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Biomark Med ; 14(17): 1651-1662, 2020 12.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33336597

RESUMO

Aim: We aimed to develop a candidate-based integrative public data mining strategy for validation of novel prognostic markers in lung adenocarcinoma. Materials & methods: An in silico approach integrating meta-analyses of publicly available clinical information linked RNA expression, gene copy number and mutation datasets combined with independent immunohistochemistry and survival datasets. Results: After validation of pipeline integrity utilizing data from the well-characterized prognostic factor Ki-67, prognostic impact of the calcium- and integrin-binding protein, CIB1, was analyzed. CIB1 was overexpressed in lung adenocarcinoma which correlated with pathological tumor and pathological lymph node status and impaired overall/progression-free survival. In multivariate analyses, CIB1 emerged as UICC stage-independent risk factor for impaired survival. Conclusion: Our pipeline holds promise to facilitate further identification and validation of novel lung cancer-associated prognostic markers.


Assuntos
Adenocarcinoma de Pulmão/diagnóstico , Proteínas de Ligação ao Cálcio/metabolismo , Mineração de Dados , Neoplasias Pulmonares/diagnóstico , Biomarcadores Tumorais/genética , Biomarcadores Tumorais/metabolismo , Proteínas de Ligação ao Cálcio/genética , Estudos de Coortes , Simulação por Computador , Conjuntos de Dados como Assunto , Humanos , Antígeno Ki-67/genética , Antígeno Ki-67/metabolismo , Prognóstico , RNA Mensageiro/metabolismo , Análise de Sobrevida , Transcriptoma
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