Diversity and genetic structure of mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), a fruit species from Cerrado / Diversidade e estrutura genética de mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), uma fruteira do Cerrado

Hancornia speciosa Gomes, popularly known as mangabeira, is a fruit tree belonging to the Apocynaceae family, native to the Brazilian Cerrado. The fruit is widely used by the local population as an alternative source of income. Limited information is available about this species, which increases the difficulty of conserving its genetic resources and exploiting mangabeira as an economic resource. The objective of this research was to evaluate the genetic diversity and genetic structure of H. speciosa from Chapada dos Guimarães. Twenty-four trees and ten inter simple sequence repeats (ISSR) primers were evaluated. Of the 57 bands obtained, 33 (57.89%) presented polymorphism. The analysis using Structure defined two different clusters (K = 2), which were consistent with the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) clustering analysis. The number of observed alleles (Na = 1.58), number of effective alleles (Ne = 1.29), Neis genetic distance (He = 0.18) and Shannon index (I = 0.27) were considered low among the population. The analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the variability within the cluster (83.39%) was higher than among clusters (16.61%). ISSR primers proved effective for detection of genetic polymorphism in H. speciosa, and could be utilized for strategies that aim at conservation, plant breeding programs, and commercial use.

Hancornia speciosa Gomes, conhecida popularmente como mangabeira, é uma fruteira pertencente à família Apocynaceae que ocorre espontaneamente no Cerrado brasileiro. O fruto da mangabeira é bastante utilizado pela população local como fonte alternativa de renda e sua exploração é feita de forma extrativista. As informações sobre esta espécie são escassas, o que dificulta a conservação dos recursos genéticos e sua exploração econômica. Neste trabalho foi estudada a diversidade e estrutura genética de uma população de mangabeira, tendo sido avaliada um total de 24 árvores matrizes localizadas em Chapada dos Guimarães-MT por meio de 10 primers ISSR (inter repetições de sequências simples) que revelaram 57 bandas. Destas, 33 (57,89%) apresentaram polimorfismo. A análise utilizando o Structure definiu dois grupos diferentes (K = 2), resultados que foram consistentes com os da análise de agrupamento UPGMA. O número de alelos observados (Na = 1,58), número de alelos efetivos (Ne = 1,29), índice de diversidade de Nei (He = 0,18) e o índice de Shannon (I = 0,27) foram relativamente baixos dentro da população. A AMOVA revelou que a variabilidade dentro dos grupos (83,39%) foi mais alta do que entre os grupos (16,61%). A utilização de iniciadores ISSR mostrou-se eficaz para detecção de polimorfismo genético em mangabeira, servindo de aporte para estratégias que visem à conservação, melhoramento genético e exploração econômica da espécie.

Diversity and genetic structure of mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), a fruit species from Cerrado / Diversidade e estrutura genética de mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), uma fruteira do Cerrado

Hancornia speciosa Gomes, popularly known as mangabeira, is a fruit tree belonging to the Apocynaceae family, native to the Brazilian Cerrado. The fruit is widely used by the local population as an alternative source of income. Limited information is available about this species, which increases the difficulty of conserving its genetic resources and exploiting mangabeira as an economic resource. The objective of this research was to evaluate the genetic diversity and genetic structure of H. speciosa from Chapada dos Guimarães. Twenty-four trees and ten inter simple sequence repeats (ISSR) primers were evaluated. Of the 57 bands obtained, 33 (57.89%) presented polymorphism. The analysis using Structure defined two different clusters (K = 2), which were consistent with the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) clustering analysis. The number of observed alleles (Na = 1.58), number of effective alleles (Ne = 1.29), Neis genetic distance (He = 0.18) and Shannon index (I = 0.27) were considered low among the population. The analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the variability within the cluster (83.39%) was higher than among clusters (16.61%). ISSR primers proved effective for detection of genetic polymorphism in H. speciosa, and could be utilized for strategies that aim at conservation, plant breeding programs, and commercial use.(AU)

Hancornia speciosa Gomes, conhecida popularmente como mangabeira, é uma fruteira pertencente à família Apocynaceae que ocorre espontaneamente no Cerrado brasileiro. O fruto da mangabeira é bastante utilizado pela população local como fonte alternativa de renda e sua exploração é feita de forma extrativista. As informações sobre esta espécie são escassas, o que dificulta a conservação dos recursos genéticos e sua exploração econômica. Neste trabalho foi estudada a diversidade e estrutura genética de uma população de mangabeira, tendo sido avaliada um total de 24 árvores matrizes localizadas em Chapada dos Guimarães-MT por meio de 10 primers ISSR (inter repetições de sequências simples) que revelaram 57 bandas. Destas, 33 (57,89%) apresentaram polimorfismo. A análise utilizando o Structure definiu dois grupos diferentes (K = 2), resultados que foram consistentes com os da análise de agrupamento UPGMA. O número de alelos observados (Na = 1,58), número de alelos efetivos (Ne = 1,29), índice de diversidade de Nei (He = 0,18) e o índice de Shannon (I = 0,27) foram relativamente baixos dentro da população. A AMOVA revelou que a variabilidade dentro dos grupos (83,39%) foi mais alta do que entre os grupos (16,61%). A utilização de iniciadores ISSR mostrou-se eficaz para detecção de polimorfismo genético em mangabeira, servindo de aporte para estratégias que visem à conservação, melhoramento genético e exploração econômica da espécie.(AU)

Genetic diversity estimated using inter-simple sequence repeat markers in commercial crops of cupuassu tree / Diversidade genética estimada com marcadores entre sequências simples repetidas em cultivos comerciais de Cupuaçuzeiro

Fifteen ISSR (inter-simple sequence repeat) primers were used to evaluate the genetic diversity among and within commercial crops of T. grandiflorum (Willd. ex Spreng.) K. Schum. For this, 60 specimens were analyzed, distributed in three crops. A total of 102 bands were amplified, with a polymorphism percentage of 52.0% at species level and an average of 6.8 alleles per ISSR primer. The average for polymorphism information content (PIC) index was 0.55. In relation to the genetic diversity index of Nei (H), and Shannon (I), crops analyzed showed the following values: : SAR H = 0,114 e I = 0,177; SSL H = 0,108 e I = 0,162 e SEC H = 0,104 e I = 0,156, considered moderate to low values. AMOVA showed 34.91% of total variance among the crops, and 65.09% within them. The ISSR molecular markers revealed that there is genetic diversity within each commercial crops studied, thus is possible to select superior genotypes that can be used to give more uniform crops. This result has been considered of great relevance, to provide tools for breding implementation programs and design conservation strategies ex situ and in situ.(AU)

Quinze primers ISSR (entre sequências simples repetidas) foram utilizados para avaliar a diversidade genética entre e dentro de pomares comerciais de Theobroma grandiflorum (Willd. ex Spreng.) K. Schum. Para isso, foram analisados sessenta indivíduos, distribuídos nos três cultivos. Um total de 102 bandas foi amplificado, com uma porcentagem de 52,0% de polimorfismo em nível de espécie e média de 6,8 alelos por primer ISSR. A média do Índice de Conteúdo Polimórfico (PIC) foi de 0,55. Em relação aos índices de diversidade gênica de Nei (H) e de Shannon (I), os cultivos analisados apresentaram os valores: SAR H = 0,114 e I = 0,177; SSL H = 0,108 e I = 0,162 e SEC H = 0,104 e I = 0,156, considerados valores de moderados a baixos. A AMOVA revelou 34,91% da variância total entre os cultivos e 65,09% dentro deles. Os marcadores moleculares ISSR revelaram que há diversidade genética dentro de cada cultivo comercial estudado, portanto é possível selecionar genótipos superiores que poderão ser utilizados para originar cultivos mais uniformes. Esse resultado tem sido considerado de grande relevância, por fornecer ferramentas para a implementação de programas de melhoramento e delineamento de estratégias de conservação ex situ e in situ.(AU)

Use of anatomical root markers for species identification in Catasetum (Orchidaceae) at the Portal da Amazônia region, MT, Brazil / Uso de marcadores anatômicos radiculares para a determinação de espécies de Catasetum (Orchidaceae) da Região do Portal da Amazônia, MT, Brasil

Orchidaceae is one of the largest botanical families, with approximately 780 genera. Among the genera of this family, Catasetum currently comprises 166 species. The aim of this study was to characterize the root anatomy of eight Catasetum species, verifying adaptations related to epiphytic habit and looking for features that could contribute to the vegetative identification of such species. The species studied were collected at the Portal da Amazônia region, Mato Grosso state, Brazil. The roots were fixed in FAA 50, cut freehand, and stained with astra blue/fuchsin. Illustrations were obtained with a digital camera mounted on a photomicroscope. The roots of examined species shared most of the anatomical characteristics observed in other species of the Catasetum genus, and many of them have adaptations to the epiphytic habit, such as presence of secondary thickening in the velamen cell walls, exodermis, cortex, and medulla. Some specific features were recognized as having taxonomic application, such as composition of the thickening of velamen cell walls, ornamentation of absorbent root-hair walls, presence of tilosomes, composition and thickening of the cortical cell walls, presence of mycorrhizae, endodermal cell wall thickening, the number of protoxylem poles, and composition and thickening of the central area of the vascular cylinder. These traits are important anatomical markers to separate the species within the genus and to generate a dichotomous identification key for Catasetum. Thus, providing a useful tool for taxonomists of this group.

Orchidaceae é uma das maiores famílias botânicas, com cerca de 780 gêneros. Dentre seus gêneros, Catasetum inclui atualmente 166 espécies. Caracterizou-se a raiz de oito espécies de Catasetum com o objetivo de verificar caracteres relacionados ao hábito epifítico e contribuir para a taxonomia do grupo. As espécies foram coletadas na região do Portal da Amazônia, no norte do estado de Mato Grosso. Raízes foram fixadas em FAA 50 (1:1:8 formaldeído, ácido acético glacial e álcool etílico 50%), cortadas à mão livre e corados com azul de astra e fucsina. As ilustrações foram obtidas por meio do capturador de imagens acoplado ao fotomicroscópio. As raízes das espécies estudadas compartilharam a maioria dos caracteres anatômicos observados em outras espécies de Catasetum, e vários destes demonstraram adaptações ao hábito epifítico, tais como presença de espessamento secundário na parede das células do velame, da exoderme, do córtex e da medula. Alguns caracteres foram reconhecidos como tendo aplicação taxonômica, como composição do espessamento da parede das células do velame, ornamentação da parede dos pelos absorventes, presença de tilossomos, composição e espessamento da parede das células do córtex, presença de micorriza, tipo de espessamento da parede das células da endoderme, número de pólos de protoxilema e composição e tipo de espessamento da região central do cilindro vascular. Esses caracteres são importantes marcadores anatômicos, pois possibilitam separar as espécies dentro do gênero e gerar uma chave dicotômica de identificação para as Catasetum da região investigada, fornecendo, assim, uma ferramenta útil para os taxonomistas do grupo.

Use of anatomical root markers for species identification in Catasetum (Orchidaceae) at the Portal da Amazônia region, MT, Brazil / Uso de marcadores anatômicos radiculares para a determinação de espécies de Catasetum (Orchidaceae) da Região do Portal da Amazônia, MT, Brasil

Orchidaceae is one of the largest botanical families, with approximately 780 genera. Among the genera of this family, Catasetum currently comprises 166 species. The aim of this study was to characterize the root anatomy of eight Catasetum species, verifying adaptations related to epiphytic habit and looking for features that could contribute to the vegetative identification of such species. The species studied were collected at the Portal da Amazônia region, Mato Grosso state, Brazil. The roots were fixed in FAA 50, cut freehand, and stained with astra blue/fuchsin. Illustrations were obtained with a digital camera mounted on a photomicroscope. The roots of examined species shared most of the anatomical characteristics observed in other species of the Catasetum genus, and many of them have adaptations to the epiphytic habit, such as presence of secondary thickening in the velamen cell walls, exodermis, cortex, and medulla. Some specific features were recognized as having taxonomic application, such as composition of the thickening of velamen cell walls, ornamentation of absorbent root-hair walls, presence of tilosomes, composition and thickening of the cortical cell walls, presence of mycorrhizae, endodermal cell wall thickening, the number of protoxylem poles, and composition and thickening of the central area of the vascular cylinder. These traits are important anatomical markers to separate the species within the genus and to generate a dichotomous identification key for Catasetum. Thus, providing a useful tool for taxonomists of this group.(AU)

Orchidaceae é uma das maiores famílias botânicas, com cerca de 780 gêneros. Dentre seus gêneros, Catasetum inclui atualmente 166 espécies. Caracterizou-se a raiz de oito espécies de Catasetum com o objetivo de verificar caracteres relacionados ao hábito epifítico e contribuir para a taxonomia do grupo. As espécies foram coletadas na região do Portal da Amazônia, no norte do estado de Mato Grosso. Raízes foram fixadas em FAA 50 (1:1:8 formaldeído, ácido acético glacial e álcool etílico 50%), cortadas à mão livre e corados com azul de astra e fucsina. As ilustrações foram obtidas por meio do capturador de imagens acoplado ao fotomicroscópio. As raízes das espécies estudadas compartilharam a maioria dos caracteres anatômicos observados em outras espécies de Catasetum, e vários destes demonstraram adaptações ao hábito epifítico, tais como presença de espessamento secundário na parede das células do velame, da exoderme, do córtex e da medula. Alguns caracteres foram reconhecidos como tendo aplicação taxonômica, como composição do espessamento da parede das células do velame, ornamentação da parede dos pelos absorventes, presença de tilossomos, composição e espessamento da parede das células do córtex, presença de micorriza, tipo de espessamento da parede das células da endoderme, número de pólos de protoxilema e composição e tipo de espessamento da região central do cilindro vascular. Esses caracteres são importantes marcadores anatômicos, pois possibilitam separar as espécies dentro do gênero e gerar uma chave dicotômica de identificação para as Catasetum da região investigada, fornecendo, assim, uma ferramenta útil para os taxonomistas do grupo.(AU)

Diversity and genetic structure of mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), a fruit species from Cerrado / Diversidade e estrutura genética de mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), uma fruteira do Cerrado

Hancornia speciosa Gomes, popularly known as mangabeira, is a fruit tree belonging to the Apocynaceae family, native to the Brazilian Cerrado. The fruit is widely used by the local population as an alternative source of income. Limited information is available about this species, which increases the difficulty of conserving its genetic resources and exploiting mangabeira as an economic resource. The objective of this research was to evaluate the genetic diversity and genetic structure of H. speciosa from Chapada dos Guimarães. Twenty-four trees and ten inter simple sequence repeats (ISSR) primers were evaluated. Of the 57 bands obtained, 33 (57.89%) presented polymorphism. The analysis using Structure defined two different clusters (K = 2), which were consistent with the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) clustering analysis. The number of observed alleles (Na = 1.58), number of effective alleles (Ne = 1.29), Neis genetic distance (He = 0.18) and Shannon index (I = 0.27) were considered low among the population. The analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the variability within the cluster (83.39%) was higher than among clusters (16.61%). ISSR primers proved effective for detection of genetic polymorphism in H. speciosa, and could be utilized for strategies that aim at conservation, plant breeding programs, and commercial use.

Hancornia speciosa Gomes, conhecida popularmente como mangabeira, é uma fruteira pertencente à família Apocynaceae que ocorre espontaneamente no Cerrado brasileiro. O fruto da mangabeira é bastante utilizado pela população local como fonte alternativa de renda e sua exploração é feita de forma extrativista. As informações sobre esta espécie são escassas, o que dificulta a conservação dos recursos genéticos e sua exploração econômica. Neste trabalho foi estudada a diversidade e estrutura genética de uma população de mangabeira, tendo sido avaliada um total de 24 árvores matrizes localizadas em Chapada dos Guimarães-MT por meio de 10 primers ISSR (inter repetições de sequências simples) que revelaram 57 bandas. Destas, 33 (57,89%) apresentaram polimorfismo. A análise utilizando o Structure definiu dois grupos diferentes (K = 2), resultados que foram consistentes com os da análise de agrupamento UPGMA. O número de alelos observados (Na = 1,58), número de alelos efetivos (Ne = 1,29), índice de diversidade de Nei (He = 0,18) e o índice de Shannon (I = 0,27) foram relativamente baixos dentro da população. A AMOVA revelou que a variabilidade dentro dos grupos (83,39%) foi mais alta do que entre os grupos (16,61%). A utilização de iniciadores ISSR mostrou-se eficaz para detecção de polimorfismo genético em mangabeira, servindo de aporte para estratégias que visem à conservação, melhora

Diversity and genetic structure of mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), a fruit species from Cerrado / Diversidade e estrutura genética de mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), uma fruteira do Cerrado

Hancornia speciosa Gomes, popularly known as mangabeira, is a fruit tree belonging to the Apocynaceae family, native to the Brazilian Cerrado. The fruit is widely used by the local population as an alternative source of income. Limited information is available about this species, which increases the difficulty of conserving its genetic resources and exploiting mangabeira as an economic resource. The objective of this research was to evaluate the genetic diversity and genetic structure of H. speciosa from Chapada dos Guimarães. Twenty-four trees and ten inter simple sequence repeats (ISSR) primers were evaluated. Of the 57 bands obtained, 33 (57.89%) presented polymorphism. The analysis using Structure defined two different clusters (K = 2), which were consistent with the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) clustering analysis. The number of observed alleles (Na = 1.58), number of effective alleles (Ne = 1.29), Neis genetic distance (He = 0.18) and Shannon index (I = 0.27) were considered low among the population. The analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the variability within the cluster (83.39%) was higher than among clusters (16.61%). ISSR primers proved effective for detection of genetic polymorphism in H. speciosa, and could be utilized for strategies that aim at conservation, plant breeding programs, and commercial use.

Hancornia speciosa Gomes, conhecida popularmente como mangabeira, é uma fruteira pertencente à família Apocynaceae que ocorre espontaneamente no Cerrado brasileiro. O fruto da mangabeira é bastante utilizado pela população local como fonte alternativa de renda e sua exploração é feita de forma extrativista. As informações sobre esta espécie são escassas, o que dificulta a conservação dos recursos genéticos e sua exploração econômica. Neste trabalho foi estudada a diversidade e estrutura genética de uma população de mangabeira, tendo sido avaliada um total de 24 árvores matrizes localizadas em Chapada dos Guimarães-MT por meio de 10 primers ISSR (inter repetições de sequências simples) que revelaram 57 bandas. Destas, 33 (57,89%) apresentaram polimorfismo. A análise utilizando o Structure definiu dois grupos diferentes (K = 2), resultados que foram consistentes com os da análise de agrupamento UPGMA. O número de alelos observados (Na = 1,58), número de alelos efetivos (Ne = 1,29), índice de diversidade de Nei (He = 0,18) e o índice de Shannon (I = 0,27) foram relativamente baixos dentro da população. A AMOVA revelou que a variabilidade dentro dos grupos (83,39%) foi mais alta do que entre os grupos (16,61%). A utilização de iniciadores ISSR mostrou-se eficaz para detecção de polimorfismo genético em mangabeira, servindo de aporte para estratégias que visem à conservação, melhora