Genotype-environment interaction in the genetic analysis for weaning weight in Nelore cattle using bayesian approach - doi: 10.4025/actascianimsci.v33i2.8469 / Interação genótipo-ambiente na análise genética do peso ao desmame de bovinos Nelore sob enfoque bayesiano - doi: 10.4025/actascianimsci.v33i2.8469

The objective was to evaluate the interactions of genotype-environment effects on the components of (co)variance estimates and the prediction of breeding values for weaning weight in Nelore cattle, using a Bayesian approach. Records of 16,644 weaning weights were used from cattle distributed in ten ranches across six Brazilian states. The genetic parameters were estimated under an animal model considering Bayesian statistics. To verify genotype-environment interaction effects, we analyzed the following matrix model: without the inclusion of genotype-environment interaction effects, and with the inclusion of genotype-environment interaction effects, which considered the effect of sire-year, sire-herd, and both effects. In general, the results suggest that the inclusion of genotype-environment interaction in genetic analysis for weight at weaning tends to alter the estimates of genetic and environment (co)variances. The Spearman correlations between the breeding values were above 97%, indicating practically no change in the classification of animals evaluated. It can be inferred that the interaction effects of sire-year and sire-herd do not change the animals rank, and if not included in the genetic evaluation, the selection based on predictions of breeding values for weaning weight will not be affected.

Objetivou-se avaliar os efeitos das interações genótipo-ambiente sobre as estimativas de componentes de (co)variâncias e predição dos valores genéticos para o peso ao desmame de bovinos Nelore, sob enfoque bayesiano. Foram utilizados 16.644 registros de pesos ao desmame de bovinos provenientes de dez rebanhos participantes do Programa Nelore Brasil. Os parâmetros genéticos foram estimados sob modelo animal, considerando a estatística bayesiana. Para verificar o efeito da interação genótipo-ambiente, foram analisados os seguintes modelos matriciais: sem a inclusão dos efeitos de interação genótipo-ambiente; com a inclusão dos efeitos de interação genótipo-ambiente, em que se considerou o efeito de touro-ano, touro-rebanho e ambos os efeitos. De modo geral, verifica-se que a inclusão da interação genótipo-ambiente na análise genética para o peso ao desmame, tende a alterar as estimativas de (co)variâncias genéticas e ambientais. As correlações de Spearman entre os valores genéticos foram acima de 97%, indicando que, praticamente, não houve mudança na classificação dos animais avaliados. Pode se inferir que os efeitos de interação touro-ano e touro-rebanho não alteram as classificações dos animais, e a não-inclusão destes efeitos na avaliação genética, não afetam a seleção baseada nas predições dos valores genéticos para o peso ao desmame.

Genetic parameters stimates of young bulls Nelore cattle andrology traits using bayesian inference / Estimativas de parâmetros genéticos de características andrológicas de touros jovens da raça Nelore por meio da inferência bayesiana

The aim of this study was to predict genetic parameters of Nelore males reproductive traits, with age between 17 and 24 months, raised in the Middle-west of Brazil, using Bayesian inference. The group of data considered 1.265 breeding soundness evaluations obtained between 2001 and 2007, in four different properties. Records were obtained from the measure of the scrotal circumference and were evaluated the spermatic morphology. Animals were classified in apt to reproduction or sexually immature. The genetic parameters were estimated through the software THRGIBBS1F90, that uses bayesian inference under animal model. Among 1.265 animals evaluated, 880 (69.56%) were considered apt to reproduction and 385 (30.43%) sexually immature. The heritability estimates for scrotal circumference, larger defects, minor and total were 0.45; 0.13; 0.06 and 0.14, respectively. The estimates of genetic correlation between the scrotal circumference and these same traits were -0.24; -0.04 and -0.18, respectively. The results allowed to conclude that, except the scrotal circumference, all the other traits studied suffer environmental influences and the scrotal circumference would not be the most appropriate trait when the intention is to obtain improvement of the seminal qualitative aspects being advisable the identification of other traits that allow the obtaining genetic through the indirect progre

Objetivou-se com este estudo estimar parâmetros genéticos de características indicadoras da qualidade seminal de machos da raça Nelore, com idade entre 17 e 24 meses, criados na região Centro-Oeste do Brasil, com utilização da inferência bayesiana. O conjunto de dados considerou 1.265 avaliações andrológicas realizadas entre 2001 e 2007, em quatro propriedades diferentes. Obteve-se a medida do perímetro escrotal, realizou-se a avaliação da morfologia espermática e os animais foram classificados em aptos ou sexualmente imaturos. Os parâmetros genéticos foram estimados por meio do pacote computacional THRGIBBS1F90, que aplica a inferência bayesiana sob modelo animal. Dos 1.265 animais avaliados, 880 (69,56%) foram considerados aptos à reprodução e 385 (30,43%) sexualmente imaturos. As estimativas de herdabilidade obtidas para perímetro escrotal, defeitos maiores, menores e totais foram 0,45; 0,13; 0,06 e 0,14, respectivamente. As estimativas de correlação genética entre o perímetro escrotal e estas mesmas características foram -0,24; -0,04 e -0,18, respectivamente. Os resultados mostraram que, à exceção do perímetro escrotal, todas as outras características estudadas sofreram influência ambiental e o perímetro escrotal não seria a característica mais adequada quando o intuito é obter melhoria dos aspectos qualitativos seminais, sendo recomendável a identificação de outras caracte

Threshold and linear bayesian models in the genetic parameters estimation for morphological traits in Nelore cattle / Modelos bayesianos de limiar e linear na estimação de parâmetros genéticos para características morfológicas de bovinos da raça Nelore

It was aimed to compare the estimates of genetic parameters for body structure, finishing precocity and muscling obtained in single-trait and two-trait bayesian analyses under linear and threshold models. Visual scores obtained from 4,155 Nelore cattle at yearling, belonging to the Brazilian Nelore Program, were used. The animals were evaluated visually by method SAM (System of Morphologic Evaluation). Genetic parameters were estimated by single-trait bayesian analysis considering linear and threshold models (morphological traits) and two-trait bayesian analysis considering linear-linear and linear-threshold models (including the weight to the 120 days). In single-trait analysis, it was verified that heritability estimated were similar for both the models. When considering two-trait analysis, the heritability estimates obtained in the linear-linear model had presented greater magnitude than that in the linear-threshold model. However, the Spearman correlations among the breeding values for different models (linear or threshold and linear-linear or linear-threshold) showed low alteration in the placement of the animals, and it was an insufficient modification to alter their classification as for the percentile, in other words, all the animals TOP1%, when linear models were used, continued being TOP1% when used threshold models. In the genetic evaluation of animals for morphologi

Objetivou-se comparar as estimativas de parâmetros genéticos para as características morfológicas de estrutura corporal, precocidade de terminação e musculosidade, obtidas a partir de análises bayesianas, a partir dos modelos de limiar e linear. Foram utilizados dados de escores visuais, ao sobreano, de 4.155 bovinos da raça Nelore, pertencentes a rebanhos participantes do Programa Nelore Brasil da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores. Os animais foram avaliados visualmente pelo método denominado SAM (Sistema de Avaliação Morfológica). Para a estimação dos parâmetros genéticos, foram realizadas análises unicaracterísticas a partir dos modelos de limiar e linear (características morfológicas) e análises bicaracterísticas que levavam em conta os modelos de linear-limiar e linear-linear (incluindo o peso aos 120 dias de idade como característica âncora). Nas análises unicaracterísticas, verificou-se que as estimativas de herdabilidade foram semelhantes para ambos os modelos. Para as análises bicaracterísticas, as estimativas de herdabilidade obtidas no modelo linear-linear apresentaram maior magnitude do que aquelas obtidas no modelo linear-limiar. Entretanto, as correlações de Spearman entre os valores genéticos preditos para os diferentes modelos (limiar e linear ou linear-linear e linear-limiar) mostraram haver mínima alteração na colocação dos animais, e essa modif

Genotype-environment interaction in the genetic analysis for weaning weight in Nelore cattle using bayesian approach - doi: 10.4025/actascianimsci.v33i2.8469 / Interação genótipo-ambiente na análise genética do peso ao desmame de bovinos Nelore sob enfoque bayesiano - doi: 10.4025/actascianimsci.v33i2.8469

The objective was to evaluate the interactions of genotype-environment effects on the components of (co)variance estimates and the prediction of breeding values for weaning weight in Nelore cattle, using a Bayesian approach. Records of 16,644 weaning weights were used from cattle distributed in ten ranches across six Brazilian states. The genetic parameters were estimated under an animal model considering Bayesian statistics. To verify genotype-environment interaction effects, we analyzed the following matrix model: without the inclusion of genotype-environment interaction effects, and with the inclusion of genotype-environment interaction effects, which considered the effect of sire-year, sire-herd, and both effects. In general, the results suggest that the inclusion of genotype-environment interaction in genetic analysis for weight at weaning tends to alter the estimates of genetic and environment (co)variances. The Spearman correlations between the breeding values were above 97%, indicating practically no change in the classification of animals evaluated. It can be inferred that the interaction effects of sire-year and sire-herd do not change the animals rank, and if not included in the genetic evaluation, the selection based on predictions of breeding values for weaning weight will not be affected.

Objetivou-se avaliar os efeitos das interações genótipo-ambiente sobre as estimativas de componentes de (co)variâncias e predição dos valores genéticos para o peso ao desmame de bovinos Nelore, sob enfoque bayesiano. Foram utilizados 16.644 registros de pesos ao desmame de bovinos provenientes de dez rebanhos participantes do Programa Nelore Brasil. Os parâmetros genéticos foram estimados sob modelo animal, considerando a estatística bayesiana. Para verificar o efeito da interação genótipo-ambiente, foram analisados os seguintes modelos matriciais: sem a inclusão dos efeitos de interação genótipo-ambiente; com a inclusão dos efeitos de interação genótipo-ambiente, em que se considerou o efeito de touro-ano, touro-rebanho e ambos os efeitos. De modo geral, verifica-se que a inclusão da interação genótipo-ambiente na análise genética para o peso ao desmame, tende a alterar as estimativas de (co)variâncias genéticas e ambientais. As correlações de Spearman entre os valores genéticos foram acima de 97%, indicando que, praticamente, não houve mudança na classificação dos animais avaliados. Pode se inferir que os efeitos de interação touro-ano e touro-rebanho não alteram as classificações dos animais, e a não-inclusão destes efeitos na avaliação genética, não afetam a seleção baseada nas predições dos valores genéticos para o peso ao desmame.

Threshold and linear bayesian models in the genetic parameters estimation for morphological traits in Nelore cattle / Modelos bayesianos de limiar e linear na estimação de parâmetros genéticos para características morfológicas de bovinos da raça Nelore

It was aimed to compare the estimates of genetic parameters for body structure, finishing precocity and muscling obtained in single-trait and two-trait bayesian analyses under linear and threshold models. Visual scores obtained from 4,155 Nelore cattle at yearling, belonging to the Brazilian Nelore Program, were used. The animals were evaluated visually by method SAM (System of Morphologic Evaluation). Genetic parameters were estimated by single-trait bayesian analysis considering linear and threshold models (morphological traits) and two-trait bayesian analysis considering linear-linear and linear-threshold models (including the weight to the 120 days). In single-trait analysis, it was verified that heritability estimated were similar for both the models. When considering two-trait analysis, the heritability estimates obtained in the linear-linear model had presented greater magnitude than that in the linear-threshold model. However, the Spearman correlations among the breeding values for different models (linear or threshold and linear-linear or linear-threshold) showed low alteration in the placement of the animals, and it was an insufficient modification to alter their classification as for the percentile, in other words, all the animals TOP1%, when linear models were used, continued being TOP1% when used threshold models. In the genetic evaluation of animals for morphologi

Objetivou-se comparar as estimativas de parâmetros genéticos para as características morfológicas de estrutura corporal, precocidade de terminação e musculosidade, obtidas a partir de análises bayesianas, a partir dos modelos de limiar e linear. Foram utilizados dados de escores visuais, ao sobreano, de 4.155 bovinos da raça Nelore, pertencentes a rebanhos participantes do Programa Nelore Brasil da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores. Os animais foram avaliados visualmente pelo método denominado SAM (Sistema de Avaliação Morfológica). Para a estimação dos parâmetros genéticos, foram realizadas análises unicaracterísticas a partir dos modelos de limiar e linear (características morfológicas) e análises bicaracterísticas que levavam em conta os modelos de linear-limiar e linear-linear (incluindo o peso aos 120 dias de idade como característica âncora). Nas análises unicaracterísticas, verificou-se que as estimativas de herdabilidade foram semelhantes para ambos os modelos. Para as análises bicaracterísticas, as estimativas de herdabilidade obtidas no modelo linear-linear apresentaram maior magnitude do que aquelas obtidas no modelo linear-limiar. Entretanto, as correlações de Spearman entre os valores genéticos preditos para os diferentes modelos (limiar e linear ou linear-linear e linear-limiar) mostraram haver mínima alteração na colocação dos animais, e essa modif

Genetic parameters stimates of young bulls Nelore cattle andrology traits using bayesian inference / Estimativas de parâmetros genéticos de características andrológicas de touros jovens da raça Nelore por meio da inferência bayesiana

The aim of this study was to predict genetic parameters of Nelore males reproductive traits, with age between 17 and 24 months, raised in the Middle-west of Brazil, using Bayesian inference. The group of data considered 1.265 breeding soundness evaluations obtained between 2001 and 2007, in four different properties. Records were obtained from the measure of the scrotal circumference and were evaluated the spermatic morphology. Animals were classified in apt to reproduction or sexually immature. The genetic parameters were estimated through the software THRGIBBS1F90, that uses bayesian inference under animal model. Among 1.265 animals evaluated, 880 (69.56%) were considered apt to reproduction and 385 (30.43%) sexually immature. The heritability estimates for scrotal circumference, larger defects, minor and total were 0.45; 0.13; 0.06 and 0.14, respectively. The estimates of genetic correlation between the scrotal circumference and these same traits were -0.24; -0.04 and -0.18, respectively. The results allowed to conclude that, except the scrotal circumference, all the other traits studied suffer environmental influences and the scrotal circumference would not be the most appropriate trait when the intention is to obtain improvement of the seminal qualitative aspects being advisable the identification of other traits that allow the obtaining genetic through the indirect progre

Objetivou-se com este estudo estimar parâmetros genéticos de características indicadoras da qualidade seminal de machos da raça Nelore, com idade entre 17 e 24 meses, criados na região Centro-Oeste do Brasil, com utilização da inferência bayesiana. O conjunto de dados considerou 1.265 avaliações andrológicas realizadas entre 2001 e 2007, em quatro propriedades diferentes. Obteve-se a medida do perímetro escrotal, realizou-se a avaliação da morfologia espermática e os animais foram classificados em aptos ou sexualmente imaturos. Os parâmetros genéticos foram estimados por meio do pacote computacional THRGIBBS1F90, que aplica a inferência bayesiana sob modelo animal. Dos 1.265 animais avaliados, 880 (69,56%) foram considerados aptos à reprodução e 385 (30,43%) sexualmente imaturos. As estimativas de herdabilidade obtidas para perímetro escrotal, defeitos maiores, menores e totais foram 0,45; 0,13; 0,06 e 0,14, respectivamente. As estimativas de correlação genética entre o perímetro escrotal e estas mesmas características foram -0,24; -0,04 e -0,18, respectivamente. Os resultados mostraram que, à exceção do perímetro escrotal, todas as outras características estudadas sofreram influência ambiental e o perímetro escrotal não seria a característica mais adequada quando o intuito é obter melhoria dos aspectos qualitativos seminais, sendo recomendável a identificação de outras caracte