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Nat Commun ; 6: 7500, 2015 Jun 24.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-26105758

RESUMO

Here we report a genome-wide association study for non-pathological pinna morphology in over 5,000 Latin Americans. We find genome-wide significant association at seven genomic regions affecting: lobe size and attachment, folding of antihelix, helix rolling, ear protrusion and antitragus size (linear regression P values 2 × 10(-8) to 3 × 10(-14)). Four traits are associated with a functional variant in the Ectodysplasin A receptor (EDAR) gene, a key regulator of embryonic skin appendage development. We confirm expression of Edar in the developing mouse ear and that Edar-deficient mice have an abnormally shaped pinna. Two traits are associated with SNPs in a region overlapping the T-Box Protein 15 (TBX15) gene, a major determinant of mouse skeletal development. Strongest association in this region is observed for SNP rs17023457 located in an evolutionarily conserved binding site for the transcription factor Cartilage paired-class homeoprotein 1 (CART1), and we confirm that rs17023457 alters in vitro binding of CART1.


Assuntos
Pavilhão Auricular/embriologia , Receptor Edar/genética , Morfogênese/genética , Proteínas com Domínio T/genética , Adolescente , Adulto , Indígena Americano ou Nativo do Alasca/genética , Animais , Linhagem Celular Tumoral , Pavilhão Auricular/anatomia & histologia , Feminino , Estudo de Associação Genômica Ampla , Genótipo , Proteínas de Homeodomínio/metabolismo , Humanos , América Latina , Masculino , Camundongos , Fenótipo , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Proteínas com Domínio T/metabolismo , População Branca/genética , Adulto Jovem
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