DotAligner: identification and clustering of RNA structure motifs.

Smith, Martin A; Seemann, Stefan E; Quek, Xiu Cheng; Mattick, John S

Smith, Martin A; Seemann, Stefan E; Quek, Xiu Cheng; Mattick, John S.

Afiliação

Smith MA; RNA Biology and Plasticity Group, Garvan Institute of Medical Research, 384 Victoria Street, Sydney, NSW 2010, Australia. m.smith@garvan.org.au.
Seemann SE; St Vincent's Clinical School, Faculty of Medicine, UNSW Australia, Sydney, NSW 2010, Australia. m.smith@garvan.org.au.
Quek XC; Center for non-coding RNA in Technology and Health (RTH), University of Copenhagen, Groennegaardsvej 3, Frederiksberg, 1870, Denmark.
Mattick JS; Department of Veterinary and Animal Sciences, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, DK-1870, Frederiksberg, Denmark.

Genome Biol ; 18(1): 244, 2017 12 28.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29284541

Assuntos

Análise por Conglomerados; Biologia Computacional/métodos; Conformação de Ácido Nucleico; Motivos de Nucleotídeos; RNA/química; RNA/genética; Algoritmos; Sequência de Bases; Genômica/métodos; RNA/metabolismo; RNA não Traduzido/química; RNA não Traduzido/genética; Proteínas de Ligação a RNA/metabolismo; Reprodutibilidade dos Testes

Palavras-chave

Functional genome annotation; Functions of RNA structures; Machine learning; RNA structure clustering; RNAprotein interactions; Regulation by non-coding RNAs

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA / Análise por Conglomerados / Biologia Computacional / Motivos de Nucleotídeos / Conformação de Ácido Nucleico Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Idioma: En Revista: Genome Biol Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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