Big data from small animals: integrating multi-level environmental data into the Dog Aging Project.

ABSTRACT

Environmental exposures can have large impacts on health outcomes. While many resources have been dedicated to understanding how humans are influenced by the environment, few efforts have been made to study the role of built and natural environmental features on animal health. The Dog Aging Project (DAP) is a longitudinal community science study of aging in companion dogs. Using a combination of owner-reported surveys and secondary sources linked through geocoded coordinates, DAP has captured home, yard and neighbourhood variables for over 40,000 dogs. The DAP environmental data set spans four domains the physical and built environment; chemical environment and exposures; diet and exercise; and social environment and interactions. By combining biometric data, measures of cognitive function and behaviour, and medical records, DAP is attempting to use a big-data approach to transform the understanding of how the surrounding world affects the health of companion dogs. In this paper, the authors describe the data infrastructure developed to integrate and analyse multi-level environmental data that can be used to improve the understanding of canine co-morbidity and aging.

L'impact des expositions environnementales sur la santé est parfois considérable. Si diverses ressources ont été consacrées à décrire l'influence de l'environnement sur les humains, les efforts visant à étudier l'effet des paramètres environnementaux, tant naturels qu'anthropiques, sur la santé animale sont plus rares. Le Dog Aging Project (DAP) est une étude scientifique longitudinale à base communautaire portant sur le vieillissement du chien de compagnie. À partir d'observations notifiées par les propriétaires de chiens et de sources secondaires reliées par des coordonnées de géocodage, le DAP a réuni des variables sur le foyer d'habitation, l'environnement extérieur immédiat et le voisinage de plus de 40 000 chiens. Les séries de données environnementales du DAP couvrent quatre domaines l'environnement physique et bâti ; l'environnement chimique et les expositions ; le régime alimentaire et la dépense physique ; et les interactions et l'environnement social. En combinant les données biométriques, les mesures du fonctionnement cognitif et comportemental et les dossiers médicaux, le DAP cherche à utiliser l'approche des mégadonnées pour transformer notre perception de la manière dont le monde qui nous entoure affecte la santé des chiens de compagnie. Les auteurs décrivent l'infrastructure des données mise au point pour intégrer et analyser des données environnementales multi-niveaux, afin de mieux comprendre les phénomènes de comorbidité et de vieillissement chez le chien.

RESUMEN

La exposición a factores ambientales puede tener muchas e importantes repercusiones en los resultados sanitarios. Si bien se han dedicado cuantiosos recursos a aprehender la influencia del entorno en las personas, poco se ha hecho para estudiar el modo en que las características del medio, tanto natural como artificial, repercuten en la salud de los animales. El proyecto sobre Envejecimiento canino [Dog Aging Project DAP] es un estudio longitudinal de ciencia ciudadana centrado en el envejecimiento de los perros de compañía. Combinando la información de encuestas realizadas a propietarios y de fuentes secundarias y vinculando los datos a coordenadas geográficas codificadas, el DAP ha permitido reunir información de variables ligadas al hogar, el jardín y el barrio de más de 40 000 perros. El conjunto de datos ambientales del DAP cubre cuatro grandes ámbitos medio físico y urbanizado; condiciones químicas del entorno y exposición a sustancias químicas; régimen alimentario y ejercicio; y medio e interacciones sociales. Pasando por el uso combinado de datos biométricos, historias clínicas y mediciones de la función cognitiva y el comportamiento, el DAP apunta ahora a emplear técnicas de trabajo con macrodatos para hacer evolucionar nuestras ideas sobre la influencia del mundo que nos rodea en la salud de los perros de compañía. Los autores describen la infraestructura de datos establecida para integrar y analizar datos ambientales multiestratificados que nos ayuden a conocer mejor los procesos de comorbilidad y envejecimiento en el perro.