Directed random walks and constraint programming reveal active pathways in hepatocyte growth factor signaling.

Kittas, Aristotelis; Delobelle, Aurélien; Schmitt, Sabrina; Breuhahn, Kai; Guziolowski, Carito; Grabe, Niels

Kittas, Aristotelis; Delobelle, Aurélien; Schmitt, Sabrina; Breuhahn, Kai; Guziolowski, Carito; Grabe, Niels.

Afiliação

Kittas A; Centre for Process Systems Engineering, Department of Chemical Engineering, University College London, UK.
Delobelle A; École Centrale de Nantes, IRCCyN UMR CNRS 6597, France.
Schmitt S; Institute of Pathology, University Hospital Heidelberg, Germany.
Breuhahn K; Institute of Pathology, University Hospital Heidelberg, Germany.
Guziolowski C; École Centrale de Nantes, IRCCyN UMR CNRS 6597, France.
Grabe N; Department of Medical Oncology, NCT, University Hospital Heidelberg, Germany.

FEBS J ; 283(2): 350-60, 2016 Jan.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-26518250

Assuntos

Algoritmos; Redes Reguladoras de Genes; Fator de Crescimento de Hepatócito/genética; Bases de Dados Factuais; Regulação da Expressão Gênica; Fator de Crescimento de Hepatócito/metabolismo; Humanos; Queratinócitos/metabolismo; Método de Monte Carlo; Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos; Distribuição Aleatória; Transdução de Sinais

Palavras-chave

HGF signaling; answer set programming; biological networks; logic programming; logical modelling; random walks; subgraph extraction

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / Fator de Crescimento de Hepatócito / Redes Reguladoras de Genes Tipo de estudo: Clinical_trials / Health_economic_evaluation / Prognostic_studies / Qualitative_research Limite: Humans Idioma: En Revista: FEBS J Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

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