A benchmarking of pipelines for detecting ncRNAs from RNA-Seq data.

Di Bella, Sebastiano; La Ferlita, Alessandro; Carapezza, Giovanni; Alaimo, Salvatore; Isacchi, Antonella; Ferro, Alfredo; Pulvirenti, Alfredo; Bosotti, Roberta

Di Bella, Sebastiano; La Ferlita, Alessandro; Carapezza, Giovanni; Alaimo, Salvatore; Isacchi, Antonella; Ferro, Alfredo; Pulvirenti, Alfredo; Bosotti, Roberta.

Afiliação

Di Bella S; Oncology, Nerviano Medical Sciences, Nerviano, Milan, Italy.
La Ferlita A; Department of Clinical and Experimental Medicine, Bioinformatics Unit, University of Catania, Catania, Italy.
Carapezza G; Department of Physics and Astronomy, University of Catania, Catania, Italy.
Alaimo S; Oncology, Nerviano Medical Sciences, Nerviano, Milan, Italy.
Isacchi A; Department of Clinical and Experimental Medicine, Bioinformatics Unit, University of Catania, Catania, Italy.
Ferro A; Oncology, Nerviano Medical Sciences, Nerviano, Milan, Italy.
Pulvirenti A; Department of Clinical and Experimental Medicine, Bioinformatics Unit, University of Catania, Catania, Italy.
Bosotti R; Department of Clinical and Experimental Medicine, Bioinformatics Unit, University of Catania, Catania, Italy.

Brief Bioinform ; 21(6): 1987-1998, 2020 12 01.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31740918

Assuntos

Benchmarking; RNA não Traduzido; RNA-Seq; Sequência de Bases; Mapeamento Cromossômico; Perfilação da Expressão Gênica; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; RNA; RNA não Traduzido/genética; Análise de Sequência de RNA/métodos; Software; Sequenciamento do Exoma

Palavras-chave

NGS; RNA-Seq; RNA-Seq pipeline; ncRNAs

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Benchmarking / RNA não Traduzido / RNA-Seq Idioma: En Revista: Brief Bioinform Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article

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