Use of laser microdissection for phylogenetic characterization of polyphosphate-accumulating bacteria.

Gloess, Stefanie; Grossart, Hans-Peter; Allgaier, Martin; Ratering, Stefan; Hupfer, Michael

Gloess, Stefanie; Grossart, Hans-Peter; Allgaier, Martin; Ratering, Stefan; Hupfer, Michael.

Afiliação

Gloess S; Leibniz Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries, Alte Fischerhütte 2, D-16775 Stechlin-Neuglobsow, Germany.

Appl Environ Microbiol ; 74(13): 4231-5, 2008 Jul.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-18456855

ABSTRACT

ABSTRACT

Our novel approach for taxonomic identification of uncultured bacteria harboring specific physiological features in complex environmental samples combines cell collection by laser microdissection and subsequent DNA analysis. The newly developed approach was successfully tested for collection and phylogenetic characterization of polyphosphate-accumulating bacteria in activated sludge and lake sediment.

Assuntos

Bactérias/genética; Água Doce/microbiologia; Sedimentos Geológicos/microbiologia; Lasers; Filogenia; Polifosfatos/metabolismo; Esgotos/microbiologia; Bactérias/classificação; Bactérias/metabolismo; Dissecação; Genes de RNAr; Microscopia; Dados de Sequência Molecular; RNA Ribossômico 16S/genética; Análise de Sequência de DNA

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Filogenia / Polifosfatos / Esgotos / Bactérias / Sedimentos Geológicos / Água Doce / Lasers Idioma: En Revista: Appl Environ Microbiol Ano de publicação: 2008 Tipo de documento: Article

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