Complete genome sequence and annotation of the laboratory reference strain Shigella flexneri serotype 5a M90T and genome-wide transcriptional start site determination.

Cervantes-Rivera, Ramón; Tronnet, Sophie; Puhar, Andrea

Cervantes-Rivera, Ramón; Tronnet, Sophie; Puhar, Andrea.

Afiliação

Cervantes-Rivera R; The Laboratory for Molecular Infection Medicine Sweden (MIMS), 901 87 Umeå, Sweden.
Tronnet S; Umeå Centre for Microbial Research (UCMR), 901 87, Umeå, Sweden.
Puhar A; Department of Molecular Biology, Umeå University, 901 87, Umeå, Sweden.

BMC Genomics ; 21(1): 285, 2020 Apr 06.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32252626

Assuntos

Perfilação da Expressão Gênica/métodos; Anotação de Sequência Molecular/métodos; Shigella flexneri/genética; Sequenciamento Completo do Genoma/métodos; Regiões 5' não Traduzidas; Curadoria de Dados; Genoma Bacteriano; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Laboratórios; Plasmídeos/genética; Análise de Sequência de RNA; Shigella flexneri/classificação; Biologia de Sistemas; Sítio de Iniciação de Transcrição

Palavras-chave

Chromosome; Genome; Insertion sequence; Pseudogene; RSAT; RegulonDB; Shigella flexneri serotype 5a M90T; TSS; Transcriptional start sites; Virulence plasmid; pWR100

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Contexto em Saúde: 3_ND Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Shigella flexneri / Perfilação da Expressão Gênica / Anotação de Sequência Molecular / Sequenciamento Completo do Genoma Idioma: En Revista: BMC Genomics Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article

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