RESUMO
HLA-DPA1*02:134, a novel HLA class II allele detected by next-generation sequencing.
Assuntos
Alelos , Éxons , Cadeias alfa de HLA-DP , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala , Teste de Histocompatibilidade , Humanos , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos , Cadeias alfa de HLA-DP/genética , Teste de Histocompatibilidade/métodos , CódonRESUMO
Genomic sequence of HLA-DPA1*01:03:01:73, -DPA1*01:03:01:80, DPA1*01:03:01:82, -DPA1*01:155:01:02, -DPA1*02:02:02:16 alleles in Spanish individuals.
Assuntos
Alelos , Cadeias alfa de HLA-DP , Humanos , Cadeias alfa de HLA-DP/genética , Éxons , Espanha , Teste de Histocompatibilidade , Análise de Sequência de DNA , Sequência de Bases , Alinhamento de SequênciaRESUMO
To analyse the effect of HLA-DPA1 and HLA-DPB1 allelic mismatches on the outcomes of unrelated donor haematopoietic stem cell transplantation (URD-HSCT), we collected 258 recipients with haematological disease who underwent HLA-10/10 matched URD-HSCT. HLA-A, -B, -C, -DRB1, -DQB1, -DRB3/4/5, -DQA1, -DPA1 and -DPB1 typing was performed for the donors and recipients using next-generation sequencing (NGS) technology. After excluding 8 cases with DQA1 or DRB3/4/5 mismatches, we included 250 cases with HLA-14/14 matching for further analysis. Our results showed that the proportion of matched DPA1 and DPB1 alleles was only 10.4% (26/250). The remaining 89.6% of donors and recipients demonstrated DPA1 or DPB1 mismatch. In the DPA1 matched and DPB1 mismatched group, accounting for 18.8% (47/250) of the cohort, DPB1*02:01/DPB1*03:01 allelic mismatches were associated with decreased 2-year OS and increased NRM. DPB1*02:02/DPB1*05:01 and DPB1*02:01/DPB1*05:01 mismatches showed no impact on outcomes. Moreover, the specific allelic mismatches observed were consistent with the DPB1 T-cell epitope (TCE) classification as permissive and non-permissive. We innovatively established an analysis method for DPA1 ~ DPB1 linkage mismatch for cases with both DPA1 and DPB1 mismatched, accounting for 70% (175/250) of the total. DPA1*02:02 ~ DPB1*05:01/DPA1*02:01 ~ DPB1*17:01 linkage mismatches were associated with lower 2-year OS, especially among AML/MDS recipients. DPA1*02:02 ~ DPB1*05:01/DPA1*01:03 ~ DPB1*02:01 linkage mismatches showed no impact on outcomes. In conclusion, applying the DPA1 ~ DPB1 linkage mismatch analysis approach can identify different types of mismatches affecting transplant outcomes and provide valuable insight for selecting optimal donors for AML/MDS and ALL recipients.
Assuntos
Alelos , Cadeias alfa de HLA-DP , Cadeias beta de HLA-DP , Transplante de Células-Tronco Hematopoéticas , Teste de Histocompatibilidade , Doadores não Relacionados , Humanos , Cadeias beta de HLA-DP/genética , Transplante de Células-Tronco Hematopoéticas/métodos , Cadeias alfa de HLA-DP/genética , Masculino , Teste de Histocompatibilidade/métodos , Feminino , Adulto , Pessoa de Meia-Idade , Adolescente , Adulto Jovem , Criança , Pré-Escolar , Idoso , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos , Doença Enxerto-Hospedeiro/genética , Doença Enxerto-Hospedeiro/imunologiaRESUMO
The novel HLA-DPA1*01:195 allele differs from HLA-DPA1*01:03:01:01 by one nucleotide substitution in exon 4.
Assuntos
Alelos , Éxons , Cadeias alfa de HLA-DP , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala , Teste de Histocompatibilidade , Humanos , Cadeias alfa de HLA-DP/genética , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos , Teste de Histocompatibilidade/métodos , Sequência de Bases , Análise de Sequência de DNA/métodos , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Alinhamento de SequênciaRESUMO
The novel HLA-DPA1*02:07:04 allele was detected during the HLA typing for kidney transplantation.
Assuntos
Alelos , Cadeias alfa de HLA-DP , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala , Teste de Histocompatibilidade , Transplante de Rim , Humanos , Cadeias alfa de HLA-DP/genética , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos , Teste de Histocompatibilidade/métodos , ÉxonsRESUMO
HLA-DPA1*02:86 differs from HLA-DPA1*02:01:01 by a single nucleotide substitution at position 680 C > A in exon 4.
Assuntos
Alelos , Éxons , Cadeias alfa de HLA-DP , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala , Teste de Histocompatibilidade , Humanos , Cadeias alfa de HLA-DP/genética , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos , Teste de Histocompatibilidade/métodos , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Sequência de Bases , Análise de Sequência de DNA/métodosRESUMO
HLA-DPA1*02:117 differs from HLA-DPA1*02:02:02:01 by one nucleotide in exon 2.
Assuntos
Cadeias alfa de HLA-DP , Nucleotídeos , Humanos , Alelos , Cadeias alfa de HLA-DP/genética , China , Análise de Sequência de DNARESUMO
The novel HLA-DPA1*02:02:15 allele differs from HLA-DPA1*02:02:02:01 by one nucleotide substitution in exon 1.
Assuntos
Cadeias alfa de HLA-DP , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala , Humanos , Alelos , Teste de Histocompatibilidade , Cadeias alfa de HLA-DP/genéticaRESUMO
HLA-DPA1*02:124 differs from HLA-DRB1*02:02:02:01 by one nucleotide substitution in codon 5 in exon 2.
Assuntos
Cadeias alfa de HLA-DP , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala , Humanos , Alelos , Cadeias alfa de HLA-DP/genética , República da CoreiaRESUMO
HLA-DPA1*02:01:25 differs from DPA1*02:01:01:02 by a synonymous transition in exon 2.
Assuntos
Cadeias alfa de HLA-DP , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala , Humanos , Alelos , Cadeias alfa de HLA-DP/genética , Éxons/genéticaRESUMO
Seven different single nucleotide substitutions in non-coding regions gave rise to novel HLA-DPA1*01:03:01 variants.
Assuntos
Cadeias alfa de HLA-DP , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala , Humanos , Alelos , Cadeias alfa de HLA-DP/genética , Teste de HistocompatibilidadeRESUMO
HLA-DPA1*02:122 differs from HLA-DPA1*02:01:01:02 by one nucleotide substitution in codon 78 in exon 2.