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1.
J Med Chem ; 57(6): 2813-9, 2014 Mar 27.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-24592914

RESUMO

A series of 3-oxo-C12-HSL, tetramic acid, and tetronic acid analogues were synthesized to gain insights into the structural requirements for quorum sensing inhibition in Staphylococcus aureus. Compounds active against agr were noncompetitive inhibitors of the autoinducing peptide (AIP) activated AgrC receptor, by altering the activation efficacy of the cognate AIP-1. They appeared to act as negative allosteric modulators and are exemplified by 3-tetradecanoyltetronic acid 17, which reduced nasal cell colonization and arthritis in a murine infection model.


Assuntos
Antibacterianos/farmacologia , Percepção de Quorum/efeitos dos fármacos , Staphylococcus aureus/efeitos dos fármacos , Animais , Antibacterianos/síntese química , Proteínas de Bactérias/antagonistas & inibidores , Proteínas de Bactérias/efeitos dos fármacos , Linhagem Celular , Furanos/síntese química , Furanos/farmacologia , Indicadores e Reagentes , Quelantes de Ferro/farmacologia , Camundongos , Testes de Sensibilidade Microbiana , Cavidade Nasal/citologia , Peptídeos Cíclicos/antagonistas & inibidores , Proteínas Quinases/efeitos dos fármacos , Pirrolidinonas/síntese química , Pirrolidinonas/farmacologia , Transdução de Sinais/efeitos dos fármacos , Bibliotecas de Moléculas Pequenas , Infecções Estafilocócicas/tratamento farmacológico , Infecções Estafilocócicas/microbiologia , Relação Estrutura-Atividade
2.
PLoS Pathog ; 9(7): e1003508, 2013.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-23935486

RESUMO

Bacterial populations co-ordinate gene expression collectively through quorum sensing (QS), a cell-to-cell communication mechanism employing diffusible signal molecules. The LysR-type transcriptional regulator (LTTR) protein PqsR (MvfR) is a key component of alkyl-quinolone (AQ)-dependent QS in Pseudomonas aeruginosa. PqsR is activated by 2-alkyl-4-quinolones including the Pseudomonas quinolone signal (PQS; 2-heptyl-3-hydroxy-4(1H)-quinolone), its precursor 2-heptyl-4-hydroxyquinoline (HHQ) and their C9 congeners, 2-nonyl-3-hydroxy-4(1H)-quinolone (C9-PQS) and 2-nonyl-4-hydroxyquinoline (NHQ). These drive the autoinduction of AQ biosynthesis and the up-regulation of key virulence determinants as a function of bacterial population density. Consequently, PqsR constitutes a potential target for novel antibacterial agents which attenuate infection through the blockade of virulence. Here we present the crystal structures of the PqsR co-inducer binding domain (CBD) and a complex with the native agonist NHQ. We show that the structure of the PqsR CBD has an unusually large ligand-binding pocket in which a native AQ agonist is stabilized entirely by hydrophobic interactions. Through a ligand-based design strategy we synthesized and evaluated a series of 50 AQ and novel quinazolinone (QZN) analogues and measured the impact on AQ biosynthesis, virulence gene expression and biofilm development. The simple exchange of two isosteres (OH for NH2) switches a QZN agonist to an antagonist with a concomitant impact on the induction of bacterial virulence factor production. We also determined the complex crystal structure of a QZN antagonist bound to PqsR revealing a similar orientation in the ligand binding pocket to the native agonist NHQ. This structure represents the first description of an LTTR-antagonist complex. Overall these studies present novel insights into LTTR ligand binding and ligand-based drug design and provide a chemical scaffold for further anti-P. aeruginosa virulence drug development by targeting the AQ receptor PqsR.


Assuntos
Proteínas de Bactérias/metabolismo , Pseudomonas aeruginosa/fisiologia , Quinolonas/metabolismo , Percepção de Quorum , Transdução de Sinais , Fatores de Transcrição/metabolismo , Alquilação , Antibacterianos/química , Antibacterianos/metabolismo , Antibacterianos/farmacologia , Proteínas de Bactérias/agonistas , Proteínas de Bactérias/antagonistas & inibidores , Proteínas de Bactérias/química , Sítios de Ligação , Biofilmes/efeitos dos fármacos , Desenho de Fármacos , Regulação Bacteriana da Expressão Gênica , Ligantes , Conformação Molecular , Proteínas Mutantes/agonistas , Proteínas Mutantes/antagonistas & inibidores , Proteínas Mutantes/química , Proteínas Mutantes/metabolismo , Fragmentos de Peptídeos/agonistas , Fragmentos de Peptídeos/antagonistas & inibidores , Fragmentos de Peptídeos/química , Fragmentos de Peptídeos/metabolismo , Domínios e Motivos de Interação entre Proteínas , Pseudomonas aeruginosa/efeitos dos fármacos , Pseudomonas aeruginosa/patogenicidade , Quinolonas/química , Quinolonas/farmacologia , Percepção de Quorum/efeitos dos fármacos , Proteínas Recombinantes/química , Proteínas Recombinantes/metabolismo , Transdução de Sinais/efeitos dos fármacos , Relação Estrutura-Atividade , Fatores de Transcrição/agonistas , Fatores de Transcrição/antagonistas & inibidores , Fatores de Transcrição/química , Virulência/efeitos dos fármacos
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