Nuclear internal transcribed spacer-1 as a sensitive genetic marker for environmental DNA studies in common carp Cyprinus carpio.

Minamoto, Toshifumi; Uchii, Kimiko; Takahara, Teruhiko; Kitayoshi, Takumi; Tsuji, Satsuki; Yamanaka, Hiroki; Doi, Hideyuki

Minamoto, Toshifumi; Uchii, Kimiko; Takahara, Teruhiko; Kitayoshi, Takumi; Tsuji, Satsuki; Yamanaka, Hiroki; Doi, Hideyuki.

Afiliação

Minamoto T; Graduate School of Human Development and Environment, Kobe University, 3-11 Tsurukabuto, Nada-ku, Kobe City, Hyogo, 657-8501, Japan.
Uchii K; Institute for Sustainable Sciences and Development, Hiroshima University, 1-3-1 Kagamiyama, Higashi-Hiroshima, Hiroshima, 739-8530, Japan.
Takahara T; Faculty of Pharmacy, Osaka Ohtani University, 3-11-1 Nishikiori-kita, Tondabayashi, Osaka, 584-8540, Japan.
Kitayoshi T; Institute for Sustainable Sciences and Development, Hiroshima University, 1-3-1 Kagamiyama, Higashi-Hiroshima, Hiroshima, 739-8530, Japan.
Tsuji S; Faculty of Life and Environmental Science, Shimane University, 1060 Nishikawatsu-cho, Matsue, Shimane, 690-8504, Japan.
Yamanaka H; Faculty of Science and Technology/Graduate School of Science and Technology, Ryukoku University, 1-5 Yokotani, Seta Oe-cho, Otsu, Shiga, 520-2194, Japan.
Doi H; Faculty of Science and Technology/Graduate School of Science and Technology, Ryukoku University, 1-5 Yokotani, Seta Oe-cho, Otsu, Shiga, 520-2194, Japan.

Mol Ecol Resour ; 17(2): 324-333, 2017 Mar.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27487846

Assuntos

Carpas/genética; DNA Espaçador Ribossômico/genética; DNA/genética; DNA/isolamento & purificação; Marcadores Genéticos; Metagenômica/métodos; Água/química; Animais; Química Encefálica; Carpas/classificação; Análise por Conglomerados; Citocromos b/genética; DNA/análise; DNA Mitocondrial/genética; DNA Espaçador Ribossômico/química; Dosagem de Genes; Brânquias/química; Intestinos/química; Filogenia; Análise de Sequência de DNA

Palavras-chave

cytochrome b (CytB); environmental DNA (eDNA); internal transcribed spacer 1 (ITS1); mitochondrial DNA (mtDNA); nuclear DNA (ncDNA); real-time PCR

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: DNA / Carpas / Água / Marcadores Genéticos / DNA Espaçador Ribossômico / Metagenômica Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Evaluation_studies Limite: Animals Idioma: En Revista: Mol Ecol Resour Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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