De novo assembly of the ringed seal (Pusa hispida) blubber transcriptome: A tool that enables identification of molecular health indicators associated with PCB exposure.

Brown, Tanya M; Hammond, S Austin; Behsaz, Bahar; Veldhoen, Nik; Birol, Inanç; Helbing, Caren C

Brown, Tanya M; Hammond, S Austin; Behsaz, Bahar; Veldhoen, Nik; Birol, Inanç; Helbing, Caren C.

Afiliação

Brown TM; Department of Biochemistry and Microbiology, University of Victoria, Victoria, British Columbia V8W 3P6, Canada; Memorial University, St. John's, Newfoundland A1B 3X9, Canada.
Hammond SA; Department of Biochemistry and Microbiology, University of Victoria, Victoria, British Columbia V8W 3P6, Canada; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.
Behsaz B; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.
Veldhoen N; Department of Biochemistry and Microbiology, University of Victoria, Victoria, British Columbia V8W 3P6, Canada.
Birol I; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.
Helbing CC; Department of Biochemistry and Microbiology, University of Victoria, Victoria, British Columbia V8W 3P6, Canada. Electronic address: chelbing@uvic.ca.

Aquat Toxicol ; 185: 48-57, 2017 Apr.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28187360

Assuntos

Estruturas Animais/metabolismo; Exposição Ambiental/análise; Indicadores Básicos de Saúde; Bifenilos Policlorados/toxicidade; Focas Verdadeiras/genética; Transcriptoma/genética; Animais; Perfilação da Expressão Gênica; Ontologia Genética; Anotação de Sequência Molecular; Reação em Cadeia da Polimerase; RNA Mensageiro/genética; RNA Mensageiro/metabolismo; Reprodutibilidade dos Testes; Análise de Sequência de RNA; Poluentes Químicos da Água/toxicidade

Palavras-chave

Pinniped; Polychlorinated biphenyls; RNA-seq; Ringed seal; Transcriptome; de novo assembly

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Contexto em Saúde: 12_ODS3_hazardous_contamination / 1_ASSA2030 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Indicadores Básicos de Saúde / Bifenilos Policlorados / Estruturas Animais / Focas Verdadeiras / Exposição Ambiental / Transcriptoma Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Etiology_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Aspecto: Determinantes_sociais_saude / Patient_preference Limite: Animals Idioma: En Revista: Aquat Toxicol Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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