Structural significance of hypermodified nucleoside 5-carboxymethylaminomethyluridine (cmnm<sup>5</sup>U) from 'wobble' (34th) position of mitochondrial tRNAs: Molecular modeling and Markov state model studies.

Kumbhar, Navanath M; Gopal, Janhavi S

Structural significance of hypermodified nucleoside 5-carboxymethylaminomethyluridine (cmnm⁵U) from 'wobble' (34th) position of mitochondrial tRNAs: Molecular modeling and Markov state model studies.

Kumbhar, Navanath M; Gopal, Janhavi S.

Afiliação

Kumbhar NM; Garware Research Centre, Department of Chemistry, Savitribai Phule Pune University (Formerly University of Pune), Pune, 411007, India. Electronic address: nmkumbhar@gmail.com.
Gopal JS; Institute of Bioinformatics and Biotechnology, Savitribai Phule Pune University (Formerly University of Pune), Pune, 411007, India.

J Mol Graph Model ; 86: 66-83, 2019 01.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30336453

Assuntos

Cadeias de Markov; Conformação Molecular; Simulação de Dinâmica Molecular; RNA Mitocondrial/química; RNA de Transferência/química; Uridina/análogos & derivados; Ligação de Hidrogênio; Análise Espectral; Uridina/química

Palavras-chave

Hypermodified nucleosides; Markov state model analysis; Mitochondrial tRNA modifications; Molecular dynamics simulations; cmnm(5)U((34))

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Uridina / RNA de Transferência / Cadeias de Markov / Simulação de Dinâmica Molecular / RNA Mitocondrial / Conformação Molecular Tipo de estudo: Health_economic_evaluation Idioma: En Revista: J Mol Graph Model Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

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