RESUMO
Enterococci are robust Gram-positive bacteria that pose a significant threat in healthcare settings due to antibiotic resistance, with vancomycin-resistant enterococci (VRE) most prominent. To tackle this issue, bacteriophages (bacterial viruses) can be exploited as they specifically and efficiently target bacteria. Here, we successfully isolated and characterised a set of novel phages: SHEF10, SHEF11, SHEF13, SHEF14, and SHEF16 which target E. faecalis (SHEF10,11,13), or E. faecium (SHEF13, SHEF14 & SHEF16) strains including a range of clinical and VRE isolates. Genomic analysis shows that all phages are strictly lytic and diverse in terms of genome size and content, quickly and effectively lysing strains at different multiplicity of infections. Detailed analysis of the broad host-range SHEF13 phage revealed the crucial role of the enterococcal polysaccharide antigen (EPA) variable region in its infection of E. faecalis V583. In parallel, the discovery of a carbohydrate-targeting domain (CBM22) found conserved within the three phage genomes indicates a role in cell surface interactions that may be important in phage-bacterial interactons. These findings advance our comprehension of phage-host interactions and pave the way for targeted therapeutic strategies against antibiotic-resistant enterococcal infections.
Assuntos
Bacteriófagos , Enterococcus faecalis , Genoma Viral , Especificidade de Hospedeiro , Bacteriófagos/genética , Bacteriófagos/fisiologia , Bacteriófagos/classificação , Bacteriófagos/isolamento & purificação , Enterococcus faecalis/virologia , Enterococcus faecalis/genética , Enterococcus faecium/virologia , Enterococcus faecium/genética , Enterococcus/virologia , Enterococcus/genética , Enterococos Resistentes à Vancomicina/virologia , Enterococos Resistentes à Vancomicina/genética , Infecções por Bactérias Gram-Positivas/microbiologia , HumanosRESUMO
Objetivos: conocer la prevalencia de especies de enterococos causantes de infecciones en niño, su virulencia, susceptibilidad antimicrobiana e infecciones más frecuentes. Métodos: se estudiaron 156 aislamientos de enterococos causantes de infecciones en niños ingresados en el Hospital Octavio de la Concepción y La Pedraja, Holguín. Se llevó a cabo la identificación de especies y detección de factores de virulencia por métodos fenotípicos. Se determinó la concentración inhibitoria mínima para vancomicina, ciprofloxacina, ampicilina, gentamicina, estreptomicina, cloranfenicol, nitrofurantoína, eritromicina, tetraciclina, levofloxacina y norfloxacina, según las normas del Clinical Laboratory Standard Institute. Resultados: las cepas se aislaron de sangre, orina, heridas quirúrgicas, piel y tejido blando, oído medio, vulva, punta de catéter, líquido peritoneal, vagina, esperma, líquido cefalorraquídeo, y otras fuentes. La especie prevalente fue Enterococcus faecalis, seguido por Enterococcus faecium, Enterococcus gallinarum y Enterococcus raffinossus, Enterococcus casseliflavus y Enterococcus avium. La producción de proteasa y hemolisina se detectó solo en E. faecalis. E. faecium mostró porcentajes más altos de resistencia a ampicilina, ciprofloxacina, norfloxacina, levofloxacina, mientras que E. faecalis mostró más resistencia a eritromicina, cloranfenicol y tetraciclina. De E. faecalis 58 aislamientos y 12 de E. faecium presentaron altos niveles de resistencia a gentamicina, así como 45 y 32,3 por ciento mostraron altos niveles de resistencia para estreptomicina, respectivamente. Se detectó una cepa de E. faecium resistente a vancomicina. Conclusiones: la circulación de cepas de enterococos virulentas y resistentes a diferentes antibióticos indica la necesidad del control de la infección enterocócica...
Objectives: to find out the prevalence of Enterococcus species causing child infections, their virulence, antimicrobial susceptibility and most frequent infections. Methods: One hundred and fifty six isolations from Enterococcus causing infections in children, admitted to Octavio de la Concepción y La Pedraja hospital in Holguin, were studied. The phenotypical methods allowed identifying species and detecting virulence factors. Following Clinical Laboratory Standard Institute requirements, minimal inhibitory concentration was determined for vancomycin, ciprofloxacin, ampicilline, gentamycin, streptomycin, chloranphenicol, nitrofurantoine, erythromycin, tetracycline, levofloxacin and norfloxacine. Results: Strains were isolated from the blood, the urine, surgical wounds, the skin and the soft tissue, the middle ear, the vulva, catheter point, peritoneal fluid, vagina, sperm, cerebrospinal fluid, and from other sources. The prevailing species was Enterococcus faecalis followed by Enterococcus faecium, Enterococcus gallinarum y Enterococcus raffinossus, Enterococcus casseliflavus y Enterococcus avium. Protease and hemolysin was only detected in E. faecalis. E. faecium accounted for the highest percentage of resistance to ampicillin, ciprofloxacine, norfloxacin, levofloxacin whereas E. faecalis was more resistant to erythromycin, chloranphenicol and tetracycline. Fifty eight E. faecalis isolates and 12 E. faecium isolates exhibited the highest levels of resistance to gentamycin, as well as 45 percent and 32.3 percent of samples had high levels of resistance to streptomycin respectively. A vancomycin-resistent E. faecium strain was detected. Conclusions: The circulation of virulent and multiple resistant Enterococcus strains indicates that Enterococcus infection need to be controlled and the importance of monitoring antimicrobial susceptibility...
Assuntos
Humanos , Criança , Adolescente , Enterococcus/virologia , Infecção Hospitalar/complicações , Testes de Sensibilidade Microbiana/métodos , Cuba , Epidemiologia Descritiva , Estudos RetrospectivosRESUMO
Se demostro que la vigilancia activa de colonización con enterococos resistentes a vancomicina (ERV) resulta costo-efectiva y que es capaz de limitar la presencia de esos patógenos en los hospitales. El objetivo de este trabajo fue evaluar el impacto de una forma de vigilancia menos estricta a través de los resultados de los estudios de prevalencia de un día y del número anual de pacientes infectados con ERV. En los cortes de prevalencia, se estudiaron todos los pacientes hospitalizados en días determinados, a través de hisopados rectales cultivados en medio BEAA con 6 ug/ml de vancomicina (VAN). También se estudiaron todos los aislamientos de enterococos provenientes de materiales clinicamente significativos a lo largo de los años. La resistencia a VAN fue confirmada por difusión, Etest y PCR especifica para lo genes vanA, vanB, o van C. La relación clonal fue establecida por electroforesis en campos pulsados cor cortes con la enzima Smal. El porcentaje de colonización rectal de ERV en los cortes de prevanlencia no registró un aumento significativo entre 2002 y 2007 (p > 0.05). La diversidad clonal mostró una baja tendencia hacia la diseminación intrahospitalaria de los ERV. El número de bacteriemias por ERV se mantuvo en niveles aceptables y la mayoria de las infecciones estuvieron localizadas en el tracto urinario. Concluyendo, el número de pacientes colonizados aumentó en forma sostenida pero sin diferencias significativas entre los distintos años. El número de pacientes severamente infectados con ERV hasta el momento ha sido escaso. Esto pareceria indicar que la estrategia elegida ha resultado efectiva.