SSR and ISSR markers in assessing genetic diversity in Gallus gallus domesticus: a quantitative analysis of scientific production / Marcadores SSR e ISSR na avaliação da diversidade genética em Gallus gallus domesticus: uma análise quantitativa da produção científica

Poultry meat is a major source of animal protein in the world. Research indicates a high inbreeding rate derived from a relative absence of heterozygous subpopulations of chicken from different suppliers. Molecular markers can provide information for the genetic basis of chicken consumed in rural areas and help establishing a chicken database for product quality and warranty. The bibliometric research, comprises between 1994 and 2018, from five previously selected databases: Google Scholar, PubMed, ScienceDirect, Scopus and Web of Science, using the following descriptors: microsatellites, SSR, ISSR, genetic variability and genetic diversity, all of them coupled to chicken and/or birds results in 66 scientific publications. The publications were then categorized according to their titles to the use of ISSR or SSR markers. They were also addressed by countries according first author cited. The publications data appointed that countries with the height production of poultry meat and hens are the most interested in the genetic diversity study of these species. The SSR markers, due to its more specific characteristic, are more frequently applied to genetic diversity assignment, compared to ISSR.(AU)

A carne de frango é uma das principais fontes de proteína animal do mundo. Pesquisas indicam uma alta taxa de endogamia derivada de uma relativa ausência de subpopulações heterozigotas de frango de diferentes fornecedores. Marcadores moleculares podem fornecer informações para a base genética de frango consumido em áreas rurais, e ajudar a estabelecer um banco de dados de frango para qualidade e garantia do produto. A pesquisa bibliométrica compreende entre 1994 e 2018, a partir de cinco bancos de dados selecionados anteriormente: Google Scholar, PubMed, ScienceDirect, Scopus e Web of Science, usando os seguintes descritores: microssatélites, SSR, ISSR, variabilidade genética e diversidade genética, todos eles associados a resultados de galinha e / ou aves o que resultou em 66 publicações científicas. As publicações foram então categorizadas de acordo com seus títulos para o uso de marcadores ISSR ou SSR. Eles também foram abordados pelos países, segundo o primeiro autor citado. Os dados das publicações obtidas apontam que os países com grande produção de carnes de frangos são os mais interessados no estudo da diversidade genética dessas espécies. Os marcadores SSR, devido à sua característica mais específica, são frequentemente aplicados à atribuição de diversidade genética, em comparação com o ISSR.(AU)

Survey and morphological characterization of Brazilian local goat breed Gurgueia in its origin / Inventário e caracterização morfológica de caprinos Gurgueia no Estado do Piauí

The purpose of this study was to conduct the inventory of goat breed Gurgueia in the state of Piauí, Northeast region of Brazil. The inventory includes a historical survey - made by searching in the literature - and a population survey - made by gathering in loco information. The geographic location through GPS was taken in farms sheltering Gurgueia goats and then individuals Gurgueia were counted to estimate population size and classifying the risk of extinction. To characterize the Gurgueia breed, the presence of beard, horns, earrings, patterns of color roan, agouti and brown, and the presence of reduced ear were observed to perform simple descriptive analysis. The regional literature demonstrates lack of consistency about the origin of the Gurgueia breed. However, flocks of goats in the Gurgueia river valley, in Southern Piauí, gave origin to the breed denomination. The present study found out 119 Gurgueia individuals scattered in three micro-regions - classifying the Gurgueia breed as critically endangered. The morphological analysis shows low frequency of earrings (0,05) and high frequency of horn (0.95) in Gurgéia individuals. The beard frequency was 0.52 and was verified absence of long hairs, indicating no relationship between those. The analysis showed high frequency of roan pattern (0.96), absence of brown and single coat pattern (non-agouti). Reduced ear was absent.(AU)

Objetivou-se com este trabalho realizar o inventário do ecótipo Gurgueia no Estado do Piauí, na região Nordeste do Brasil. O inventário compreendeu o levantamento histórico, com busca em literaturas, e o populacional feito a partir de visitas in loco nos rebanhos. Foi tomado em cada rebanho a localização geográfica por meio o por GPS e contagem dos animais com padrão fenotípico Gurgueia para classifica-la quanto ao risco de extinção. Observou-se a presença dos caracteres barba, chifres, brincos, os padrões de cor ruão, agouti e chocolate, e a presença de orelha reduzida que foram submetidos à análise descritivas simples. A literatura regional consultada não apresentou consistência sobre a origem do caprino Gurgueia no Piauí, mas indicaram que rebanhos instalados no vale do rio Gurgueia no Sul do Piauí, deram origem aos hoje classificados como Gurgueia. No estudo, houve a confirmação de poucos exemplares, apenas 119, dispersos em três microrregiões revelando que grupo genético Gurgueia está em situação crítica de desaparecimento. Nestes animais, observa-se alta frequência da ausência de brincos e do caráter presença de chifre (0,95). A frequência de barba foi de 0,52 e não houve ocorrência de pelos longos, indicando ausência da relação entre esses caracteres. O caráter ruão (0,96), a pelagem chocolate e padrão não-agouti (cor única) não estiveram presentes assim como a presença(AU)

Survey and morphological characterization of Brazilian local goat breed Gurgueia in its origin / Inventário e caracterização morfológica de caprinos Gurgueia no Estado do Piauí

The purpose of this study was to conduct the inventory of goat breed Gurgueia in the state of Piauí, Northeast region of Brazil. The inventory includes a historical survey - made by searching in the literature - and a population survey - made by gathering in loco information. The geographic location through GPS was taken in farms sheltering Gurgueia goats and then individuals Gurgueia were counted to estimate population size and classifying the risk of extinction. To characterize the Gurgueia breed, the presence of beard, horns, earrings, patterns of color roan, agouti and brown, and the presence of reduced ear were observed to perform simple descriptive analysis. The regional literature demonstrates lack of consistency about the origin of the Gurgueia breed. However, flocks of goats in the Gurgueia river valley, in Southern Piauí, gave origin to the breed denomination. The present study found out 119 Gurgueia individuals scattered in three micro-regions - classifying the Gurgueia breed as critically endangered. The morphological analysis shows low frequency of earrings (0,05) and high frequency of horn (0.95) in Gurgéia individuals. The beard frequency was 0.52 and was verified absence of long hairs, indicating no relationship between those. The analysis showed high frequency of roan pattern (0.96), absence of brown and single coat pattern (non-agouti). Reduced ear was absent.

Objetivou-se com este trabalho realizar o inventário do ecótipo Gurgueia no Estado do Piauí, na região Nordeste do Brasil. O inventário compreendeu o levantamento histórico, com busca em literaturas, e o populacional feito a partir de visitas in loco nos rebanhos. Foi tomado em cada rebanho a localização geográfica por meio o por GPS e contagem dos animais com padrão fenotípico Gurgueia para classifica-la quanto ao risco de extinção. Observou-se a presença dos caracteres barba, chifres, brincos, os padrões de cor ruão, agouti e chocolate, e a presença de orelha reduzida que foram submetidos à análise descritivas simples. A literatura regional consultada não apresentou consistência sobre a origem do caprino Gurgueia no Piauí, mas indicaram que rebanhos instalados no vale do rio Gurgueia no Sul do Piauí, deram origem aos hoje classificados como Gurgueia. No estudo, houve a confirmação de poucos exemplares, apenas 119, dispersos em três microrregiões revelando que grupo genético Gurgueia está em situação crítica de desaparecimento. Nestes animais, observa-se alta frequência da ausência de brincos e do caráter presença de chifre (0,95). A frequência de barba foi de 0,52 e não houve ocorrência de pelos longos, indicando ausência da relação entre esses caracteres. O caráter ruão (0,96), a pelagem chocolate e padrão não-agouti (cor única) não estiveram presentes assim como a presença

Adaptability of goats kept in Saanen and Marota semi moist tropicalclimate / Adaptabilidade de caprinos Sannen e Marota mantidos em clima tropical semiúmido

The study aimed to assess the environmental parameters and physiological parameters and Saanen goats and Marota in Teresina, Piauí State, Brazil, in the rainy and dry periods during the months from april to november. We used adult female Saanen goats (n = 7) and Marota (n = 7), clinically healthy, the same age group and subject to the same management conditions. The physiological indices were heart rate (HR), respiratory rate (RR) and rectal temperature (RT) in schedules 7-8, 10-11, 14-15 and 1718 hours. The environmental indices analyzed were room temperature, relative humidity, black globe temperature index and temperature and humidity index. The results of the environmental parameters show that the dry period is more stressful than the rainy and the afternoon shift is more stressful than the morning and among these parameters, it is observed that the relative humidity has the opposite behavior of the temperature air, temperature and black globe temperature and humidity index, showing higher values in the rainy season and in the morning shift. Regarding the physiological parameters of the animals, it was observed that all animals were able to maintain rectal temperature within normal limits and the respiratory rate was the most sensitive indicator of stress, showing that the animals Marota race had lower values and more close to normal, indicating greater adaptability(AU)

Objetivou-se com este trabalho avaliar os parâmetros ambientais e os parâmetros e fisiológicos dos caprinos Saanen e Marota na cidade de Teresina, estado do Piauí, Brasil, nos períodos chuvosos e secos, durante os meses de abril a novembro. Utilizaram-se fêmeas caprinas adultas Saanen (n=7) e Marota (n=7), clinicamente saudáveis, de mesmas faixas etárias e submetidas às mesmas condições de manejo. Os índices fisiológicos foram a frequência cardíaca (FC), frequência respiratória (FR) e temperatura retal (TR) nos horários de 7-8, 10-11, 14-15 e 17-18horas. Os índices ambientais analisados foram a temperatura ambiente, umidade relativa do ar,temperatura de globo negro e índices de temperatura e umidade. Os resultados dos parâmetros ambientais mostram que o período seco é mais estressante que o chuvoso e que o turno da tarde é mais estressante que o da manhã e, dentre os esses parâmetros, observa-se que a umidade relativa do ar tem comportamento inverso ao da temperatura do ar, temperatura de globo negro e índices de temperatura e umidade, mostrando maiores valores no período chuvoso e no turno da manhã. Quanto aos parâmetros fisiológicos dos animais, observou-se que todos os animais conseguiram manter a temperatura retal dentro dos limites normais, e que a frequência respiratória foi o indicador de estresse mais sensível, mostrando que os animais da raça Marota(AU)

Adaptability of goats kept in Saanen and Marota semi moist tropicalclimate / Adaptabilidade de caprinos Sannen e Marota mantidos em clima tropical semiúmido

The study aimed to assess the environmental parameters and physiological parameters and Saanen goats and Marota in Teresina, Piauí State, Brazil, in the rainy and dry periods during the months from april to november. We used adult female Saanen goats (n = 7) and Marota (n = 7), clinically healthy, the same age group and subject to the same management conditions. The physiological indices were heart rate (HR), respiratory rate (RR) and rectal temperature (RT) in schedules 7-8, 10-11, 14-15 and 1718 hours. The environmental indices analyzed were room temperature, relative humidity, black globe temperature index and temperature and humidity index. The results of the environmental parameters show that the dry period is more stressful than the rainy and the afternoon shift is more stressful than the morning and among these parameters, it is observed that the relative humidity has the opposite behavior of the temperature air, temperature and black globe temperature and humidity index, showing higher values in the rainy season and in the morning shift. Regarding the physiological parameters of the animals, it was observed that all animals were able to maintain rectal temperature within normal limits and the respiratory rate was the most sensitive indicator of stress, showing that the animals Marota race had lower values and more close to normal, indicating greater adaptability

Objetivou-se com este trabalho avaliar os parâmetros ambientais e os parâmetros e fisiológicos dos caprinos Saanen e Marota na cidade de Teresina, estado do Piauí, Brasil, nos períodos chuvosos e secos, durante os meses de abril a novembro. Utilizaram-se fêmeas caprinas adultas Saanen (n=7) e Marota (n=7), clinicamente saudáveis, de mesmas faixas etárias e submetidas às mesmas condições de manejo. Os índices fisiológicos foram a frequência cardíaca (FC), frequência respiratória (FR) e temperatura retal (TR) nos horários de 7-8, 10-11, 14-15 e 17-18horas. Os índices ambientais analisados foram a temperatura ambiente, umidade relativa do ar,temperatura de globo negro e índices de temperatura e umidade. Os resultados dos parâmetros ambientais mostram que o período seco é mais estressante que o chuvoso e que o turno da tarde é mais estressante que o da manhã e, dentre os esses parâmetros, observa-se que a umidade relativa do ar tem comportamento inverso ao da temperatura do ar, temperatura de globo negro e índices de temperatura e umidade, mostrando maiores valores no período chuvoso e no turno da manhã. Quanto aos parâmetros fisiológicos dos animais, observou-se que todos os animais conseguiram manter a temperatura retal dentro dos limites normais, e que a frequência respiratória foi o indicador de estresse mais sensível, mostrando que os animais da raça Marota