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1.
Braz. j. biol ; 83: e244311, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | MEDLINE, LILACSEXPRESS | ID: biblio-1285616

RESUMO

Abstract Tuberculosis is a communicable disease with high morbidity and mortality rates in developing countries. The study's primary objective is to compare conventional methods such as acid-fast bacillus (AFB) culture and microscopy with rapid diagnostic methods. The secondary objective is to compare histopathological and microbiological findings in suspected patients with tubercular lymphadenitis. A total of 111 samples (August 2018 to September 2019) of lymph nodes were processed for AFB microscopy, AFB cultures, drug-susceptibility testing (DST), histopathology, and Xpert Mycobacterium Tuberculosis (MTB)/resistance to Rifampin (RIF) assays. Out of 111 lymph node samples, 6 (5.4%) were positive for AFB smear microscopy, 84 (75.6%) were positive for AFB culture, 80 (70.7%) were positive on Gene Xpert, and 102 (91.8%) were indicative of tuberculosis for histopathology studies. Mycobacteria growth indicator tube (MGIT) culture positivity was 84 (75.6%) higher than solid Lowenstein-Jensen (LJ) culture 74 (66.6%). Positive cultures underwent phenotypic DST. Two cases were Multidrug-resistant (MDR) on DST, while three cases were Rifampicin resistant on Gene Xpert. The sensitivity of Genexpert was (62%) against the conventional AFB culture method. The poor performance of conventional lymphadenitis diagnostic methods requires early and accurate diagnostic methodology. Xpert MTB/RIF test can help in the treatment of multidrug-resistant TB cases. Nonetheless, rapid and conventional methods should be used for complete isolation of Mycobacterium tuberculosis.


Resumo A tuberculose é uma doença transmissível com altas taxas de morbimortalidade nos países em desenvolvimento. O objetivo principal do estudo é comparar métodos convencionais, como cultura de bacilo álcool-ácido resistente (BAAR) e microscopia, com métodos de diagnóstico rápido. O objetivo secundário é comparar os achados histopatológicos e microbiológicos em pacientes com suspeita de linfadenite tubercular. Um total de 111 amostras (agosto de 2018 a setembro de 2019) de gânglios linfáticos foi processado ​​para microscopia de AFB, culturas de AFB, teste de susceptibilidade a drogas (DST), histopatologia e Xpert Mycobacterium tuberculosis (MTB)/ensaios de resistência à rifampicina (RIF). Das 111 amostras de linfonodos, 6 (5,4%) foram positivas para baciloscopia de AFB, 84 (75,6%) foram positivas para cultura de AFB, 80 (70,7%) foram positivas para o GeneXpert e 102 (91,8%) foram indicativas de tuberculose para estudos histopatológicos. A positividade da cultura do tubo indicador de crescimento de micobactérias (MGIT) foi 84 (75,6%), maior que a cultura sólida de Lowenstein-Jensen (LJ), 74 (66,6%). As culturas positivas foram submetidas a DST fenotípico. Dois casos eram multirresistentes (MDR) ao DST, enquanto três casos eram resistentes à rifampicina no GeneXpert. A sensibilidade do GeneXpert foi 62% contra o método convencional de cultura AFB. O fraco desempenho dos métodos convencionais de diagnóstico de linfadenite requer metodologia de diagnóstico precoce e precisa. O teste Xpert MTB/RIF pode ajudar no tratamento de casos de tuberculose multirresistente. No entanto, métodos rápidos e convencionais devem ser usados ​​para o isolamento completo do Mycobacterium tuberculosis.

2.
Braz. j. biol ; 83: e247018, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | MEDLINE, LILACSEXPRESS | ID: biblio-1285617

RESUMO

Abstract The Rufous treepie (Dendrocitta vagabunda) belongs to family corvidae, order Passeriformes which includes about 100 species. The current study was conducted to gather information about the Population distribution and habitat analysis of D. vagabunda at District Abbottabad, Pakistan. The data were collected on monthly basis both morning and evening times (2018-2019). "The ''Point count Method" was used for population estimation and ''Quadrates Method" for habitat analysis of study area. The result shows an average month-wise population density of D. vagabunda was maximum at Jhangra 0.14±0.039/ha, whereas minimum at Havelian 0.11±0.022/ha. There was no significant difference (p>0.05) among monthly population densities of D. vagabunda, however, a significant difference (p<0.05) was found between morning and evening times population of the specie. The present study revealed that importance value index (IVI) of plants species at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 59.6±12.6, 50.1±6.9, 53.4±6.3, 66.8±10 and 60.1±7.7. Likewise, the frequency of shrubs at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 33.3±4.2, 45±9.4, 46.7±8.2, 55.6±22.2 and 37.5±8.5. Similarly, the frequency of herbs at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 40.4±6.0, 37.5±5.6, 53.3±7.4, 48.5±5.2 and 46.9±7.4 respectively. Our results show the study area as suitable habitat for D. vagabunda.


Resumo A trepadeira Rufous (Dendrocitta vagabunda) pertence à família corvidae, ordem Passeriformes que inclui cerca de 100 espécies. O estudo atual foi realizado para reunir informações sobre a distribuição da população e análise do habitat de D. vagabunda no distrito de Abbottabad, Paquistão. Os dados foram coletados mensalmente pela manhã e à noite (2018-2019). O "método de contagem de pontos" foi usado para estimativa da população e o "método dos quadrados" para análise de habitat da área de estudo. O resultado mostra que uma densidade populacional média mensal de D. vagabunda foi máxima em Jhangra 0,14 ± 0,039 / ha, enquanto a mínima em Havelian 0,11 ± 0,022/ha. Não houve diferença significativa (p> 0,05) entre as densidades populacionais mensais de D. vagabunda, entretanto foi encontrada diferença significativa (p <0,05) entre os períodos matutino e noturno da população da espécie. O presente estudo revelou que o índice de valor de importância (IVI) das espécies de plantas em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi de: 59,6 ± 12,6, 50,1 ± 6,9, 53,4 ± 6,3, 66,8 ± 10 e 60,1 ± 7,7. Da mesma forma, a frequência de arbustos em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi de: 33,3 ± 4,2, 45 ± 9,4, 46,7 ± 8,2, 55,6 ± 22,2 e 37,5 ± 8,5. Da mesma forma, a frequência de ervas em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi: 40,4 ± 6,0, 37,5 ± 5,6, 53,3 ± 7,4, 48,5 ± 5,2 e 46,9 ± 7,4, respectivamente. Nossos resultados mostram a área de estudo como habitat adequado para D. vagabunda.

3.
Braz. j. biol ; 83: e251004, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | MEDLINE, LILACSEXPRESS | ID: biblio-1339339

RESUMO

Abstract The supplementation of Selenium-enriched probiotics is effective in reducing oxidative stress and maintaining meat quality stability in broiler chicken especially under heat stress. An experimental study was conducted to perform Comparative analysis of Selenium yeast with inorganic Se in broilers under heat stress. A total of 120 broilers chicks of one day were assigned to 4 groups each consisting 30 chicks fed on same basal diet but different selenium sources. The basal diet of group D1 was not supplemented with Se source (Negative control), group D2 basal diet was supplemented with inorganic selenium (Sodium selenite 0.22mg/Kg starter phase and 0.15mg/Kg finisher phase), group D3 basal diet was supplemented with commercially available organic selenium (Seleno-methionine 0.22mg/Kg starter phase and 0.15mg/Kg finisher phase) and group D4 basal diet was supplemented with self-developed organic selenium (Se-enriched yeast 0.22mg/Kg starter phase and 0.15mg/Kg finisher phase). The performance parameters i.e. feed intake (FI), live body weight (BW) and FCR were not significantly (p>0.05) effected by selenium supplementation in the starter phase but were significantly (p<0.05) effected in the finisher phase. Selenium supplementation significantly (p<0.05) effected serum Se level in different supplemented groups. Higher serum Se value (58.20±0.06) was recorded in D4 group. Similarly significantly lower selenium value was recorded for D4 and higher was recorded for D1 (11.36±0.08). However lower serum Paraoxonase (PON) value was recorded for D4 (13.24±0.01) and higher for D1 (13.33±0.03). Comparatively self-developed Se enriched yeast increased the Se accumulation and improved antioxidant system. Glutathione peroxidase (GPx) was found higher in D4 (12.333±0.03) followed by D3, D2 and D1 respectively. Whereas superoxide dismutase (SOD) was significantly lower (p<0.05) in D4 (0.1437±0.003) followed by D3 (0.1457±0.002). Selenium supplementation increased the bird's survival rate. Birds fed on Se enriched yeast showed higher Se deposition and better antioxidant capacity as compared to other sources of selenium. Se-enriched yeast displayed an improved result on Se deposition in tissues, and oxidative capacity, meat tenderness and immune response level as compared to other sources of selenium.


Resumo A suplementação de probióticos enriquecidos com selênio é eficaz na redução do estresse oxidativo e na manutenção da estabilidade da qualidade da carne em frangos de corte, especialmente sob estresse por calor. Um estudo experimental foi conduzido para realizar uma análise comparativa da levedura selênio com o Se inorgânico em frangos de corte sob estresse térmico. Um total de 120 pintos de um dia foi dividido em 4 grupos, cada um consistindo de 30 pintos alimentados com a mesma dieta basal, mas com diferentes fontes de selênio. A dieta basal do grupo D1 não foi suplementada com fonte de Se (controle negativo), a dieta basal do grupo D2 foi suplementada com selênio inorgânico (selenito de sódio 0,22 mg / kg fase inicial e 0,15 mg / kg fase finalizadora), a dieta basal do grupo D3 foi suplementada com selênio orgânico disponível comercialmente (fase inicial de seleno-metionina 0,22 mg / kg e fase finalizadora de 0,15 mg / kg) e a dieta basal do grupo D4 foi suplementada com selênio orgânico autodesenvolvido (fermento enriquecido com Se 0,22 mg / kg fase inicial e 0,15 mg / kg fase finalizadora). Os parâmetros de desempenho, ou seja, consumo de ração (FI), peso corporal vivo (PC) e FCR não foram significativamente (p > 0,05) afetados pela suplementação de selênio na fase inicial, mas foram significativamente (p < 0,05) afetados na fase final. A suplementação de selênio afetou significativamente (p < 0,05) o nível de Se sérico em diferentes grupos suplementados. O maior valor de Se sérico (58,20 ± 0,06) foi registrado no grupo D4. Da mesma forma, valor de selênio significativamente menor foi registrado para D4 e maior foi registrado para D1 (11,36 ± 0,08). No entanto, um valor mais baixo de Paraoxonase (PON) sérica foi registrado para D4 (13,24 ± 0,01) e mais alto para D1 (13,33 ± 0,03). A levedura enriquecida com Se comparativamente autodesenvolvida aumentou o acúmulo de Se e melhorou o sistema antioxidante. A glutationa peroxidase (GPx) foi encontrada maior em D4 (12,333 ± 0,03) seguido por D3, D2 e ​​D1 respectivamente. Enquanto a superóxido dismutase (SOD) foi significativamente menor (p < 0,05) em D4 (0,1437 ± 0,003) seguido por D3 (0,1457 ± 0,002). A suplementação de selênio aumentou a taxa de sobrevivência da ave. Aves alimentadas com levedura enriquecida com Se apresentaram maior deposição de Se e melhor capacidade antioxidante em comparação com outras fontes de selênio. A levedura enriquecida com Se apresentou um resultado melhorado na deposição de Se nos tecidos, capacidade oxidativa, maciez da carne e nível de resposta imune em comparação com outras fontes de selênio.

4.
Braz. j. biol ; 83: e252059, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | MEDLINE, LILACSEXPRESS | ID: biblio-1339358

RESUMO

Abstract The present study describes the haematological profile, feeding preference, and comparison of morphometric characters of blue rock pigeon (Columba livia) breeding pairs. For this purpose, 25 pairs (25 samples per sex) were sampled through Mist nets from district Okara and Bahawalnagar, Punjab, Pakistan. Birds were then anaesthetized with a combination of ketamine HCL (10 mg/kg) and diazepam (0.2 mg/kg) and subjected to morphometric measurements. 5µL blood also was taken from the jugular vein of each anaesthetized bird for haematological analysis. Few pairs were also dissected to remove gastrointestinal tracts (GITs) for food preferences. Results revealed that there are no significant differences in the haematological parameters and feeding preference of breeding pairs of Columba livia. The gut analysis further revealed, the major portion of gut contents consisted of pea and corn in most of the pairs. Regarding the mensural measurements, significant differences were recorded in the body weight, length of the longest primary feather, and chest circumference, whereas the rest of the studied parameters remain nonsignificant between sexes. So, it is concluded that apart from 3 morphometric parameters (body weight, length of longest primary feather and chest circumference), both sexes are alike in term of morphometry, haematology and food preference.


Resumo O presente estudo descreve o perfil hematológico, a preferência alimentar e a comparação de caracteres morfométricos de casais reprodutores de pombo-rocha (Columba livia). Para tanto, 25 pares (25 amostras por sexo) foram amostrados por meio de redes de névoa do distrito de Okara e Bahawalnagar, Punjab, Paquistão. As aves foram então anestesiadas com uma combinação de cetamina HCL (10 mg/kg) e diazepam (0,2 mg/kg) e submetidas a medidas morfométricas; 5 µL de sangue também foram retirados da veia jugular de cada ave anestesiada para análise hematológica. Poucos pares também foram dissecados para remover o trato gastrointestinal (GITs) para preferências alimentares. Os resultados revelaram que não há diferenças significativas nos parâmetros hematológicos e na preferência alimentar dos casais reprodutores de Columba livia. A análise intestinal revelou ainda que a maior parte do conteúdo intestinal consistia em ervilha e milho na maioria dos pares. Em relação às medidas mensurais, foram registradas diferenças significativas no peso corporal, comprimento da pena primária mais longa e circunferência torácica, enquanto os demais parâmetros estudados permanecem não significativos entre os sexos. Assim, conclui-se que além de três parâmetros morfométricos (peso corporal, comprimento da pena primária mais longa e circunferência torácica), ambos os sexos são semelhantes em termos de morfometria, hematologia e preferência alimentar.

5.
Braz. j. biol ; 83: e247604, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | MEDLINE, LILACSEXPRESS | ID: biblio-1339370

RESUMO

Abstract In the current report, we studied the possible inhibitors of COVID-19 from bioactive constituents of Centaurea jacea using a threefold approach consisting of quantum chemical, molecular docking and molecular dynamic techniques. Centaurea jacea is a perennial herb often used in folk medicines of dermatological complaints and fever. Moreover, anticancer, antioxidant, antibacterial and antiviral properties of its bioactive compounds are also reported. The Mpro (Main proteases) was docked with different compounds of Centaurea jacea through molecular docking. All the studied compounds including apigenin, axillarin, Centaureidin, Cirsiliol, Eupatorin and Isokaempferide, show suitable binding affinities to the binding site of SARS-CoV-2 main protease with their binding energies -6.7 kcal/mol, -7.4 kcal/mol, -7.0 kcal/mol, -5.8 kcal/mol, -6.2 kcal/mol and -6.8 kcal/mol, respectively. Among all studied compounds, axillarin was found to have maximum inhibitor efficiency followed by Centaureidin, Isokaempferide, Apigenin, Eupatorin and Cirsiliol. Our results suggested that axillarin binds with the most crucial catalytic residues CYS145 and HIS41 of the Mpro, moreover axillarin shows 5 hydrogen bond interactions and 5 hydrophobic interactions with various residues of Mpro. Furthermore, the molecular dynamic calculations over 60 ns (6×106 femtosecond) time scale also shown significant insights into the binding effects of axillarin with Mpro of SARS-CoV-2 by imitating protein like aqueous environment. From molecular dynamic calculations, the RMSD and RMSF computations indicate the stability and dynamics of the best docked complex in aqueous environment. The ADME properties and toxicity prediction analysis of axillarin also recommended it as safe drug candidate. Further, in vivo and in vitro investigations are essential to ensure the anti SARS-CoV-2 activity of all bioactive compounds particularly axillarin to encourage preventive use of Centaurea jacea against COVID-19 infections.


Resumo No presente relatório, estudamos os possíveis inibidores de Covid-19 de constituintes bioativos de Centaurea jacea usando uma abordagem tripla que consiste em técnicas de química quântica, docking molecular e dinâmica molecular. Centaurea jacea é uma erva perene frequentemente usada em remédios populares de doenças dermatológicas e febre. Além disso, as propriedades anticâncer, antioxidante, antibacteriana e antiviral de seus compostos bioativos também são relatadas. A Mpro (proteases principais) foi acoplada a diferentes compostos de Centaurea jacea por meio de docking molecular. Todos os compostos estudados, incluindo apigenina, axilarina, Centaureidina, Cirsiliol, Eupatorina e Isokaempferide, mostram afinidades de ligação adequadas ao sítio de ligação da protease principal SARS-CoV-2 com suas energias de ligação -6,7 kcal / mol, -7,4 kcal / mol, - 7,0 kcal / mol, -5,8 kcal / mol, -6,2 kcal / mol e -6,8 kcal / mol, respectivamente. Dentre todos os compostos estudados, a axilarina apresentou eficiência máxima de inibidor, seguida pela Centaureidina, Isokaempferida, Apigenina, Eupatorina e Cirsiliol. Nossos resultados sugeriram que a axilarina se liga aos resíduos catalíticos mais cruciais CYS145 e HIS41 do Mpro, além disso a axilarina mostra 5 interações de ligações de hidrogênio e 5 interações hidrofóbicas com vários resíduos de Mpro. Além disso, os cálculos de dinâmica molecular em uma escala de tempo de 60 ns (6 × 106 femtossegundos) também mostraram percepções significativas sobre os efeitos de ligação da axilarina com Mpro de SARS-CoV-2 por imitação de proteínas como o ambiente aquoso. A partir de cálculos de dinâmica molecular, os cálculos RMSD e RMSF indicam a estabilidade e dinâmica do melhor complexo ancorado em ambiente aquoso. As propriedades ADME e a análise de previsão de toxicidade da axilarina também a recomendaram como um candidato a medicamento seguro. Além disso, as investigações in vivo e in vitro são essenciais para garantir a atividade anti-SARS-CoV-2 de todos os compostos bioativos, particularmente a axilarina, para encorajar o uso preventivo de Centaurea jacea contra infecções por Covid-19.

6.
Braz. j. biol ; 83: e240842, 2023. tab
Artigo em Inglês | LILACS-Express | MEDLINE, LILACSEXPRESS | ID: biblio-1339375

RESUMO

Abstract This research aimed to investigate various mosquitocidal activities of Chenopodium botrys whole- plant n-hexane extract against Culex quinquefasciatus. The extract showed remarkable larvicidal, pupicidal, adulticidal, oviposition deterrent and adult emergence inhibitory activities against Cx. quinquefasciatus. During the larvicidal and pupicidal activities, the 24-hour lethal concentration (LC50) of extract against 2nd instar larvae, 4th instar larvae and pupae were 324.6, 495.6 and 950.8 ppm, respectively. During the CDC (Centers for Disease Control and Prevention) bottle bioassay for adulticidal activity, the median knockdown times (KDT50) at 1.25% concentration was 123.4 minutes. During the filter paper impregnation bioassay for adulticidal activity, the KDT50 value at 0.138 mg/cm2 concentration was 48.6 minutes. The extract was fractionated into 14 fractions through silica gel column chromatography which were then combined into six fractions on the basis of similar retention factor (Rf) value. These fractions were screened for adulticidal activity by applying CDC bottle bioassay. The fraction obtained through 60:40 to 50:50% n-hexanes-chloroform mobile phase with 0.5 Rf value showed 100% adulticidal activity at 0.2% concentration. During oviposition deterrent activity, the highest concentration (1000 ppm) showed 71.3 ± 4.4% effective repellence and 0.6 ± 0.1 oviposition activity index. During adult emergence inhibition activity, the median emergence inhibition (EI50) value was 312.3 ppm. From the outcome of the present investigation, it is concluded that the n-hexane extract of C. botrys whole- plant possesses strong larvicidal, pupicidal, adulticidal, oviposition deterrent and adult emergence inhibitory activities against Cx. quinquefasciatus.


Resumo Esta pesquisa teve como objetivo investigar várias atividades mosquitocidas do extrato n-hexano de planta inteira de Chenopodium botrys contra Culex quinquefasciatus. O extrato mostrou atividades larvicida, pupicida, adulticida, dissuasora de oviposição e inibidora da emergência de adultos contra a Cx. quinquefasciatus. Durante as atividades larvicida e pupicida, a concentração letal de 24 horas (CL50) do extrato contra larvas de 2º estádio, larvas de 4º estádio e pupa foi de 324,6, 495,6 e 950,8 ppm, respectivamente. Durante o bioensaio com frasco do CDC (Centros para Controle e Prevenção de Doenças) para adulticida, o tempo médio de desativação (KDT50) na concentração de 1,25% foi de 123,4 minutos. Durante o bioensaio de impregnação com papel de filtro para a atividade adulticida do extrato, o valor KDT50 na concentração de 0,138 mg / cm2 foi de 48,6 minutos. O extrato foi fracionado em 14 frações através de cromatografia em coluna de gel de sílica que foram então combinadas em seis frações com base em um valor de fator de retenção (Rf) semelhante. Essas frações foram selecionadas quanto à atividade adulticida por meio da aplicação do bioensaio com garrafa do CDC. A fração obtida através da fase móvel de n-hexanos-clorofórmio 60:40% a 50:50% com valor de 0,5 Rf apresentou atividade adulticida de 100% na concentração de 0,2%. Durante a atividade de dissuasão da oviposição, a maior concentração de extrato (1000 ppm) apresentou repelência efetiva de 71,3 ± 4,4% e índice de atividade de oviposição de 0,6 ± 0,1. Durante a atividade de inibição da emergência de adultos, o valor médio de inibição da emergência (EI50) foi de 312,3 ppm. A partir do resultado da presente investigação, conclui-se que o extrato de n-hexano da planta inteira de C. botrys possui fortes atividades larvicida, pupicida, adulticida, dissuasora da oviposição e inibidora da emergência de adultos contra a Cx. quinquefasciatus.

7.
Braz. j. biol ; 83: e247237, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | MEDLINE, LILACSEXPRESS | ID: biblio-1339386

RESUMO

Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.


Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

8.
Braz. j. biol ; 83: e249104, 2023. tab
Artigo em Inglês | LILACS-Express | MEDLINE, LILACSEXPRESS | ID: biblio-1339389

RESUMO

Abstract The present study was designed to evaluate the strength of association of raised plasma homocysteine concentration as a risk factor for coronary heart disease independent of conventional risk factor. It was a case control study conducted at Punjab Institute of Cardiology Lahore. A total of 210 subjects aged 25 to 60 years comprising of 105 newly admitted patients of CHD as cases and 105 age and sex matched healthy individuals with no history of CHD as control were recruited for the study. Fasting blood samples were obtained from cases and controls. Plasma homocysteine was analyzed by fluorescence polarization immunoassay (FPIA) method on automated immunoassay analyzer (Abbott IMX). Total cholesterol, triglyceride and HDL cholesterol were analyzed using calorimetric kit methods. The concentration of LDL cholesterol was calculated using Friedewald formula. The patients were also assessed for traditional risk factors such as age, sex, family history of CVD, hypertension, smoking and physical activity, and were compared with control subjects. The collected data was entered in SPSS version 24 for analysis and interpretation.The mean age in controls and experimental groups were 43.00± 8.42 years and 44.72± 8.59 years with statistically same distribution (p- value= 0.144). The mean plasma homocysteine for cases was 22.33± 9.22 µmol/L where as it was 12.59±3.73 µmol/L in control group. Highly significant difference was seen between the mean plasma level of homocysteine in cases and controls (p˂0.001).Simple logistic regression indicates a strong association of coronary heart disease with hyperhomocysteinemia (OR 7.45), which remained significantly associated with coronary heart disease by multivariate logistic regression (OR 7.10, 95%C1 3.12-12.83, p=0.000). The present study concludes that elevated levels of Plasma homocysteine is an independent risk factor for coronary heart disease independent of conventional risk factors and can be used as an indicator for predicting the future possibility for the onset of CVD.


Resumo O presente estudo foi desenhado para avaliar a força da associação da concentração elevada de homocisteína no plasma como um fator de risco para doença cardíaca coronária independente do fator de risco convencional. Foi um estudo de caso-controle realizado no Punjab Institute of Cardiology Lahore. Um total de 210 indivíduos com idade entre 25 e 60 anos, compreendendo 105 pacientes recém-admitidos de CHD como casos e 105 indivíduos saudáveis ​​pareados por idade e sexo sem histórico de CHD como controle, foi recrutado para o estudo. Amostras de sangue em jejum foram obtidas de casos e controles. A homocisteína plasmática foi analisada pelo método de imunoensaio de polarização de fluorescência (FPIA) em analisador de imunoensaio automatizado (Abbott IMX). Colesterol total, triglicerídeos e colesterol HDL foram analisados ​​usando métodos de kit calorimétrico. A concentração de colesterol LDL foi calculada pela fórmula de Friedewald. Os pacientes também foram avaliados para fatores de risco tradicionais, como idade, sexo, história familiar de DCV, hipertensão, tabagismo e atividade física, e foram comparados com indivíduos de controle. Os dados coletados foram inseridos no SPSS versão 24 para análise e interpretação. A média de idade nos grupos controles e experimentais foi de 43,00 ± 8,42 anos e 44,72 ± 8,59 anos com distribuição estatisticamente igual (p-valor = 0,144). A homocisteína plasmática média para os casos foi de 22,33 ± 9,22 µmol / L, enquanto no grupo controle foi de 12,59 ± 3,73 µmol / L. Diferença altamente significativa foi observada entre o nível plasmático médio de homocisteína em casos e controles (p ˂ 0,001). A regressão logística simples indica uma forte associação de doença cardíaca coronária com hiper-homocisteinemia (OR 7,45), que permaneceu significativamente associada com doença cardíaca coronária por multivariada regressão logística (OR 7,10, 95% C1 3,12-12,83, p = 0,000). O presente estudo conclui que níveis elevados de homocisteína plasmática são fator de risco independente para doença cardíaca coronária, independentemente dos fatores de risco convencionais, e pode ser usado como um indicador para prever a possibilidade futura de aparecimento de DCV.

9.
Braz. j. biol ; 83: e250402, 2023. tab
Artigo em Inglês | LILACS-Express | MEDLINE, LILACSEXPRESS | ID: biblio-1339404

RESUMO

Abstract We have evaluated the effects of different fish feeds on the body composition, growth, and enzyme activities of Labeo rohita (Rohu). In total, 240 fishes between the average weights of 24.77±2.15g were studied. The treatments were applied in a completely randomized design, with 4 treatments of 60 fishes each. Treatments consisted of four different fish feeds [Oryza (T1), AMG (T2), Aqua (T3), and Supreme (T4)]. Body composition, growth performance, and enzyme activities were evaluated. There was a significant variation in performance of fishes fed with different type of feed; as fishes having Oryza feed showed the highest weight gain, specific growth rate (SGR), and best feed conversion ratio (FCR) as compared to other groups that were considered to be significant (P ≤ 0.05). High net weight gain was obtained in T4 when compared with T2 and T3. FCR value of T4 was less than T1 but higher than T2, T3 and T2, which showed the lowest values. The specific growth rate was recorded as average in T4, but T2 led a high SGR than T3. Similarly, crude protein level and digestive enzymes activity was recorded significantly highest in fed with Oryza (T1) as compared to AMG (T2), Aqua (T3), and Supreme (T4). Water quality parameters were recorded significant in all treatments except pH and DO of treatment (T1), significantly different from other treatments. It was concluded that Rohu (Labeo rohita) could show a promising growth rate and protease enzyme activity when fed with the Oryza feed of 25% protein.


Resumo Avaliamos os efeitos de diferentes alimentos para peixes em relação à composição corporal, crescimento e atividades enzimáticas de Labeo rohita (Rohu). No total, foram estudados 240 peixes com pesos médios de 24,77 ± 2,15 g. Os tratamentos foram aplicados em delineamento inteiramente casualizado, com quatro tratamentos de 60 peixes cada. Os tratamentos consistiram em quatro alimentos diferentes para peixes: Oryza (T1), AMG (T2), Aqua (T3) e Supreme (T4). Foram avaliados a composição corporal, o desempenho de crescimento e as atividades enzimáticas. Houve uma variação significativa no desempenho dos peixes alimentados com diferentes tipos de ração. Peixes com alimentação Oryza apresentaram maior ganho de peso, taxa de crescimento específico (SGR) e melhor taxa de conversão alimentar (FCR) em comparação com outros grupos que foram considerados significativos (P ≤ 0,05). Elevado ganho de peso líquido foi obtido em T4 quando comparado com T2 e T3. O valor da FCR de T4 foi menor que T1, mas maior que T2 e T3, que apresentaram os menores valores. A taxa de crescimento específico foi registrada como média em T4, mas T2 teve uma SGR alta do que T3. Da mesma forma, o nível de proteína bruta e a atividade das enzimas digestivas foram registrados significativamente mais altos nos peixes alimentados com Oryza (T1) em comparação com AMG (T2), Aqua (T3) e Supreme (T4). Os parâmetros de qualidade da água foram registrados como significativos em todos os tratamentos, exceto pH e OD do tratamento (T1), significativamente diferente dos demais tratamentos. Concluiu-se que Rohu (Labeo rohita) pode apresentar uma taxa de crescimento promissora e atividade da enzima protease quando alimentado com Oryza de 25% de proteína.

10.
Braz. j. biol ; 83: e245585, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | MEDLINE, LILACSEXPRESS | ID: biblio-1339413

RESUMO

Abstract Many soil microorganisms' i.e., bacteria and fungi produce secondary metabolites called antibiotics. These are used for the treatment of some of the bacterial, fungal and protozoal diseases of humans. There is a need for isolation of a broad spectrum of antibiotics from microorganisms due to the emergence of antibiotic resistance. In the present study two antibiotic producing bacteria Klebsiella pneumoniae and Bacillus cereus were isolated from pharmaceutical and poultry feed industry of Hattar, Haripur Pakistan. Total 10 waste samples were collected from different industries (Marble, Ghee, Soap, Mineral, Steel, Poultry Feed, Pharmaceutical, Qarshi, Cosmetic and Glass). Thirty-three bacterial strains were isolated from industrial wastes of these ten different industries. Fourteen out of thirty-three bacterial strains exhibited antimicrobial activities against at least one of the test microbes considered in this study including Escherchia coli, Staphylococcus aureus and Salmonella typhi. The bacteria were isolated by standard serial dilution spread plate technique. Morphological characterization of the isolates was done by Gram staining. Nine bacterial isolates out of fourteen were initially identified as B. cereus and five as K. pneumoniae through biochemical characterization. The antibacterial activities were tested by well diffusion method. Maximum number of antibiotic producing bacteria were isolated from pharmaceutical and poultry feed industry based on the results of primary screening, the most potential isolates S9, S19, S20, S22 and S23 were selected for secondary screening. The maximum activity against E. coli and S. aureus was recorded by bacterial isolate S19 i.e zones of inhibition of 6.5mm and 9mm while S20 showed 7.5mm and 6mm zones respectively. Molecular identification was carried out on the basis of 16S rRNA sequence analysis. Finally, the isolates were identified as B. cereus accession number LC538271and K. pneumoniae accession number MT078679. Analysis of bacterial extract S20 through GC-MS indicated the presence of 8 compounds of diverse nature and structure. Present study suggests that wastes of pharmaceutical and poultry feed industry may have antibiotic producing bacteria. These bacteria could be utilized for the production of antibiotics. B. cereus and K. pneumoniae isolated from wastes of poultry feed and pharmaceutical industries have the potential to produce antibiotics and could be used to control the microbial growth.


Resumo Muitos microrganismos do solo, ou seja, bactérias e fungos produzem metabólitos secundários chamados antibióticos. Eles são usados ​​para tratamento de algumas doenças bacterianas, fúngicas e protozoárias em humanos. Há necessidade de isolamento de um amplo espectro de antibióticos de microrganismos devido ao surgimento de resistência aos antibióticos. No presente estudo, duas bactérias produtoras de antibióticos, Klebsiella pneumoniae e Bacillus cereus, foram isoladas da indústria farmacêutica e de ração avícola de Hattar, Haripur, Paquistão. Um total de 10 amostras de resíduos foi coletado de diferentes indústrias (mármore, ghee, sabão, mineral, aço, ração para aves, farmacêutica, Qarshi, cosmética e vidro). Trinta e três cepas bacterianas foram isoladas de resíduos industriais dessas dez diferentes indústrias. Quatorze das 33 cepas bacterianas exibiram atividades antimicrobianas contra pelo menos um dos micróbios de teste considerados neste estudo, incluindo Escherchia coli, Staphylococcus aureus e Salmonella typhi. As bactérias foram isoladas pela técnica de placa de diluição em série padrão. A caracterização morfológica dos isolados foi feita por coloração de gram. Nove isolados bacterianos de 14 foram inicialmente identificados como B. cereus e cinco como K. pneumoniae por meio de caracterização bioquímica. As atividades antibacterianas foram testadas pelo método de difusão em poço. O número máximo de bactérias produtoras de antibióticos foi isolado da indústria farmacêutica e de ração avícola com base nos resultados da triagem primária, os isolados mais potenciais S9, S19, S20, S22 e S23 foram selecionados para a triagem secundária. A atividade máxima contra E. coli e S. aureus foi registrada pelo isolado bacteriano S19, ou seja, zonas de inibição de 6,5 mm e 9 mm, enquanto S20 mostrou zonas de 7,5 mm e 6 mm, respectivamente. A identificação molecular foi realizada com base na análise da sequência 16S rRNA. Finalmente, os isolados foram identificados como B. cereus número de acesso LC538271 e K. pneumoniae número de acesso MT078679. A análise do extrato bacteriano S20 por meio de GC-MS indicou a presença de oito compostos de natureza e estrutura diversas. O presente estudo sugere que resíduos da indústria farmacêutica e de ração para aves podem conter bactérias produtoras de antibióticos. Essas bactérias podem ser utilizadas para a produção de antibióticos B. cereus e K. pneumoniae isolados de resíduos de rações de aves e indústrias farmacêuticas têm potencial para produzir antibióticos e podem ser usados ​​para controlar o crescimento microbiano.

11.
Chemosphere ; 287(Pt 2): 132142, 2022 Jan.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34826894

RESUMO

Green synthesis of nanoparticles (NPs) is competent in inducing physiological responses in plants for combating the abiotic stresses. Considering this, salt stress is one of the most alarming conditions that exerts complex and polygenic impacts on morph-physiological functioning of plants; resulting in reduced crop productivity and yield. Therefore, understanding the salt responses and tolerance mechanisms are important for sustaining crop productivity. In the current study, we have examined the effects of biosynthesized gold nanoparticles (AuNPs) on wheat (Triticum aestivum) plants under salt stress. Green-synthesized AuNPs were found beneficial in modulating the K+/Na+ ratio, chlorophyll concentration, defense systems, nitrogen assimilation, stomatal dynamics and growth traits under salt stress condition. Furthermore, the excessive accumulation of oxidative stress markers including reactive oxygen/nitrogen species was controlled in response of AuNPs treatment under salt stress. Overall, modulation of these traits commanded to induce salt stress tolerance in wheat plants.


Assuntos
Nanopartículas Metálicas , Triticum , Ouro , Íons , Nanopartículas Metálicas/toxicidade , Óxido Nítrico , Nitrogênio , Estresse Salino , Estresse Fisiológico
12.
Chemosphere ; 287(Pt 1): 132048, 2022 Jan.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34478961

RESUMO

Exposure to dust particles enriched with arsenic (As) is a significant health threat for populations living in Southeast Asian megacities. The mineralogical composition of dust particles is the key factor that controls the retention and release of As. This study investigated the degree of metal(oid)s pollution (As, Ca, Fe, K, Ga, Rb, Sr, Ti, V, Y, and Zr) in road dust of Dhaka city, Bangladesh. Enrichment factor and geoaccumulation index suggested that the road dust was heavily enriched with As, which triggers a comprehensive investigation of its controlling mechanisms and potential health risks by combining physicochemical and mineralogical information with multivariate analysis and a simulated probabilistic risk estimation model. Alkaline road dust (pH1:5 ranges from 8.02 to 10.34) in Dhaka city was found to have significant enrichment of As. Dust alkalinity was possibly controlled by the presence of carbonate minerals, such as calcite. Quartz was identified as the dominant mineral phase followed by magnesium carbon arsenide (MgCAs2). Carbonate mineral driven alkaline pH conditions in road dust would potentially trigger the release and mobilization of As to the environment. However, organic complexation can stabilize As on particle surfaces. Monte Carlo simulation-based health risk forecast suggested that the probability of As associated cancer risk has greatly exceeded the threshold value of 1E-4 for adults and children, and children are more vulnerable than adults. According to sensitivity analysis, the concentration of As and exposure duration (ED) posed the most significant impact (>58%) on risk estimation.


Assuntos
Arsênio , Metais Pesados , Adulto , Bangladesh , Criança , Cidades , Poeira/análise , Monitoramento Ambiental , Humanos , Metais Pesados/análise , Medição de Risco
13.
Braz. j. biol ; 82: e238769, 2022. tab
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1249232

RESUMO

Abstract Illnesses caused by human pinworm remains a pediatric health problem in developing nations including Pakistan. This study aimed to investigate the prevalence of Enterobius vermicularis in school children of four districts in Malakand region, Pakistan. Four hundred faecal specimens were screened from May 2014 to July 2017 using normal saline and Lugol Iodine solution. Twenty three (5.75%) individuals were found infected with E. vermicularis. Five children (1.25%) were infected with only E. vermicularis and eighteen (4.5%) were mixed with other helminths. E. vermicularis 23 (5.75%), hookworm 11 (2.75%), Ascaris lumbricoides 5 (1.25%), Taenia saginata 2 (0.5%) and Trichuris trichuira 4 (1%) were detected. Age wise 5-8 years were more parasitized followed by 13-15 and 9-12 years of age (0.0296, P<0.05). Male children were highly (0.06700, P<0.05) infected than female. Children in Malakand district were found more infected followed by Dir Upper, similar infection rate was noted in children of districts Lower Dir and Swat (0.0192, P<0.05). Children in primary level were highly (0.0013, P<0.05) infected than those of middle and high levels. Enterobiosis is still the most common parasitic diseases in children. Studies on enterobiosis should be conducted time by time to recognize the hazardous of such parasitic infection in remote areas of the country.


Resumo As doenças causadas pela traça humana continuam sendo um problema de saúde pediátrica nos países em desenvolvimento, incluindo o Paquistão. Este estudo teve como objetivo investigar a prevalência de Enterobius vermicularis em escolares de quatro distritos na região de Malakand, Paquistão. Quatrocentos espécimes fecais foram selecionados de maio de 2014 a julho de 2017, usando solução salina normal e solução de lugol iodo. Vinte e três (5,75%) indivíduos foram encontrados infectados por E. vermicularis. Cinco crianças (1,25%) foram infectadas apenas com E. vermicularis e dezoito (4,5%) foram misturadas com outros helmintos. Foram detectados E. vermicularis 23 (5,75%), ancilóstomo 11 (2,75%), Ascaris lumbricoides 5 (1,25%), Taenia saginata 2 (0,5%) e Trichuris trichuira 4 (1%). Com relação à idade, 5-8 anos foram mais parasitados, seguidos por 13-15 e 9-12 anos de idade (0,0296, P <0,05). Crianças do sexo masculino foram altamente (0,06700, P <0,05) infectadas do que as do sexo feminino. As crianças no distrito de Malakand foram encontradas mais infectadas, seguidas por Dir Upper, taxa de infecção semelhante foi observada em crianças dos distritos Lower Dir e Swat (0,0192, P <0,05). As crianças do nível primário foram altamente (0,0013, P <0,05) infectadas do que as dos níveis médio e alto. A enterobiose ainda é a doença parasitária mais comum em crianças. Os estudos sobre enterobiose devem ser conduzidos periodicamente para reconhecer a periculosidade dessa infecção parasitária em áreas remotas do país.

14.
Braz. j. biol ; 82: e225092, 2022. graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1249256

RESUMO

Abstract A new species of the genus Lutziella (Rohde, 1966) Yamaguti, 1971 is described here and named Lutziella swatensis sp.nov. from the liver of rat (Rattus rattus L.). The new species is characterized by having body flat, smooth, longer than broad with maximum width at the level of the ovary, oral sucker with weak musculature, pharynx small; eosophagus long; caeca of irregular shape which bifurcate on the anterior border of the ovary in to unequal portions, acetabulum weakly muscular, post-testicular, testes lobed, cirrus pouch somewhat median, small in size containing winding seminal vesicle, prostatic complex and short ejaculatory duct. Genital pore median. Ovary post testicular, submedian; seminal receptacle overlapping ovary, laurer's canal present. Vitellaria follicular extending on each side from almost the level of testes to anterior portion of posterior half of the body. Uterus filled with eggs occupying most of the body, eggs oval rather small, numerous, brownish in colour, excretory vesicle tubular with terminal pore. Lutziella swatensis n. sp. is the second species of the genus known from Pakistan as well as the second species described from murid rodents in the world.


Resumo Uma nova espécie do gênero Lutziella (Rohde, 1966) Yamaguti, 1971 é descrita aqui e denominada Lutziella swatensis sp.nov. do fígado do rato (Rattus rattus L.). A nova espécie é caracterizada por ter corpo liso, liso, mais longo que largo com largura máxima ao nível do ovário, otário oral com musculatura débil, faringe pequena; eosôfago longo; ceco de forma irregular que se bifurca na borda anterior do ovário em porções desiguais, acetábulo fracamente muscular, pós-testicular, testículos lobados, bolsa cirrus um pouco mediana, pequeno em tamanho contendo vesícula seminal sinuosa, complexo prostático e ducto ejaculatório curto. Mediana dos poros genitais. Ovário pós testicular, submediano; ovário sobreposto do receptáculo seminal, canal de laurer presente. Vitellaria folicular que se estende de cada lado de quase o nível dos testículos para a porção anterior da metade posterior do corpo. Útero cheio de ovos que ocupam a maior parte do corpo, oval ovos bastante pequenos, numerosos, de cor acastanhada, vesícula excretor tubular com poro terminal. Lutziella swatensis n. sp. é a segunda espécie do gênero conhecida do Paquistão, bem como a segunda espécie descrita de roedores do mundo.

15.
Braz. j. biol ; 82: e243633, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1249273

RESUMO

Abstract Snow trout (Schizothorax plagiostomus) is an economically important freshwater fish, mostly found in northern areas of water reservoirs of Pakistan. The current study was conducted in River Swat to analyze the bioaccumulation of heavy metals (Pb, Cr, Ni, and Zn) in tissues of Schizothorax plagiostomus. Tissues were extracted and dissolved in perchloric acid (HClO4) and nitric acid (HNO3) along with hotplate. The heavy metals, zinc (Zn), lead (Pb), chromium (Cr), and Nickel (Ni) were determined using Perkin Elmer 2380 atomic absorption spectrophotometer. Results shows great variation in the content of the metal related to tissue type and sampling sites. A high concentration of bioaccumulation was reported at Charbagh, whereas lowest at Odigram: Charbagh>Landakai>Odigram. In the same way, Cr was the most accumulated heavy metal followed by lead, nickel, and Zinc:


Resumo A truta das neves (Schizothorax plagiostomus) é um peixe de água doce economicamente importante, encontrado principalmente nas áreas ao norte de reservatórios de água do Paquistão. O presente estudo foi realizado em River Swat para analisar a bioacumulação de metais pesados (Pb, Cr, Ni e Zn) em tecidos de Schizothorax plagiostomus. Os tecidos foram extraídos e dissolvidos em ácido perclórico (HClO4) e ácido nítrico (HNO3) com placa de aquecimento. Os metais pesados zinco (Zn), chumbo (Pb), cromo (Cr) e níquel (Ni) foram determinados usando espectrofotômetro de absorção atômica Perkin Elmer 2380. Os resultados mostram grande variação no conteúdo do metal relacionado ao tipo de tecido e locais de amostragem. Uma alta concentração de bioacumulação foi relatada em Charbagh, enquanto a mais baixa, em Odigram: Charbagh > Landakai > Odigram. Da mesma forma, Cr foi o metal pesado mais acumulado, seguido por Pb, Ni e Zn.

16.
Braz. j. biol ; 82: e244735, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1249280

RESUMO

Abstract L-Asparaginase catalysing the breakdown of L-Asparagine to L-Aspartate and ammonia is an enzyme of therapeutic importance in the treatment of cancer, especially the lymphomas and leukaemia. The present study describes the recombinant production, properties and anticancer potential of enzyme from a hyperthermophilic archaeon Pyrococcus abyssi. There are two genes coding for asparaginase in the genome of this organism. A 918 bp gene encoding 305 amino acids was PCR amplified and cloned in BL21 (DE3) strain of E. coli using pET28a (+) plasmid. The production of recombinant enzyme was induced under 0.5mM IPTG, purified by selective heat denaturation and ion exchange chromatography. Purified enzyme was analyzed for kinetics, in silico structure and anticancer properties. The recombinant enzyme has shown a molecular weight of 33 kDa, specific activity of 1175 U/mg, KM value 2.05mM, optimum temperature and pH 80°C and 8 respectively. No detectable enzyme activity found when L-Glutamine was used as the substrate. In silico studies have shown that the enzyme exists as a homodimer having Arg11, Ala87, Thr110, His112, Gln142, Leu172, and Lys232 being the putative active site residues. The free energy change calculated by molecular docking studies of enzyme and substrate was found as ∆G - 4.5 kJ/mole indicating the affinity of enzyme with the substrate. IC50 values of 5U/mL to 7.5U/mL were determined for FB, caco2 cells and HepG2 cells. A calculated amount of enzyme (5U/mL) exhibited 78% to 55% growth inhibition of caco2 and HepG2 cells. In conclusion, the recombinant enzyme produced and characterized in the present study offers a good candidate for the treatment of cancer. The procedures adopted in the present study can be prolonged for in vivo studies.


Resumo A L-asparaginase, que catalisa a degradação da L-asparagina em L-aspartato e amônia, é uma enzima de importância terapêutica no tratamento do câncer, especialmente dos linfomas e da leucemia. O presente estudo descreve a produção recombinante, propriedades e potencial anticancerígeno da enzima de Pyrococcus abyssi, um archaeon hipertermofílico. Existem dois genes que codificam para a asparaginase no genoma desse organismo. Um gene de 918 bp, que codifica 305 aminoácidos, foi amplificado por PCR e clonado na cepa BL21 (DE3) de E. coli usando o plasmídeo pET28a (+). A produção da enzima recombinante foi induzida sob 0,5mM de IPTG, purificada por desnaturação seletiva por calor e cromatografia de troca iônica. A enzima purificada foi analisada quanto à cinética, estrutura in silico e propriedades anticancerígenas. A enzima recombinante apresentou peso molecular de 33 kDa, atividade específica de 1.175 U / mg, valor de KM 2,05 mM, temperatura ótima de 80º C e pH 8. Nenhuma atividade enzimática detectável foi encontrada quando a L-glutamina foi usada como substrato. Estudos in silico mostraram que a enzima existe como um homodímero, com Arg11, Ala87, Thr110, His112, Gln142, Leu172 e Lys232 sendo os resíduos do local ativo putativo. A mudança de energia livre calculada por estudos de docking molecular da enzima e do substrato foi encontrada como ∆G - 4,5 kJ / mol, indicando a afinidade da enzima com o substrato. Valores de IC50 de 5U / mL a 7,5U / mL foram determinados para células FB, células caco2 e células HepG2. Uma quantidade de enzima (5U / mL) apresentou inibição de crescimento de 78% a 55% das células caco2 e HepG2, respectivamente. Em conclusão, a enzima recombinante produzida e caracterizada no presente estudo é uma boa possibilidade para o tratamento do câncer. Os procedimentos adotados na presente pesquisa podem ser aplicados para estudos in vivo.

17.
Braz. j. biol ; 82: e238673, 2022. tab
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1153461

RESUMO

Abstract Coccidiosis remains one of the major problems in poultry all over the world. Very limited data on anticoccidial drugs in wild pigeons is available. The current study was aimed to understand the comparative efficacy of sulfadimidine, amprolium and triquen in wild pigeons of Dir district, Pakistan suffering from coccidiosis. The faecal matter of wild pigeons were purchased from the local market for coccidian infection. Results revealed that 88.8% (16/18) were found infected with Eimeria spp. Three positive groups were treated with sulfadimidine (0.2mg/L), amprolium (25mg/L) and triquen. Sulfadimidine was most effective (45%) followed by amprolium (44.6%) while triquen (24.0%) showed less effectiveness against coccidiosis in pigeons. Number of oocysts were 79, 81 and 80 before treatment and 60, 44 and 44 after treatment with sulfadimidine, amprolium and triquen respectively. This study showed that sulphadimidine, amprolium and triquen could not significantly reduce the coccidiosis in pigeons. Further studies are required to clear the mechanism of anti-coccidial drugs in wild pigeons.


Resumo A coccidiose continua sendo um dos maiores problemas em aves de todo o mundo. Dados muito limitados sobre drogas anticoccidiais em pombos selvagens estão disponíveis. O presente estudo teve como objetivo compreender a eficácia comparativa da sulfadimidina, amprólio e triquenho em pombos selvagens do distrito de Dir, no Paquistão, que sofrem de coccidiose. A matéria fecal dos pombos selvagens foi comprada no mercado local para infecção por coccídios. Os resultados revelaram que 88,8% (16/18) foram encontrados infectados com Eimeria spp. Três grupos positivos foram tratados com sulfadimidina (0,2mg / L), amprólio (25mg / L) e triquenho. A sulfadimidina foi mais eficaz (45%), seguida pelo amprólio (44,6%), enquanto o triquenho (24,0%) apresentou menor efetividade contra a coccidiose em pombos. O número de oocistos foram 79, 81 e 80 antes do tratamento e 60, 44 e 44 após o tratamento com sulfadimidina, amprólio e triquenho, respectivamente. Este estudo mostrou que sulphadimidine, amprolium e triquen não poderiam reduzir significativamente a coccidiose em pombos. Mais estudos são necessários para limpar o mecanismo de drogas anticoccidiais em pombos selvagens.

18.
Braz. j. biol ; 82: e235612, 2022. tab
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1153466

RESUMO

Abstract The experiment was carried out on mango cv. Dusehri to investigate the effect of N, P and K fertilizers on vegetative, reproductive growth, yield and fruit quality. Eight different fertilizer combinations such as T1 (control), T2 (N), T3 (P), T4 (K), T5 (NP), T6 (NK), T7 (PK) and T8 (NPK) were used. Individual or combine fertilizer application of N (1000 g), P (750 g) and K (750 g) were applied during growing season in February and August. All the treatments significantly influenced on vegetative growth, flowering, fruiting, yield and other physiochemical attributes of mango as compared to control. Least effect was observed with individual fertilizer application while combine fertilizer treatments enhanced most of the investigated parameters. Especially, qualitative traits showed non-significant differences between treated and untreated mango trees. However, among the different treatments T8 (NPK) showed significance for fruiting aspects such as maximum size of growth flushes (177.51 mm), total number of panicles/tree (845), total number of flowers/panicle (974), sex ratio (69.18%), fruit retention (13.85%), total number of fruits/tree (379), yield (82 kg/tree), fruit weight (197.5 g), pulp weight (135.5 g) and physiochemical parameters namely TSS (24.53), Vit. C (57.63 mg/100 mL) and total sugar (20.84%). In general, combine application of NPK (T8) were the most effective in enhancing fruiting aspects, yield, physiochemical characteristics as well as improved fruit quality of mango trees.


Resumo O experimento foi realizado em manga cv. Dusehri para investigar o efeito dos fertilizantes N, P e K no crescimento vegetativo, reprodutivo, produtividade e de qualidade do fruto. Foram utilizadas oito combinações diferentes de fertilizantes: T1 (controle), T2 (N), T3 (P), T4 (K), T5 (NP), T6 (NK), T7 (PK) e T8 (NPK). Cada tratamento de N (1.000 g), P (750 g) e K (750 g) foi aplicado duas vezes durante a estação de crescimento em fevereiro e agosto. Todos os tratamentos influenciaram significativamente o crescimento vegetativo, floração, frutificação, produtividade e outros atributos físico-químicos da manga em relação ao controle. Menos efeito foi observado com a aplicação individual de fertilizante, enquanto os tratamentos combinados aumentaram a maioria dos parâmetros investigados. Especialmente as características qualitativas mostraram diferenças não significativas entre mangueiras tratadas e não tratadas. No entanto, entre os diferentes tratamentos, T8 (NPK) apresentou significância para aspectos de frutificação, como tamanho máximo de folgas de crescimento (177,51 mm), número total de panículas/árvore (845), número total de flores/panícula (974), razão sexual (69,18%), retenção de frutos (13,85%), número total de frutos/árvore (379), produção (82 kg/árvore), peso do fruto (197,5 g) e peso da polpa (135,5 g), além de parâmetros físico-químicos, como TSS (24,53), vitamina C (57,63 mg/100 mL) e açúcar total (20,84%). Em geral, a aplicação combinada de NPK (T8) foi a mais eficaz no aprimoramento dos aspectos de frutificação, produtividade, características físico-químicas, além da melhoria da qualidade dos frutos das mangueiras.

19.
Artigo em Inglês | VETINDEXEXPRESS | ID: vti-762573

RESUMO

Abstract Illnesses caused by human pinworm remains a pediatric health problem in developing nations including Pakistan. This study aimed to investigate the prevalence of Enterobius vermicularis in school children of four districts in Malakand region, Pakistan. Four hundred faecal specimens were screened from May 2014 to July 2017 using normal saline and Lugol Iodine solution. Twenty three (5.75%) individuals were found infected with E. vermicularis. Five children (1.25%) were infected with only E. vermicularis and eighteen (4.5%) were mixed with other helminths. E. vermicularis 23 (5.75%), hookworm 11 (2.75%), Ascaris lumbricoides 5 (1.25%), Taenia saginata 2 (0.5%) and Trichuris trichuira 4 (1%) were detected. Age wise 5-8 years were more parasitized followed by 13-15 and 9-12 years of age (0.0296, P 0.05). Male children were highly (0.06700, P 0.05) infected than female. Children in Malakand district were found more infected followed by Dir Upper, similar infection rate was noted in children of districts Lower Dir and Swat (0.0192, P 0.05). Children in primary level were highly (0.0013, P 0.05) infected than those of middle and high levels. Enterobiosis is still the most common parasitic diseases in children. Studies on enterobiosis should be conducted time by time to recognize the hazardous of such parasitic infection in remote areas of the country.


Resumo As doenças causadas pela traça humana continuam sendo um problema de saúde pediátrica nos países em desenvolvimento, incluindo o Paquistão. Este estudo teve como objetivo investigar a prevalência de Enterobius vermicularis em escolares de quatro distritos na região de Malakand, Paquistão. Quatrocentos espécimes fecais foram selecionados de maio de 2014 a julho de 2017, usando solução salina normal e solução de lugol iodo. Vinte e três (5,75%) indivíduos foram encontrados infectados por E. vermicularis. Cinco crianças (1,25%) foram infectadas apenas com E. vermicularis e dezoito (4,5%) foram misturadas com outros helmintos. Foram detectados E. vermicularis 23 (5,75%), ancilóstomo 11 (2,75%), Ascaris lumbricoides 5 (1,25%), Taenia saginata 2 (0,5%) e Trichuris trichuira 4 (1%). Com relação à idade, 5-8 anos foram mais parasitados, seguidos por 13-15 e 9-12 anos de idade (0,0296, P 0,05). Crianças do sexo masculino foram altamente (0,06700, P 0,05) infectadas do que as do sexo feminino. As crianças no distrito de Malakand foram encontradas mais infectadas, seguidas por Dir Upper, taxa de infecção semelhante foi observada em crianças dos distritos Lower Dir e Swat (0,0192, P 0,05). As crianças do nível primário foram altamente (0,0013, P 0,05) infectadas do que as dos níveis médio e alto. A enterobiose ainda é a doença parasitária mais comum em crianças. Os estudos sobre enterobiose devem ser conduzidos periodicamente para reconhecer a periculosidade dessa infecção parasitária em áreas remotas do país.

20.
Artigo em Inglês | VETINDEXEXPRESS | ID: vti-762570

RESUMO

Abstract A new species of the genus Lutziella (Rohde, 1966) Yamaguti, 1971 is described here and named Lutziella swatensis sp.nov. from the liver of rat (Rattus rattus L.). The new species is characterized by having body flat, smooth, longer than broad with maximum width at the level of the ovary, oral sucker with weak musculature, pharynx small; eosophagus long; caeca of irregular shape which bifurcate on the anterior border of the ovary in to unequal portions, acetabulum weakly muscular, post-testicular, testes lobed, cirrus pouch somewhat median, small in size containing winding seminal vesicle, prostatic complex and short ejaculatory duct. Genital pore median. Ovary post testicular, submedian; seminal receptacle overlapping ovary, laurers canal present. Vitellaria follicular extending on each side from almost the level of testes to anterior portion of posterior half of the body. Uterus filled with eggs occupying most of the body, eggs oval rather small, numerous, brownish in colour, excretory vesicle tubular with terminal pore. Lutziella swatensis n. sp. is the second species of the genus known from Pakistan as well as the second species described from murid rodents in the world.


Resumo Uma nova espécie do gênero Lutziella (Rohde, 1966) Yamaguti, 1971 é descrita aqui e denominada Lutziella swatensis sp.nov. do fígado do rato (Rattus rattus L.). A nova espécie é caracterizada por ter corpo liso, liso, mais longo que largo com largura máxima ao nível do ovário, otário oral com musculatura débil, faringe pequena; eosôfago longo; ceco de forma irregular que se bifurca na borda anterior do ovário em porções desiguais, acetábulo fracamente muscular, pós-testicular, testículos lobados, bolsa cirrus um pouco mediana, pequeno em tamanho contendo vesícula seminal sinuosa, complexo prostático e ducto ejaculatório curto. Mediana dos poros genitais. Ovário pós testicular, submediano; ovário sobreposto do receptáculo seminal, canal de laurer presente. Vitellaria folicular que se estende de cada lado de quase o nível dos testículos para a porção anterior da metade posterior do corpo. Útero cheio de ovos que ocupam a maior parte do corpo, oval ovos bastante pequenos, numerosos, de cor acastanhada, vesícula excretor tubular com poro terminal. Lutziella swatensis n. sp. é a segunda espécie do gênero conhecida do Paquistão, bem como a segunda espécie descrita de roedores do mundo.

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