Caracterização anatomopatológica e bacteriológica em frangos de corte condenados totalmente por colibacilose sob Serviço de Inspeção Federal / Pathological and bacteriological characterization on broilers totally condemned due to colibacillosis under the control of the Federal Inspection Service

A colibacilose é a principal causa infecciosa de condenação total de carcaça em frangos de corte no sul do Brasil. Esse trabalho tem por objetivo determinar o grau de concordância entre a condenação total por colibacilose de frangos de corte abatidos em estabelecimento sob Serviço de Inspeção Federal (SIF) com o diagnóstico anatomopatológico e bacteriológico. O estudo foi realizado com 45 frangos de corte condenados totalmente por colibacilose (caso) e seus respectivos 45 controles (frangos sem lesões). Em todos os frangos condenados pelo SIF havia lesões macroscópicas e, nos controles não se observou. Através do teste Kappa-Cohen´s essas duas variáveis apresentaram concordância quase perfeita. As aves condenadas apresentaram lesões em fígado (27/45); em fígado e sacos aéreos (11/45); em fígado e coração (2/45); fígado, sacos aéreos e coração (2/45); fígado, sacos aéreos e oviduto (1/45); fígado, sacos aéreos, coração e tecido subcutâneo (1/45); e fígado, sacos aéreos, oviduto e baço (1/45). Observou-se concordância quase perfeita entre condenação e lesão hepática. Histologicamente, em 41 casos e 12 controles observaram-se lesões, sendo os mais frequentes hepatite necrosante aleatória, bronquite fibrino-heterofílica, pericardite aguda e traqueíte linfoplasmocitária. Nas aves com hepatite identificou-se E. coli, Enterococcus sp. e Streptococcus sp. (10/38) e, nas aves com bronquite ou broncopneumonia isolou-se Escherichia coli e Staphylococcus coagulase positiva (9/14). O PCR em tempo real e a imuno-histoquímica para Mycoplasma gallisepticum e M. synoviae foram negativos. Nos casos de condenação total por colibacilose o fígado foi o principal órgão acometido, portanto, o critério de condenação deveria ser revisto, sugerindo condenação por hepatite nesses casos, já que outras bactérias podem causar hepatite, como foi demonstrado nesse estudo.(AU)

Colibacillosis is the main infectious cause of total carcass condemnation in broilers in southern Brazil. This study aims to determine the degree of agreement between the total carcass condemnation for colibacillosis in broilers slaughtered in establishments under Federal Inspection Service (SIF) with the pathological and bacteriological diagnosis. The study was conducted with 45 broilers totally condemned by colibacillosis (case) and theirs 45 respective controls (chickens without lesions). All broilers condemned had gross lesions and the controls had not. The Kappa-Cohen's test showed that these two variables had almost perfect agreement. Broilers condemned showed lesions in liver (27/45); liver and air sacs (11/45); liver and heart (2/45); liver, heart and air sacs (2/45); liver, air sacs and oviduct (1/45); liver, air sacs, heart and subcutaneous (1/45); and liver, air sacs, oviduct and spleen (1/45). There is almost perfect agreement between carcass condemnation and liver damage. Histologically, in 41 cases and 12 controls were observed lesions, the most frequent diagnoses were random necrotizing hepatitis, fibrinous-heterophilic bronchitis, acute pericarditis and lymphoplasmacytic tracheitis. In hepatitis cases was isolated Escherichia coli, Enterococcus sp. and Streptococcus sp. (10/38) and in bronchitis or bronchopneumonia E. coli and coagulase positive Staphylococcus (9/14). The polymerse chain reaction (PCR) and immunohistochemistry (IHC) tests for Mycoplasma gallisepticum and M. synoviae were negative. In cases of total carcass condemnation by Colibacillosis the liver was the main organ affected. Therefore, the condemnation criteria should be revised, suggesting conviction for hepatitis in these cases, because other bacteria can cause hepatitis, as demonstrated in this study.(AU)

Diagnóstico imuno-histoquímico e caracterização anatomopatológica de Mycoplasma gallisepticum em galinhas de subsistência / Immunohistochemical diagnosis and pathological characterization of Mycoplasma gallisepticum in free-range chicken

A micoplasmose aviária é causada por bactérias da família Mycoplasmataceae. Mycoplasma gallisepticum (MG) é a espécie mais patogênica e que tem a maior importância econômica para a produção avícola. Este estudo teve por objetivo utilizar a técnica de imuno-histoquímica (IHQ) como método de diagnóstico da infecção por MG em aves. No presente relato são descritos dois surtos de micoplasmose por MG em galinhas de subsistência. Clinicamente as aves apresentaram prostração, hiporexia, dificuldade respiratória, secreção nasal e ocular. Na necropsia foram observados secreção serosa, edema e deposição de cáseo em conjuntiva (7/10) e seios nasais (4/10), sacos aéreos espessados com espuma e cáseo (6/10); traqueia difusamente avermelhada (4/10); pulmões com pontos esbranquiçados de 0,5cm (2/10); e saco pericárdico com deposição de fibrina (2/10). No exame histopatológico foram evidenciados traqueíte (10/10), sinusite (5/5) e conjuntivite (3/4) hiperplásica linfoplasmocitária aguda; broncopneumonia fibrinonecrótica (5/10); pericardite fibrinosa aguda (2/10); e aerossaculite fibrinonecrótica (1/1). No exame de IHQ anti-MG foi evidenciada marcação na superfície extracelular dos cílios e/ou topo do epitélio da traqueia (10/10), brônquios (5/10) e seios nasais (4/5). Em sete dos dez casos analisados foi detectada a presença de MG por PCR em tempo real realizado a partir de amostras de suabe traqueal. A técnica de IHQ anti-MG utilizada como método de diagnóstico apresentou boa concordância com os sinais clínicos, as lesões histopatológicas e os resultados de PCR em tempo real.

Avian mycoplasmosis is caused by bacteria from the Mycoplasmataceae family. Mycoplasma gallisepticum (MG) is the most pathogenic and economically significant species affecting poultry. The aim of this study was to use the immunohistochemistry technique (IHC) as a diagnostic method for the MG infection in poultry. In this report we described two outbreaks of mycoplasmosis caused by MG in free-range chickens. Clinical signs were characterized by prostration, decreased appetite, difficult breathing, nasal and ocular discharge. Necropsy findings were serous secretion in conjunctiva (7/10) and seioses (4/10), edema and caseous exudate; air sacs thickened with foam and caseous exudate (6/10); trachea diffusely reddish (4/10); lungs with 0.5 cm whitish spots (2/10); and pericardial sac with fibrin exudate (2/10). Histologically was observed a lymphoplasmacytic hyperplastic acute tracheitis (10/10), seiositis (5/5) and conjunctivitis (3/4); fibrinonecrotic bronchopneumonia (5/10); acute fibrinous pericarditis (2/10); and fibrinonecrotic aerosaculitis (1/1). IHC anti-MG stained in the extracellular surface of ciliated brush border and/or in the top of epithelium of trachea (10/10), bronchi (5/10) and sinuses (4/5). In seven out of ten cases it was possible to detect MG by real-time PCR from tracheal swabs. IHC anti-MG used as a diagnostic method showed good correlation with clinical signs, lesions and real-time PCR results.

Genetic variability in Microsporum canis isolated from cats, dogs and humans in Brazil.

Dermatophytosis caused by Microsporum canis is a heterogeneous disease with variable clinical manifestations. M. canis is a zoophilic dermatophyte and the most frequent fungi isolated from dogs, cats and children in Brazil. The aim of this study was to investigate the genetic variability of M. canis isolates from different animal species using two microsatellite markers, namely, McGT(13) and McGT(17), and to correlate the results with the clinical and epidemiological patient data in Brazil. The study included a global set of 102 M. canis strains, including 37 symptomatic cats, 35 asymptomatic cats, 19 human patients with tinea, 9 asymptomatic dogs and 2 symptomatic dogs. A total of 14 genotypes were identified, and 6 large populations were distinguished. There was no correlation between these multilocus genotypes and the clinical and epidemiological data, including the source, symptomatology, clinical picture, breed, age, sex, living conditions and geographic location. These results demonstrate that the use of microsatellite polymorphisms is a reliable method for the differentiation of M. canis strains. However, we were unable to demonstrate a shared clinical and epidemiological pattern among the same genotype samples.

Development of a real-time polymerase chain reaction assay for single nucleotide polymorphism genotyping codons 136, 154, and 171 of the prnp gene and application to Brazilian sheep herds.

Scrapie is a transmissible spongiform encephalopathy of sheep and goats and is associated with the deposition of an abnormal isoform of prion protein (PrP(sc)). This isoform presents an altered conformation that leads to its aggregation in the host's central nervous and lymphoreticular systems. A predisposition to the prion-agent infection can be influenced by specific genotypes that are related to polymorphisms in the ovine prnp gene. The most characterized polymorphisms occur at codons 136, 154, and 171, with genotype VRQ being the most susceptible and ARR the most resistant. In the current study, a real-time quantitative polymerase chain reaction (qPCR) technique based on allele-specific TaqMan probes was developed to identify single nucleotide polymorphisms in the prnp gene from Brazilian herds. Specific primers and TaqMan probes were designed for all 3 codons of interest. Samples from a total of 142 animals were analyzed by qPCR, followed by DNA sequencing of the amplicons. All of the genotypes determined by qPCR were in agreement with the data determined by DNA sequencing. In all 3 of the analyzed breeds, the majority of the animals were AA homozygous for the 136 codon. The most frequent genotype for codon 154 was RR, and genotypes QQ and QR were the most frequent for codon 171. The results are discussed in relation to establishing scrapie control measures and breeding programs for Brazilian herds.

Nested-PCR for the detection of Mycoplasma hyopneumoniae in bronchial alveolar swabs, frozen tissues and formalin-fixed paraffin-embedded swine lung samples: comparative evaluation with immunohistochemical findings and histological features / Detecção de Mycoplasma hyopneumoniae por PCR em amostras de pulmão suíno fixadas em formalina e associação com achados histológicos e imuno-histoquímicos

The diagnosis of Mycoplasma hyopneumoniae infection is often performed through histopathology, immunohistochemistry (IHC) and polymerase chain reaction (PCR) or a combination of these techniques. PCR can be performed on samples using several conservation methods, including swabs, frozen tissue or formalin-fixed and paraffin-embedded (FFPE) tissue. However, the formalin fixation process often inhibits DNA amplification. To evaluate whether M. hyopneumoniae DNA could be recovered from FFPE tissues, 15 lungs with cranioventral consolidation lesions were collected in a slaughterhouse from swine bred in herds with respiratory disease. Bronchial swabs and fresh lung tissue were collected, and a fragment of the corresponding lung section was placed in neutral buffered formalin for 48 hours. A PCR assay was performed to compare FFPE tissue samples with samples that were only refrigerated (bronchial swabs) or frozen (tissue pieces). M. hyopneumoniae was detected by PCR in all 15 samples of the swab and frozen tissue, while it was detected in only 11 of the 15 FFPE samples. Histological features of M. hyopneumoniae infection were presented in 11 cases and 7 of these samples stained positive in IHC. Concordance between the histological features and detection results was observed in 13 of the FFPE tissue samples. PCR was the most sensitive technique. Comparison of different sample conservation methods indicated that it is possible to detect M. hyopneumoniae from FFPE tissue. It is important to conduct further research using archived material because the efficiency of PCR could be compromised under these conditions.

O diagnóstico de infecção por Mycoplasma hyopneumoniae é frequentemente realizado através de histopatologia, imuno-histoquímica (IHQ) e reação em cadeia da polimerase (PCR), ou uma combinação dessas técnicas. PCR pode ser realizada a partir de amostras submetidas a vários métodos de conservação, incluindo swabs, tecido refrigerado ou congelado, ou ainda tecido fixado em formalina e embebido em parafina (FFEP). Entretanto, o processo de fixação em formalina pode inibir a amplificação de DNA. Para avaliar se DNA de M. hyopneumoniae poderia ser recuperado de tecido FFEP, 15 pulmões com lesões de consolidação crânio-ventral de suínos oriundos de rebanhos com problemas respiratórios foram selecionados no abatedouro. Swabs bronquiais e pulmão fresco foram colhidos, e um fragmento da mesma porção de pulmão foi colocado por 48 horas em solução de formalina tamponada e posteriormente processado e embebido em parafina. PCR foi realizada comparando amostras de tecido fixado em formalina com amostras que passaram somente por refrigeração (swab bronquial) ou foram congeladas (fragmentos de tecido). A detecção de M. hyopneumoniae ocorreu em todas as 15 amostras de swabs e tecido congelado enquanto em amostras de tecido FFEP, o agente foi detectado somente em 11 das 15 amostras. Características histológicas de infecção por M. hyopneumoniae ocorreram em 11 casos e 7 destas amostras obtiveram marcação imuno-histoquímica positiva. Concordância entre histologia e detecção a partir de tecido FFEP foi observada em 13 casos. Dentre as técnicas analisadas, a PCR foi a mais sensível. A comparação de diferentes métodos de conservação de amostras indica que é possível detectar M. hyopneumoniae a partir de tecido FFEP, fato importante para pesquisa utilizando material arquivado, porém a eficácia do teste de PCR pode ficar comprometida sob essas condições.

O impacto do conhecimento previo da soropositividade em parturientes / The impact of the awareness of being hiv seropositive on pregnant women

O presente estudo objetivou analisar se o fato das gestantes ja saberem ser HIV positiva modifica sua evolucao obstetrica e o compromentimento do concepto. Analisamoss todas as parturientes HIV positivas da maternidade da Faculdade de Medicina da PUCSP, no periodo de janeiro de 1997 ate dezembro de 2000. Muitas delas ja traziam a informacao de serem HIV positivas; aquelas que desconheciam sua situacao sorologica faziam o teste rapido no momento da admissao para o parto. Retrospectivamente classificamos as parturientes HIV positivas em dois grupos: ja conheciam sua situacao de HIV positivo(grupo I) e souberam ser HIV+ na admissao para o parto (grupo II). Para a interpretacao dos resultados usamos os testes Mann-Whitney(idade), qui-quadrado de Pearson (variaveis epidemiologicas, aspectos obstetricos pre-natal, parto e puerperio e dados do concepto), a particao do qui-quadrado(uso de suplementacao vitaminica, uso de AZT e intercorrencias do concepto) e o teste exato de Fischer (alcoolismo). Encontrou-se um total de 131 parturientes HIV+ no periodo estudado, sendo que 95 (72,5 porcento) ja sabiam ser HIV+ anters da admissao na maternidade e 36 (27,5 porcento) desconheciam sua situacao sorologica. Os grupos mostraram-se semelhantes com relacao as variaveis epidemiologicas estudadas, ou seja, eram grupos epidemiologicamente identicos. As parturientes do grupo II tiveram maior numero de intercorrencias na presente gestacao (tiveram mais infeccoes urinarias, anemia, hipertensao arterial, aminorexe prematura e DST). As parturientes do grupo I usaram mais adequadamente e suplementacao vitaminica no pre-natal e no momento do parto receberam mais frequentemente o AZT e fizeram mais vezes a laqueadura tubarea

Automated annotation of keywords for proteins related to mycoplasmataceae using machine learning techniques.

MOTIVATION: With the increase in submission of sequences to public databases, the curators of these are not able to cope with the amount of information. The motivation of this work is to generate a system for automated annotation of data we are particularly interested in, namely proteins related to the Mycoplasmataceae family. Following previous works on automatic annotation using symbolic machine learning techniques, the present work proposes a method of automatic annotation of keywords (a part of the SWISS-PROT annotation procedure), and the validation, by an expert, of the annotation rules generated. The aim of this procedure is twofold: to complete the annotation of keywords of those proteins which is far from adequate, and to produce a prototype of the validation environment, which is aimed at an expert who does not have a deep knowledge of the structure of the current databases containing the necessary information s/he needs. RESULTS: As for the first objective, a rate of correct keywords annotation of 60% is reported in the literature. Our preliminary results show that with a slightly different method, applied this method to data related to Mycoplasmataceae only, we are able to increase that rate of correct annotation.

O impacto do conhecimento prévio da soropositividade em parturientes / The impact of the awareness of being HIV seropositive on parturients

Objetiva analisar se o fato das gestantes já saberem ser HIV positivas modifica sua evoluçäo obstétrica e comprometimento do concepto. Foram analisadas todas as parturientes HIV positivas da maternidade da Faculdade de Medicina da PUC. SP, no período de janeiro de 1997 até dezembro de 2000. Muitas delas já traziam a informaçäo de serem HIV positivas/ aquelas que desconheciam sua situaçäo sorológica faziam o teste rápido no momento da admissäo para o parto