canada, Winnipeg, Manitoba, Canada.
Adam H; Diagnostic Services, Shared Health Manitoba, Health Sciences Centre, Winnipeg, Manitoba, Canada.
Bharat A; National Microbiology Laboratory, Public Health Agency of Canada, Winnipeg, Manitoba, Canada. Electronic address: Amrita.Bharat@phac-aspc.gc.ca.
Mulvey MR; National Microbiology Laboratory, Public Health Agency of Canada, Winnipeg, Manitoba, Canada.

Genomics ; 115(2): 110580, 2023 03.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-36792020

Assuntos

Hemocultura; Genoma Bacteriano; Humanos; Tipagem de Sequências Multilocus; Bactérias; Sequenciamento Completo do Genoma; Farmacorresistência Bacteriana/genética; Antibacterianos/farmacologia

Palavras-chave

WGS from specimen; Whole genome sequencing; blood culture; microbial identification

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genoma Bacteriano / Hemocultura Tipo de estudo: Diagnostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Genomics Assunto da revista: GENETICA Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article País de afiliação: Canadá

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