Profiling Cellular Ecosystems at Single-Cell Resolution and at Scale with EcoTyper.

Steen, Chloé B; Luca, Bogdan A; Alizadeh, Ash A; Gentles, Andrew J; Newman, Aaron M

Steen, Chloé B; Luca, Bogdan A; Alizadeh, Ash A; Gentles, Andrew J; Newman, Aaron M.

Afiliação

Steen CB; Department of Biomedical Data Science, Stanford University, Stanford, CA, USA.
Luca BA; Department of Medical Genetics, Oslo University Hospital, Oslo, Norway.
Alizadeh AA; Division of Oncology, Department of Medicine, Stanford University, Stanford, CA, USA.
Gentles AJ; Department of Biomedical Data Science, Stanford University, Stanford, CA, USA.
Newman AM; Stanford Center for Biomedical Informatics Research, Department of Medicine, Stanford University, Stanford, CA, USA.

Methods Mol Biol ; 2629: 43-71, 2023.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-36929073

Assuntos

Ecossistema; Nível de Saúde; Aprendizado de Máquina; Perfilação da Expressão Gênica; Análise de Célula Única; Transcriptoma

Palavras-chave

Cell states; Ecosystems; Ecotypes; Single-cell RNA sequencing; Spatial transcriptomics; Tissue heterogeneity; Transcriptomics; Tumor microenvironment

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Nível de Saúde / Ecossistema Aspecto: Determinantes_sociais_saude / Patient_preference Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article

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