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A New Perspective for Vineyard Terroir Identity: Looking for Microbial Indicator Species by Long Read Nanopore Sequencing.
Cruz-Silva, Ana; Laureano, Gonçalo; Pereira, Marcelo; Dias, Ricardo; Silva, José Moreira da; Oliveira, Nuno; Gouveia, Catarina; Cruz, Cristina; Gama-Carvalho, Margarida; Alagna, Fiammetta; Duarte, Bernardo; Figueiredo, Andreia.
Afiliação
  • Cruz-Silva A; Biosystems & Integrative Sciences Institute (BioISI), Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 1749-016 Lisboa, Portugal.
  • Laureano G; Grapevine Pathogen Systems Lab, BioISI Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 1749-016 Lisboa, Portugal.
  • Pereira M; Biosystems & Integrative Sciences Institute (BioISI), Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 1749-016 Lisboa, Portugal.
  • Dias R; Grapevine Pathogen Systems Lab, BioISI Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 1749-016 Lisboa, Portugal.
  • Silva JMD; Biosystems & Integrative Sciences Institute (BioISI), Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 1749-016 Lisboa, Portugal.
  • Oliveira N; Biosystems & Integrative Sciences Institute (BioISI), Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 1749-016 Lisboa, Portugal.
  • Gouveia C; Departamento de Biologia Vegetal, Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Campo Grande, 1749-016 Lisboa, Portugal.
  • Cruz C; Quinta dos Murças, Esporão Company, Covelinhas, 5050-011 Peso da Régua, Portugal.
  • Gama-Carvalho M; NBI-Natural Business Intelligence, Regia Douro Park, 5000-033 Vila Real, Portugal.
  • Alagna F; Biosystems & Integrative Sciences Institute (BioISI), Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 1749-016 Lisboa, Portugal.
  • Duarte B; Grapevine Pathogen Systems Lab, BioISI Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 1749-016 Lisboa, Portugal.
  • Figueiredo A; Departamento de Biologia Vegetal, Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Campo Grande, 1749-016 Lisboa, Portugal.
Microorganisms ; 11(3)2023 Mar 06.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-36985245
ABSTRACT
Grapevine is one of the most important fruit crops worldwide, being Portugal one of the top wine producers. It is well established that wine sensory characteristics from a particular region are defined by the physiological responses of the grapevine to its environment and thus, the concept of terroir in viticulture was established. Among all the factors that contribute to terroir definition, soil microorganisms play a major role from nutrient recycling to a drastic influence on plant fitness (growth and protection) and of course wine production. Soil microbiome from four different terroirs in Quinta dos Murças vineyard was analysed through long-read Oxford Nanopore sequencing. We have developed an analytical pipeline that allows the identification of function, ecologies, and indicator species based on long read sequencing data. The Douro vineyard was used as a case study, and we were able to establish microbiome signatures of each terroir.
Palavras-chave

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Microorganisms Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Microorganisms Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article