The Rv2807 target gene: a determining factor to directly detect Mycobacterium bovis from suspected bovine tuberculosis lesions / Gene alvo Rv2807: um fator determinante para detectar Mycobacterium bovis diretamente de lesões suspeitas de tuberculose bovina

Bovine tuberculosis (bTB) is a zoonosis caused by Mycobacterium bovis, a species belonging to the Mycobacterium tuberculosis complex (MTC) group. Direct bTB diagnosis from suggestive lesions can be performed by nested q-PCR targeting the Rv2807 gene present in the MTC group, as well as the TbD1 gene, present in M. bovis. In this context, the aim of the present study was to assess the importance of considering positive MTC results for the Rv2807 target gene obtained through the nested real time polymerase chain reaction (nested q-PCR) applied to samples obtained directly from suspected bTB lesions. A total of 174 samples of suggestive bTB caseous lesions were obtained during cattle slaughter in slaughterhouses in the state of Mato Grosso, Brazil. DNA was extracted from the lesions and nested q-PCR was performed to detect both MTC and M. bovis. Both samples positive for the Rv2807 (41/174) and TbD1 (29/174) were submitted to bacterial culturing (23/41), and the DNA of the isolates (23) was extracted and submitted again to nested q-PCR. The Rv2807 gene (MTC) was previously amplified by nested q-PCR directly from the lesions, although the TbD1 gene specific for M. bovis was not amplified previously in four of the successfully isolated samples (4/23), only following isolation, and only the Rv2807 gene was amplified before and after isolation. In conclusion, the target gene Rv2807(MTC) exhibited higher positivity in the analyzed samples compared to the TbD1 gene (M. bovis).

A tuberculose bovina (bTB) é uma zoonose causada pelo Mycobacterium bovis, uma espécie pertencente ao grupo do complexo Mycobacterium tuberculosis (MTC). O diagnóstico direto de bTB a partir de lesões sugestivas pode ser realizado por nested q-PCR visando o gene Rv2807 presente no grupo MTC, bem como o gene TbD1, presente em M. bovis. Nesse contexto, o objetivo do presente estudo foi avaliar a importância de considerar os resultados de MTC positivos para o gene alvo Rv2807 obtidos através da reação em cadeia da polimerase nested real time (nested q-PCR) aplicada a amostras obtidas diretamente de lesões suspeitas de bTB. Um total de 174 amostras de lesões caseosas sugestivas de bTB foram obtidas durante o abate de bovinos em frigoríficos do estado de Mato Grosso, Brasil. DNA foi extraído das lesões e nested q-PCR foi realizado para detectar tanto MTC quanto M. bovis. Ambas as amostras positivas para Rv2807 (41/174) e TbD1 (29/174) foram submetidas a cultura bacteriana (23/41), e o DNA dos isolados (23) foi extraído e submetido novamente à nested q-PCR. O gene Rv2807 (MTC) foi previamente amplificado por nested q-PCR diretamente das lesões, embora o gene TbD1 específico para M. bovis não tenha sido amplificado anteriormente em quatro das amostras isoladas com sucesso (4/23), apenas após o isolamento, e apenas o gene Rv2807 foi amplificado antes e após o isolamento. Em conclusão, o gene alvo Rv2807 (MTC) apresentou maior positividade nas amostras analisadas em relação ao gene TbD1 (M. bovis).

Isolation of Escherichia coli and Staphylococcus aureusin raw milk from refrigeration tanks: identification and antimicrobial resistance profiles / Isolamento de Escherichia coli e Staphylococcus aureus em leite cru de tanques de refrigeração: identificação e perfis de resistência antimicrobiana

Escherichia coli and Staphylococcus aureus in milk cooling tank reflects a hygienic deficit in animal management, production environment, and milk obtainment. With implications for public health as agents of infection and food poisoning, and the presence of antimicrobial-resistant strains. Therefore, were investigated in cooling tanks with high counts of somatic cells and total bacteria in milk. Microorganisms, in which a profile of resistance to antimicrobials was investigated, and whether there was a similarity in this profile between the strains of the eight dairy properties.Therefore, eighty-eight samples were obtained, and inoculated on Compact Dry® plates. Of this total, 27.27% (24/88) samples tested positive for E. coli and 56.81% (50/88) for S. aureus. Among 24 E. coli strains subjected to disk-diffusion antibiograms, 70.83% were resistant to rifampicin, 50% to ampicillin and 41.67% to cefoxitin and erythromycin, while of the 51 S. aureus strains, 94.32% expressed resistance to azetroanam, 86.27% to ampicillin and nalidixic acid, 76.47% to rifampicin and 47.06 % to erythromycin and cefoxitin. A criterion of resistance to over three antibiotics was observed for 8.33% (2/24) of the isolated E. coli strains and 17.65% (9/51) of the S. aureus strains, characterizing them as multidrug resistant (MDR) strains. Resistance phenotypes displayed high similarity between properties F5 and F6 for S. aureus, and properties F6 and F8 for E. coli when applying the Jaccard index. The presence of these antibiotic-resistant pathogenic microorganisms indicate flaws in milk production handling and sanitary conditions, representing risk to milk consumers.(AU)

Escherichia coli e Staphylococcus aureus no tanque de resfriamento de leite refletem um déficit higiênico no manejo animal, ambiente de produção e obtenção de leite. Com implicações para a saúde pública como agentes de infecção e intoxica-ção alimentar e presença de cepas resistentes a antimicrobianos. Portanto, foram investigados em tanques de resfriamento com altas contagens de células somáticas e bactérias totais no leite. Microrganismos, nos quais foi investigado o perfil de resistência aos antimicrobianos e se havia semelhança nesse perfil entre as cepas das oito propriedades leiteira. Para tanto, oitenta e oito amostras foram coletadas inoculadas em placas de Compact Dry®, destas 27,27% (24/88) amostras revelaram contaminação com E. coli, e 56,81% (50/88) com S. aureus. Entre 24 cepas de E. coli submetidas a antibiograma por disco-difusão 70,83% foram resistentes a rifampicina, 50% ampicilina, 41,67% cefoxitina e eritromicina, enquanto das 51 cepas de S. aureus 94,32% expressaram resistência a azetroanam, 86,27% a ampicilina e nalidíxico ácido, 76,47 % a rifampicina, e 47,06% a cefoxitina e eritromicina. O critério de resistência a mais de três antibióticos caracterizou 8,33% (2/24) das cepas de E. coli, e 17,65% (9/51) de S. aureus como multidroga resistente (MDR). O fenótipo resistência mostrou elevada similaridade entre as proprie-dades (F5 e F6) para S. aureus, e das propriedades (F6 e F8) para E. coli aplicando-se o índice de Jaccard. Estes microrganis-mos patogênicos resistentes a antibióticos, indicam falhas no manuseio e obtenção higiênica do leite, e que estes representam risco aos consumidores do leite.(AU)

Hygienic sanitary conditions of vacuum packed beef produced by slaughterhouses qualified for export in the Mato Grosso state, Brazil / Condições higiênico sanitárias de carne embalada a vácuo produzida por abatedouros frigoríficos habilitados a exportação no estado de Mato Grosso, Brasil

Brazil is the largest exporter of beef of the world and Mato Grosso State is the highest beef producer in this country. To maintain product competitiveness and market expansion, sanitary hygienic control of the entire process is indispensable to ensure the attainment of harmless beef and quality. The objective of this study was to evaluate the hygienic sanitary conditions of vacuum-packed beef produced by establishments qualified for export in the state of Mato Grosso, Brazil. A total of 60 samples were submitted to coliforms counts at 35°C and at 45°C and E. coli. The mean contamination by at 35°C and coliforms at 45°C were 3,1 x 102MPN/g and 7.7MPN/g respectively. The presence of E. coli was verified in five samples, representing an occurrence of 8.3% (5/60), and Salmonella spp. in 5% (03/60) of the analyzed samples. The MPN (Most Probable Number) average of coliforms at 35°C and 45°C are in accordance to national and international legislation; however, the presence of Samonella spp., E. coli in some sample indicates a low risk of occurrence of salmonellosis and colibacillosis transmitted by the evaluated beef. However, transmission risk of these diseases cannot be ruled out, since the presence of E. coli does not depend on the amount of coliforms and national legal standards established for the group of thermotolerant coliforms.

O Brasil é o maior exportador de carne bovina do mundo e Mato Grosso é o maior produtor de carne bovina do país. Para manter a competitividade do produto e a expansão do mercado, o controle higiênico sanitário de todo o processo é indispensável para garantir a obtenção de carne inócua e de qualidade. O objetivo desse estudo foi avaliar as condições higiênico sanitárias da carne bovina resfriada embalada a vácuo, não maturada produzida por estabelecimentos detentores de Serviço de Inspeção Federal (SIF) no estado de Mato Grosso. Um total de 60 amostras foram submetidas a contagem de coliformes à 35°C, coliformes à 45°C, pesquisa de E. coli e Salmonella spp. A contaminação média por coliformes à 35°C e coliformes à 45°C da carne bovina mato-grossense inspecionada pelo SIF foi 3,1 x 102NMP/g e 7,7NMP/g, respectivamente. A presença de E. coli foi verificada em cinco amostras o que representou uma ocorrência de 8,3% (5/60) e Salmonella spp. em 5% (3/60). Foi avaliado que a média NMP de coliformes à 35°C e à 45°C atende a legislação nacional e internacional, no entanto, a verificação da presença de Salmonella spp., E. coli em algumas amostras, evidenciou um baixo risco de ocorrência de salmonelose ou colibacilose transmitidas pela carne. Ainda assim, não se pode descartar o risco de veiculação dessas doenças, uma vez que a presença de E. coli independe da quantidade de coliformes e dos padrões legais nacionais estabelecidos para o grupo dos coliformes termotolerantes.

Hygienic sanitary conditions of vacuum packed beef produced by slaughterhouses qualified for export in the Mato Grosso state, Brazil / Condições higiênico sanitárias de carne embalada a vácuo produzida por abatedouros frigoríficos habilitados a exportação no estado de Mato Grosso, Brasil

Brazil is the largest exporter of beef of the world and Mato Grosso State is the highest beef producer in this country. To maintain product competitiveness and market expansion, sanitary hygienic control of the entire process is indispensable to ensure the attainment of harmless beef and quality. The objective of this study was to evaluate the hygienic sanitary conditions of vacuum-packed beef produced by establishments qualified for export in the state of Mato Grosso, Brazil. A total of 60 samples were submitted to coliforms counts at 35°C and at 45°C and E. coli. The mean contamination by at 35°C and coliforms at 45°C were 3,1 x 102MPN/g and 7.7MPN/g respectively. The presence of E. coli was verified in five samples, representing an occurrence of 8.3% (5/60), and Salmonella spp. in 5% (03/60) of the analyzed samples. The MPN (Most Probable Number) average of coliforms at 35°C and 45°C are in accordance to national and international legislation; however, the presence of Samonella spp., E. coli in some sample indicates a low risk of occurrence of salmonellosis and colibacillosis transmitted by the evaluated beef. However, transmission risk of these diseases cannot be ruled out, since the presence of E. coli does not depend on the amount of coliforms and national legal standards established for the group of thermotolerant coliforms.(AU)

O Brasil é o maior exportador de carne bovina do mundo e Mato Grosso é o maior produtor de carne bovina do país. Para manter a competitividade do produto e a expansão do mercado, o controle higiênico sanitário de todo o processo é indispensável para garantir a obtenção de carne inócua e de qualidade. O objetivo desse estudo foi avaliar as condições higiênico sanitárias da carne bovina resfriada embalada a vácuo, não maturada produzida por estabelecimentos detentores de Serviço de Inspeção Federal (SIF) no estado de Mato Grosso. Um total de 60 amostras foram submetidas a contagem de coliformes à 35°C, coliformes à 45°C, pesquisa de E. coli e Salmonella spp. A contaminação média por coliformes à 35°C e coliformes à 45°C da carne bovina mato-grossense inspecionada pelo SIF foi 3,1 x 102NMP/g e 7,7NMP/g, respectivamente. A presença de E. coli foi verificada em cinco amostras o que representou uma ocorrência de 8,3% (5/60) e Salmonella spp. em 5% (3/60). Foi avaliado que a média NMP de coliformes à 35°C e à 45°C atende a legislação nacional e internacional, no entanto, a verificação da presença de Salmonella spp., E. coli em algumas amostras, evidenciou um baixo risco de ocorrência de salmonelose ou colibacilose transmitidas pela carne. Ainda assim, não se pode descartar o risco de veiculação dessas doenças, uma vez que a presença de E. coli independe da quantidade de coliformes e dos padrões legais nacionais estabelecidos para o grupo dos coliformes termotolerantes.(AU)

Use of PCR for detection of bovine tuberculosis bacillus in milk of positive skin test cows / Uso da PCR para detecção de bacilo da tuberculose bovina em leite de vacas positivas ao teste cutâneo

The causative agent of bovine tuberculosis (BTB) is Mycobacterium bovis, a bacterium belonging to the M. tuberculosiscomplex (MTC). The definitive diagnosis is achieved through isolation and identification of M. bovis from clinical samples, using a combination of traditional culture and biochemical methods, which is considered the “gold standard”. This procedure is cumbersome and time-consuming. We evaluated a PCR assay for the direct detection of MTC DNA in milk of positive skin test cows, using primers that were previously tested and proven reliable to target the IS6110element. Milk previously seeded with M. bovis was used as the starting material, for standardization of the technique. The procedure involved extracting the DNA by enzymatic lysis (proteinase K and lysozyme), phenol, chloroform, isoamyl alcohol, followed by ethanol precipitation and PCR. The PCR assay allowed us to detect BTB in artificially contaminated milk, with a detection limit of 100 CFU/mL, and was also able to detect the bacillus in 50% (75/150) of the milk samples tested. This procedure could be used to assist the in vivo diagnosis of BTB, complementing sorological or microbiological tests, becoming an alternative option for epidemiological studies of BTB transmission and preventing contaminated milk from entering the food supply.(AU)

O agente causador da tuberculose bovina (BTB) é o Mycobacterium bovis, uma bactéria pertencente ao complexo M. tuberculosis (CMT). O diagnóstico definitivo é realizado através do isolamento e identificação de M. bovis em amostras clínicas, utilizando uma combinação de cultura bacteriológica e métodos bioquímicos, que são considerados como “padrão de ouro”. Entretanto, esses procedimentos são trabalhosos e demorados. No presente estudo, foi avaliado um ensaio de PCR para a detecção direta de DNA de CMT em leite de vacas positivas ao teste cutâneo, utilizando primerspreviamente testados e comprovadamente confiáveis, para amplificação da região de interesse IS6110. Leite previamen- te contaminado com M. bovis foi utilizado como material de partida para a padronização da técnica. O procedimento envolveu a extração do DNA por lise enzimática (proteinase K e lisozima), fenol, clorofórmio, álcool isoamílico, segui- do de precipitação com etanol e PCR. O ensaio de PCR detectou BTB em leite artificialmente contaminado, com um limite de detecção de 100 UFC/mL, e também foi capaz de detectar o bacilo em 50% (75/150) das amostras de leite testadas. A técnica de PCR pode ser utilizada para auxiliar o diagnóstico in vivo da BTB, além de complementar os tes- tes sorológicos ou microbiológicos, tornando-se uma alternativa para estudos epidemiológicos da transmissão de BTB, prevenindo que o leite contaminado entre na cadeia de alimentos.(AU)