Molecular and epidemiologic characterization of the diphtheria outbreak in Venezuela.

In 2016, Venezuela faced a large diphtheria outbreak that extended until 2019. Nasopharyngeal or oropharyngeal samples were prospectively collected from 51 suspected cases and retrospective data from 348 clinical records was retrieved from 14 hospitals between November 2017 and November 2018. Confirmed pathogenic Corynebactrium isolates were biotyped. Multilocus Sequence Typing (MLST) was performed followed by next-generation-based core genome-MLST and minimum spanning trees were generated. Subjects between 10 and 19 years of age were mostly affected (n = 95; 27.3%). Case fatality rates (CFR) were higher in males (19.4%), as compared to females (15.8%). The highest CFR (31.1%) was observed among those under 5, followed by the 40 to 49 age-group (25.0%). Nine samples corresponded to C. diphtheriae and 1 to C. ulcerans. Two Sequencing Types (ST), ST174 and ST697 (the latter not previously described) were identified among the eight C. diphtheriae isolates from Carabobo state. Cg-MLST revealed only one cluster also from Carabobo. The Whole Genome Sequencing analysis revealed that the outbreak seemed to be caused by different strains with C. diphtheriae and C. ulcerans coexisting. The reemergence and length of this outbreak suggest vaccination coverage problems and an inadequate control strategy.

Non-capsulated and capsulated Haemophilus influenzae in children with acute otitis media in Venezuela: a prospective epidemiological study.

BACKGROUND: Non-typeable Haemophilus influenzae (NTHi) and Streptococcus pneumoniae are major causes of bacterial acute otitis media (AOM). Data regarding AOM are limited in Latin America. This is the first active surveillance in a private setting in Venezuela to characterize the bacterial etiology of AOM in children < 5 years of age. METHODS: Between December 2008 and December 2009, 91 AOM episodes (including sporadic, recurrent and treatment failures) were studied in 87 children enrolled into a medical center in Caracas, Venezuela. Middle ear fluid samples were collected either by tympanocentesis or spontaneous otorrhea swab sampling method. Standard laboratory and microbiological techniques were used to identify bacteria and test for antimicrobial resistance. The results were interpreted according to Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) 2009 for non-meningitis isolates. All statistical analyses were performed using SAS 9.1 and Microsoft Excel (for graphical purposes). RESULTS: Overall, bacteria were cultured from 69.2% (63 of the 91 episodes); at least one pathogen (S. pneumoniae, H. influenzae, S. pyogenes or M. catarrhalis) was cultured from 65.9% (60/91) of episodes. H. influenzae (55.5%; 35/63 episodes) and S. pneumoniae (34.9%; 22/63 episodes) were the most frequently reported bacteria. Among H. influenzae isolates, 62.9% (22/35 episodes) were non-capsulated (NTHi) and 31.4% (11/35 episodes) were capsulated including types d, a, c and f, across all age groups. Low antibiotic resistance for H. influenzae was observed to amoxicillin/ampicillin (5.7%; 2/35 samples). NTHi was isolated in four of the six H. influenzae positive samples (66.7%) from recurrent episodes. CONCLUSIONS: We found H. influenzae and S. pneumoniae to be the main pathogens causing AOM in Venezuela. Pneumococcal conjugate vaccines with efficacy against these bacterial pathogens may have the potential to maximize protection against AOM.

Estudio de microorganismos anaeróbicos aislados en el Laboratorio Metropolitano / Study of anaerobic microorganisrn isolated in the Laboratorio Metropolitano

Se identificaron en forma prospectiva los microorganismos anaeróbicos aislados de las muestras clínicas enviadas para cultivo de anaerobios, en un lapso comprendido entre octubre de 1993 y julio 1997, obteniendose un total de 306 cepas: peptostreptococcus 90, bacteroides grupo fragilis 81, propionibacterium acnes 42, prevotella spp 40, clostridium perfringes 28, eubacterium spp 11, fusobacterium spp 7, entre otros. Se practicó la sensibilidad in vitro a 114 cepas en total, utilizando el método ATB ANA (bioMérieux) para los principales antibióticos antianaeróbicos con patrones de sensibilidad semejantes al resto de la literatura internacional revisada

Streptococcus pneumoniae con sensibilidad disminuida a la penicilina: comparación de métodos diagnósticos / Streptococcus pneumoniae with sensibility decrease a the penicillin: comparison of diagnosis methods

Un total de 33 cepas de Strepcoccus pneumoniae aisladas de muestras biológicas y clasificadas inicialmente con sensibilidad a la penicilina por el método de difusión del disco oxacilina de µ(Kirby-Bauer), fueron probadas por el método de Etest (AB Biodisk) y la galeria ATB strep (bioMérieux), con la finalidad de determinar el nivel de resistencia de las cepas estudiadas y comparar los resultados obtenidos por ambos métodos. De las 33 cepas 25(75,76 por ciento) resultaron con sensibilidad tanto por Etest como por ATB Strep

Análisis microbiológico de 2,782 urocultivos: estudio prospectivo / Analysis microbiology of 2,782 urinalysis announcement study

Se analizaron en forma prospectiva los microorganismos de urocultivos y su sensibilidad antibacteriana, procesados en el Laboratotio Metropolitano entre enero-diciembre de 1994. De 2,782 urocultivos efectuados, se aislaron 771 (27.71 por ciento) microrganismos, siendo los más frecuentes Escherichia coli 485 (62.80 por ciento), seguidos por Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis, Enterococcus faecalis, Candida albicans, Candida spp, Candida tropicalis, Pseudomonas aeruginosa y Streptococcus agalactiae, entre otros. La candidiasis urinaria fue un resultado muy frecuente en nuestra serie (13 por ciento) de urocultivos positivos. En comparación con estudios anteriores, se apreció disminución de la sensibilidad in vitro de los antimicrobianos más frecuentemente utilizados para esta infecciones

Análisis microbiológico de 793 hemocultivos: estudio prospectivo / Analysis microbiology of 793 announcement study

Se analizaron en forma retrospectiva los microrganismos aislados de los hemocultivos, así como su sensibilidad antibacteriana, procesadosen el Laboratorio Metropolitano, entre enero-diciembre de 1994. De 793 hemocultivos estudiados, obtuvimos 118 aislamientos (14.88 por ciento), con una incidencia semejante entre bacterias Gram negativas (45.76 por ciento) y Gram positivas (49.16 por ciento), además con 5.08 por ciento de hongos. El Staphylococcus epidermidis mostró una alta resistencia a la oxacilina y quinolonas, además se apreció una importante incidencia de multirresistencia en los bacilos Gram negativos aislados, especialmente a la ampicilina, cotrimoxazol e incluso a quinolonas de utilización más reciente

Sensibilidad in vitro de levaduras a diferentes drogas antifungicas estudio prospectivo / In vitro sensivity of ferment to different antifungicas drugs: prospective study

Se evaluó la sensibilidad in vitro de 178 cepas de levaduras aisladas en la sección de bacteriología del Laboratorio Metropolitano (Policlínica Metropolitana) y en la Unidad de Micología del Hospital Vargas de Caracas, a los siguientes antimicóticos: Anfotericina B, Flucitosina, Ketoconazol, Miconazol, Econazol y Nistatina, en un período de 10 meses (nov.1994-agosto 1995). Para la identificación de las cepas se emplearon métodos manuales bioquímicos y automatizados por sistema ATB Expression, y para la determinación de la sensibilidad se utilizó el sistema ATB Fungus (bioMérieux). De 178 cepas: 83 C. albicans (46,62 por ciento); C. tropicalis 51 (28,65 por ciento); C. glabrata 14 (7,86 por ciento); C. parapsilosis 13 (7,30 por ciento), entre otras. El porcentaje de sensibilidad en general fue de: Anfotericina B 94,38 por ciento, Flucitosina 90,44 por ciento, Nistatina 97,19 por ciento, Ketoconazol 89,88 por ciento, Miconazol 94,94 por ciento y Econazol 85,95 por ciento. Estos resultados nos permiten afirmar que en nuestro estudio se observó una alta sensibilidad in vitro de las levaduras a las diferentes drogas antimicóticas utilizadas; sin embargo, es necesario ampliar estos datos con otros centros y compararlos con otras técnicas de sensibilidad in vitro y con la inclusión de nuevos antimicóticos de uso más reciente como Fluconazol e Itraconazol.