Evaluation of miRNAs regulation of BDNF and IGF1 genes in T2DM insulin resistance in experimental models: bioinformatics based approach / Avaliação da regulação por miRNAs dos genes BDNF e IGF1 na resistência a insulina no diabetes do tipo 2 em modelos experimentais: in silico

ABSTRACT

microRNAs (miRNAs) are recognized as diabetes mellitus type 2 (T2DM) biomarkers useful for disease metabolism comprehension and have great potential as therapeutics targets. BDNF and IGF1 increased expression are highly involved in the benefits of insulin and glucose paths, however, they are down-regulated in insulin resistance conditions, while their expression increase is correlated to the improvement of glucose and insulin metabolism. Studies suggest the microRNA regulation of these genes in several different contexts, providing a novel investigation approach for comprehending T2DM metabolism and revealing potential therapeutic targets. In the present study, we investigate in different animal models (human, rat, and mouse) miRNAs that target BDNF and IGF1 in skeletal muscle tissue with T2DM physiological conditions. Bioinformatics tools and databases were used to miRNA prediction, molecular homology, experimental validation of interactions, expression in the studied physiological condition, and network interaction. The findings showed three miRNAs candidates for IGF1(miR-29a, miR-29b, and miR-29c) and one for BDNF (miR-206). The experimental evaluations and the search for the expression in skeletal muscle from T2DM subjects confirmed the predicted interaction between miRNA-mRNA for miR-29b and miR-206 through human, rat, and mouse models. This interaction was reaffirmed in multiple network analyses. In conclusion, our results show the regulation relationship between miR-29b and miR-206 with the investigated genes, in several tissues, suggesting an inhibition pattern. Nevertheless, these data show a large number of possible interaction physiological processes, for future biotechnological prospects.

RESUMO

Os microRNAs (miRNAs) são reconhecidos como biomarcadores do diabetes mellitus tipo 2 (DM2), úteis para a compreensão do metabolismo da doença, e possuem grande potencial como alvos terapêuticos. O aumento da expressão de BDNF e IGF1 está altamente envolvido nos benefícios as vias de insulina e glicose, porém, são regulados negativamente em condições de resistência à insulina, enquanto seu aumento de expressão está correlacionado com a melhora do metabolismo da glicose e da insulina. Estudos sugerem a regulação desses genes por microRNA em vários contextos diferentes, proporcionando uma nova abordagem de investigação para compreender o metabolismo do DM2 e revelar potenciais alvos terapêuticos. No presente estudo, investigamos em diferentes modelos animais (humanos, ratos e camundongos) miRNAs que têm como alvo BDNF e IGF1 em tecido muscular esquelético com condições fisiológicas de DM2. As análises foram realizadas utilizando ferramentas de bioinformática e bancos de dados para predição de miRNA, homologia molecular, validação experimental de interações, expressão na condição fisiológica estudada e interação em rede. Os resultados mostraram três candidatos a miRNAs para IGF1 (miR-29a, miR-29b e miR-29c) e um para BDNF (miR-206). As avaliações experimentais e a busca pela expressão no músculo esquelético de indivíduos com DM2 confirmaram a interação prevista entre miRNA-mRNA para miR-29b e miR-206 através de modelos humanos, ratos e camundongos. Essa interação foi reafirmada em múltiplas análises de rede. Em conclusão, nossos resultados mostram a relação de regulação entre miR-29b e miR-206 com os genes investigados, em diversos tecidos, sugerindo um padrão de inibição. Contudo, esses dados mostram um grande número de possíveis processos fisiológicos de interação para perspectivas biotecnológicas.