Accurate transcriptome assembly by Nanopore RNA sequencing reveals novel functional transcripts in hepatocellular carcinoma.

Fang, Yuanchang; Chen, Geng; Chen, Feng; Hu, En; Dong, Xiuqing; Li, Zhenli; He, Lei; Sun, Yupeng; Qiu, Liman; Xu, Haipo; Cai, Zhixiong; Liu, Xiaolong

Fang, Yuanchang; Chen, Geng; Chen, Feng; Hu, En; Dong, Xiuqing; Li, Zhenli; He, Lei; Sun, Yupeng; Qiu, Liman; Xu, Haipo; Cai, Zhixiong; Liu, Xiaolong.

Afiliação

Fang Y; The United Innovation of Mengchao Hepatobiliary Technology Key Laboratory of Fujian Province, Mengchao Hepatobiliary Hospital of Fujian Medical University, Fuzhou, China.
Chen G; The Liver Center of Fujian Province, Fujian Medical University, Fuzhou, China.
Chen F; Mengchao Med-X Center, Fuzhou University, Fuzhou, China.
Hu E; The United Innovation of Mengchao Hepatobiliary Technology Key Laboratory of Fujian Province, Mengchao Hepatobiliary Hospital of Fujian Medical University, Fuzhou, China.
Dong X; The Liver Center of Fujian Province, Fujian Medical University, Fuzhou, China.
Li Z; Mengchao Med-X Center, Fuzhou University, Fuzhou, China.
He L; The United Innovation of Mengchao Hepatobiliary Technology Key Laboratory of Fujian Province, Mengchao Hepatobiliary Hospital of Fujian Medical University, Fuzhou, China.
Sun Y; The Liver Center of Fujian Province, Fujian Medical University, Fuzhou, China.
Qiu L; Mengchao Med-X Center, Fuzhou University, Fuzhou, China.
Xu H; The United Innovation of Mengchao Hepatobiliary Technology Key Laboratory of Fujian Province, Mengchao Hepatobiliary Hospital of Fujian Medical University, Fuzhou, China.
Cai Z; The Liver Center of Fujian Province, Fujian Medical University, Fuzhou, China.
Liu X; Mengchao Med-X Center, Fuzhou University, Fuzhou, China.

Cancer Sci ; 112(9): 3555-3568, 2021 Sep.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34255396

Assuntos

Carcinoma Hepatocelular/genética; Confiabilidade dos Dados; Neoplasias Hepáticas/genética; Sequenciamento por Nanoporos/métodos; Análise de Sequência de RNA/métodos; Transcriptoma; Idoso; Carcinoma Hepatocelular/patologia; Carcinoma Hepatocelular/cirurgia; Biologia Computacional/métodos; Progressão da Doença; Feminino; Perfilação da Expressão Gênica/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Humanos; Neoplasias Hepáticas/patologia; Neoplasias Hepáticas/cirurgia; Masculino; Pessoa de Meia-Idade; Prognóstico; RNA Longo não Codificante/genética; RNA Mensageiro/genética; Software

Palavras-chave

CDO1; CYP2A6; Nanopore sequencing; hepatocellular carcinoma; novel transcript

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Análise de Sequência de RNA / Carcinoma Hepatocelular / Transcriptoma / Confiabilidade dos Dados / Sequenciamento por Nanoporos / Neoplasias Hepáticas Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Aged / Female / Humans / Male / Middle aged Idioma: En Revista: Cancer Sci Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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