Decoy selection for protein structure prediction via extreme gradient boosting and ranking.

Akhter, Nasrin; Chennupati, Gopinath; Djidjev, Hristo; Shehu, Amarda

Akhter, Nasrin; Chennupati, Gopinath; Djidjev, Hristo; Shehu, Amarda.

Afiliação

Akhter N; Department of Computer Science, George Mason University, Fairfax, 22030, VA, USA.
Chennupati G; Information Sciences (CCS-3) Group, Los Alamos National Laboratory, Bikini At al Rd., Los Alamos, 87545, USA. gchennupati@lanl.gov.
Djidjev H; Information Sciences (CCS-3) Group, Los Alamos National Laboratory, Bikini At al Rd., Los Alamos, 87545, USA.
Shehu A; Department of Computer Science, George Mason University, Fairfax, 22030, VA, USA.

BMC Bioinformatics ; 21(Suppl 1): 189, 2020 Dec 09.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33297949

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Proteínas/química; Análise por Conglomerados; Aprendizado de Máquina; Conformação Proteica; Dobramento de Proteína; Termodinâmica

Palavras-chave

Basins; Decoy selection; Energy landscape; Machine learning; Purity; Ranking; XGBoost

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas / Biologia Computacional Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article

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