Outbreak of Multidrug-resistant Acinetobacter baumannii in a Tertiary Health Center from Northwestern Nigeria.

ABSTRACT

Background: In spite of its global notoriety and WHO alarm, Acinetobacter baumannii is still an understudied critical-priority pathobiont in Nigeria. We characterized its antimicrobial susceptibility profile and resistance genes during an outbreak. Materials and Methods: This cross-sectional study involved collection of patients' urine samples and swabs from unit staff's hands and ward environments for the identification of A. baumannii strains using standard morphologic and biochemical methods. The disk diffusion method was used to assess the antimicrobial susceptibility profile of the isolates with the production of extended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) confirmed by the combined disk test screening method. Characterization of the resistance genes of the ESBL producers was carried out using polymerase chain reaction polymerase chain reaction technique. Results: A.total of eight (six clinical and two nonclinical) A. baumannii isolates were identified. The overall isolate susceptibility and resistance rates to all the antimicrobial agents was 56.3% (27/48) and 35.4% (17/48), respectively. Similarly, all (8/8; 100.00%) isolates were susceptible to meropenem and 75.0% (6/8) to ampicillin-sulbactam while 62.5% (5/8) were resistant to trimethoprim-sulfamethoxazole and 50.0% (4/8) to each of ciprofloxacin and ceftazidime. In addition, 37.5% (3/8) of the isolates were multidrug resistant (MDR) with nonclinical isolates exhibiting more antimicrobial resistance than their clinical counterparts (9/12%-75.0% vs. 8/36%-22.2%). Phenotypic detection and molecular characterization revealed three ESBL-producing isolates that each harbored blaSHV and blaTEM genes with blaCTX-M gene being absent. Conclusion: MDR strains of A. baumannii harboring blaSHV and blaTEM genes were recovered from clinical and environmental sources during the outbreak, which was contained with preventive measures recommended.

Résumé En dépit des alertes faites par l'organisation mondiale de la Santé (OMS), Acinetobacter baumannii demeure un pathobiont sous-étudié et très peu priorisé au Nigeria. Nous avons procedé à sa caractérisation phénotypique et génotypique en dressant son profil de sensibilité aux antimicrobiens et ainsi que les gènes de résistance impliqués au cours d'une épidémie. Matériel et méthodes Cette étude transversale a consisté à collecter des échantillons d'urine de patients et des écouvillons des mains du personnel des soins et de l'environnement hospitalier. L'identification des souches d' A. baumannii était faite par des méthodes bactériologiques standard. le profil de sensibilité aux antimicrobiens des isolats a été faite par la méthode de diffusion de disque , les bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE) étaient recherchée par la méthode de dépistage combinée de disque ainsi que leur caractérisation moléculaire par la mise en évidence des gènes de résistance BLSE à l'aide d'une PCR (réaction en chaîne par polymérase). Résultats Au total, huit isolats d'A. baumannii (6 cliniques et 2 de l'environnement) ont été identifiés. Les taux globaux de sensibilité et de résistance des isolats à tous les agents antimicrobiens étaient respectivement de 56,3 % (27/48) et de 35,4 % (17/48). De même, tous les isolats (8/8 ; 100,00 %) étaient sensibles au méropénème et 75,0 % (6/8) à l'ampicilline-sulbactam, tandis que 62,5 % (5/8) étaient résistants au triméthoprime-sulfaméthoxazole et 50,0 % (4/8) à la ciprofloxacine et à la ceftazidime. En outre, 37,5 % (3/8) des isolats étaient multirésistants (MDR), les isolats non cliniques présentant une plus grande résistance aux antimicrobiens que leurs homologues cliniques (9/12 %-75,0 % contre 8/36 %-22,2 %). La détection phénotypique et la caractérisation moléculaire ont révélé trois isolats producteurs de BLSE qui hébergeaient chacun les gènes blaSHV et blaTEM, le gène blaCTX-M étant absent. Conclusion: Des souches multirésistantes d'A. baumannii portant les gènes blaSHV et blaTEM ont été identifiées sur des prélevements cliniques et environnementaux au cours de l'épidémie, qui a été gerée grâce aux mesures préventives recommandées. Mots-clés Surveillance de la résistance aux antimicrobiens, blaSHV carbapénème, pathogène ESKAPE, infections associées aux soins de santé, pratiques de prévention et de contrôle des infections, one health, uropathogènes.