Prediction of bacterial small RNAs in the RsmA (CsrA) and ToxT pathways: a machine learning approach.

Fakhry, Carl Tony; Kulkarni, Prajna; Chen, Ping; Kulkarni, Rahul; Zarringhalam, Kourosh

Fakhry, Carl Tony; Kulkarni, Prajna; Chen, Ping; Kulkarni, Rahul; Zarringhalam, Kourosh.

Afiliação

Fakhry CT; Department of Computer Science, University of Massachusetts Boston, 100 Morrissey Boulevard, Boston, 02125, MA, USA.
Kulkarni P; Department of Physics, University of Massachusetts Boston, 100 Morrissey Boulevard, Boston, 02125, MA, USA.
Chen P; Department of Engineering, University of Massachusetts Boston, 100 Morrissey Boulevard, Boston, 02125, MA, USA.
Kulkarni R; Department of Physics, University of Massachusetts Boston, 100 Morrissey Boulevard, Boston, 02125, MA, USA.
Zarringhalam K; Department of Mathematics, University of Massachusetts Boston, 100 Morrissey Boulevard, Boston, 02125, MA, USA. kourosh.zarringhalam@umb.edu.

BMC Genomics ; 18(1): 645, 2017 Aug 22.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28830349

Assuntos

Proteínas de Bactérias/genética; Proteínas de Bactérias/metabolismo; Biologia Computacional/métodos; Aprendizado de Máquina; RNA Bacteriano/genética; Vibrio cholerae/genética; Sequência de Bases

Palavras-chave

Bacterial small RNA; Boltzmann; CsrA; Machine learning; RNA structure; RsmA; ToxT

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Contexto em Saúde: 3_ND Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas de Bactérias / Vibrio cholerae / RNA Bacteriano / Biologia Computacional / Aprendizado de Máquina Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: BMC Genomics Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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