Chromatin integration labeling for mapping DNA-binding proteins and modifications with low input.

Handa, Tetsuya; Harada, Akihito; Maehara, Kazumitsu; Sato, Shoko; Nakao, Masaru; Goto, Naoki; Kurumizaka, Hitoshi; Ohkawa, Yasuyuki; Kimura, Hiroshi

Handa, Tetsuya; Harada, Akihito; Maehara, Kazumitsu; Sato, Shoko; Nakao, Masaru; Goto, Naoki; Kurumizaka, Hitoshi; Ohkawa, Yasuyuki; Kimura, Hiroshi.

Afiliação

Handa T; Cell Biology Center, Institute of Innovative Research, Tokyo Institute of Technology, 4259 Nagatsuta, Midori-ku, Yokohama, Japan.
Harada A; Division of Transcriptomics, Medical Institute of Bioregulation, Kyushu University, 3-1-1 Maidashi, Higashi-ku, Fukuoka, Japan.
Maehara K; Division of Transcriptomics, Medical Institute of Bioregulation, Kyushu University, 3-1-1 Maidashi, Higashi-ku, Fukuoka, Japan.
Sato S; Institute for Quantitative Biosciences, The University of Tokyo, 1-1-1 Yayoi, Bunkyo-ku, Tokyo, Japan.
Nakao M; Graduate School of Bioscience and Biotechnology, Tokyo Institute of Technology, 4259 Nagatsuta, Midori-ku, Yokohama, Japan.
Goto N; Graduate School of Bioscience and Biotechnology, Tokyo Institute of Technology, 4259 Nagatsuta, Midori-ku, Yokohama, Japan.
Kurumizaka H; Institute for Quantitative Biosciences, The University of Tokyo, 1-1-1 Yayoi, Bunkyo-ku, Tokyo, Japan.
Ohkawa Y; Division of Transcriptomics, Medical Institute of Bioregulation, Kyushu University, 3-1-1 Maidashi, Higashi-ku, Fukuoka, Japan. yohkawa@bioreg.kyushu-u.ac.jp.
Kimura H; Cell Biology Center, Institute of Innovative Research, Tokyo Institute of Technology, 4259 Nagatsuta, Midori-ku, Yokohama, Japan. hkimura@bio.titech.ac.jp.

Nat Protoc ; 15(10): 3334-3360, 2020 10.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32807906

Assuntos

Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação/métodos; Mapeamento Cromossômico/métodos; Proteínas de Ligação a DNA/análise; Animais; Linhagem Celular; Linhagem Celular Tumoral; Cromatina/metabolismo; Imunoprecipitação da Cromatina/métodos; Epigênese Genética/genética; Epigenômica/métodos; Biblioteca Gênica; Genoma; Genômica; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Histonas/metabolismo; Humanos; Camundongos; Processamento de Proteína Pós-Traducional/genética; Análise de Sequência de DNA/métodos; Fatores de Transcrição/metabolismo; Transposases/metabolismo

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Mapeamento Cromossômico / Proteínas de Ligação a DNA / Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Nat Protoc Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article

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