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DNA barcoding of odonates from the Upper Plata basin: Database creation and genetic diversity estimation.
Koroiva, Ricardo; Pepinelli, Mateus; Rodrigues, Marciel Elio; Roque, Fabio de Oliveira; Lorenz-Lemke, Aline Pedroso; Kvist, Sebastian.
Afiliação
  • Koroiva R; Ecology and Conservation Graduate Program, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul, Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil.
  • Pepinelli M; Laboratório de Ecologia, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul, Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil.
  • Rodrigues ME; Department of Natural History, Royal Ontario Museum, Toronto, Ontario, Canada.
  • Roque FO; Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Toronto, Toronto, Ontario, Canada.
  • Lorenz-Lemke AP; Laboratório de Organismos Aquáticos, Universidade Estadual de Santa Cruz, Ilhéus, Bahia, Brazil.
  • Kvist S; Laboratório de Ecologia, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul, Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil.
PLoS One ; 12(8): e0182283, 2017.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28763495
ABSTRACT
We present a DNA barcoding study of Neotropical odonates from the Upper Plata basin, Brazil. A total of 38 species were collected in a transition region of "Cerrado" and Atlantic Forest, both regarded as biological hotspots, and 130 cytochrome c oxidase subunit I (COI) barcodes were generated for the collected specimens. The distinct gap between intraspecific (0-2%) and interspecific variation (15% and above) in COI, and resulting separation of Barcode Index Numbers (BIN), allowed for successful identification of specimens in 94% of cases. The 6% fail rate was due to a shared BIN between two separate nominal species. DNA barcoding, based on COI, thus seems to be a reliable and efficient tool for identifying Neotropical odonate specimens down to the species level. These results underscore the utility of DNA barcoding to aid specimen identification in diverse biological hotspots, areas that require urgent action regarding taxonomic surveys and biodiversity conservation.
Assuntos

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Variação Genética / Complexo IV da Cadeia de Transporte de Elétrons / Bases de Dados Genéticas / Biodiversidade / Código de Barras de DNA Taxonômico / Odonatos Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals País/Região como assunto: America do sul / Brasil Idioma: En Revista: PLoS One Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Variação Genética / Complexo IV da Cadeia de Transporte de Elétrons / Bases de Dados Genéticas / Biodiversidade / Código de Barras de DNA Taxonômico / Odonatos Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals País/Região como assunto: America do sul / Brasil Idioma: En Revista: PLoS One Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article