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1.
Ciênc. rural (Online) ; 53(4): e20210827, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1384594

Resumo

ABSTRACT: The German Shepherd dog breed is the most popular breed globally and in Brazil. The study of the population structure through pedigree information is an essential tool to understand the history of the Brazilian German Shepherd dog breed. This study evaluated the status of genetic diversity and population structure of the Brazilian German Shepherd dog breed. The pedigree included a total of 77,938 animals born between 1970 and 2014. The average generation interval in this population was 3.91 years. Considering the reference population, 2,183 founders were identified. Approximately 3% of the genetic diversity of the current population (2010-2014) was lost, most of which was due to genetic drift. The effective population size was relatively small, and the pedigree showed bottlenecks indicating a loss of genetic diversity in this breed. These results indicated the need to adopt measures against the excessive increase in inbreeding and monitor effective population size to minimize genetic diversity loss.


RESUMO: A raça Pastor Alemão é uma das raças mais populares no mundo e no Brasil. O estudo da estrutura populacional por meio de informações de pedigree é uma ferramenta essencial para o entendimento da história dessa raça no Brasil. Objetivou-se com o estudo avaliar o status da diversidade genética e da estrutura populacional de cães da raça Pastor Alemão. O pedigree incluiu um total de 77.938 animais nascidos entre 1970 e 2014. O intervalo médio de geração nesta população foi de 3,91 anos. Considerando a população de referência, foram identificados 2.183 fundadores. Cerca de 3% da diversidade genética da população atual (2010-2014) foi perdida, a maior parte devido à deriva genética. O tamanho efetivo da população foi relativamente pequeno e o pedigree apresentou gargalos indicando uma perda de diversidade genética nesta raça. Esses resultados indicam a necessidade de adoção de medidas contra o aumento excessivo da endogamia e do monitoramento do tamanho efetivo da população para minimizar a perda de diversidade genética.

2.
Ciênc. rural (Online) ; 53(4): e20210827, 2023. ilus, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1412143

Resumo

The German Shepherd dog breed is the most popular breed globally and in Brazil. The study of the population structure through pedigree information is an essential tool to understand the history of the Brazilian German Shepherd dog breed. This study evaluated the status of genetic diversity and population structure of the Brazilian German Shepherd dog breed. The pedigree included a total of 77,938 animals born between 1970 and 2014. The average generation interval in this population was 3.91 years. Considering the reference population, 2,183 founders were identified. Approximately 3% of the genetic diversity of the current population (2010-2014) was lost, most of which was due to genetic drift. The effective population size was relatively small, and the pedigree showed bottlenecks indicating a loss of genetic diversity in this breed. These results indicated the need to adopt measures against the excessive increase in inbreeding and monitor effective population size to minimize genetic diversity loss.


A raça Pastor Alemão é uma das raças mais populares no mundo e no Brasil. O estudo da estrutura populacional por meio de informações de pedigree é uma ferramenta essencial para o entendimento da história dessa raça no Brasil. Objetivou-se com o estudo avaliar o status da diversidade genética e da estrutura populacional de cães da raça Pastor Alemão. O pedigree incluiu um total de 77.938 animais nascidos entre 1970 e 2014. O intervalo médio de geração nesta população foi de 3,91 anos. Considerando a população de referência, foram identificados 2.183 fundadores. Cerca de 3% da diversidade genética da população atual (2010-2014) foi perdida, a maior parte devido à deriva genética. O tamanho efetivo da população foi relativamente pequeno e o pedigree apresentou gargalos indicando uma perda de diversidade genética nesta raça. Esses resultados indicam a necessidade de adoção de medidas contra o aumento excessivo da endogamia e do monitoramento do tamanho efetivo da população para minimizar a perda de diversidade genética.


Assuntos
Animais , Cães , Linhagem , Variação Genética , Cães/genética
3.
Semina ciênc. agrar ; 42(3,supl. 1): 1785-1796, 2021. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1501959

Resumo

The implementation of fish breeding programs in Brazil has brought significant results in the productivity of tilapia. However, the insertion of native species with great potential (such as Tambaqui Colossoma macropomum) in these programs is still recent, and thus requires genetic information for monitoring and enabling their consolidation into the programs. The objective of the present study was to evaluate the genetic diversity of the parental generation (G0) and two consecutive generations (G1 and G2) in the C. macropomum genetic improvement program, located in the municipality of Sorriso, Mato Grosso, Brazil. Ninety caudal fin samples were collected (30 samples per generation) for DNA extraction. The genetic study implemented seven microsatellite markers (Cm1A8, Cm1A11, Cm1D1, Cm1E3, Cm1F4, Cm1F5, and Cm1H8). A total of 17 alleles were amplified, with variations in the mean number between four to two alleles per locus. The size per locus ranged from 170 to 360 bp. The average inbreeding coefficient was 0.126 (G0), -0.040 (G1), and 0.131 (G2). No null or exclusive alleles were found. The observed heterozygosity values for G1 and G2 demonstrated the preservation of genetic variability (0.453 and 0.409, respectively). In conclusion, the genetic diversity of the parental generation (G0) and the two progenies generations (G1 and G2) were adequate, which demonstrates that the genetic improvement program was conducted correctly; however, it is important to continue to evaluations the genetic diversity of the future progeny.


A implantação de programas de melhoramento genético de peixes do Brasil tem trazido resultados significativos na produtividade de peixes como na Tilápia. No entanto, a inserção desses programas em espécies nativas de grande potencial como o Tambaqui (Colossoma macropomum) ainda é recente, sendo necessárias informações genéticas que permitam seu monitoramento e viabilizem sua consolidação. O objetivo do presente estudo foi avaliar a diversidade genética da geração parental (G0) e duas gerações consecutivas (G1 e G2) do programa de melhoramento genético de Colossoma macropomum, localizado no município de Sorriso Mato Grosso, Brasil. Noventa amostras de nadadeira caudal foram coletadas (30 amostras por geração) para a extração do DNA. O estudo genético foi conduzido implementando-se um total de sete loci microssatélites (Cm1A8, Cm1A11, Cm1D1, Cm1E3, Cm1F4, Cm1F5 e Cm1H8). Um total de 17 alelos foram amplificados, com variações no número médio entre quatro a dois alelos por locus. O tamanho por loci variou entre 170 a 360 pares de bases. O coeficiente de endogamia médio foi 0,126 (G0), -0,040 (G1) e 0,131 (G2). Não foram encontrados alelos nulos nem alelos exclusivos. Os valores de heterozigosidade observada para G1 e G2 demonstraram preservação da variabilidade genética (0,453 e 0,409, respectivamente). Em conclusão a diversidade genética tanto da geração parental (G0) como das duas gerações (G1 e G2) foi adequada, o que demostra que o programa de melhoramento genético está sendo conduzido de maneira correta sendo importante dar continuidade com avaliações de diversidade genética nas progênies futuras.


Assuntos
Animais , Caraciformes/genética , Melhoramento Genético
4.
Semina Ci. agr. ; 42(3,supl. 1): 1785-1796, 2021. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-765839

Resumo

The implementation of fish breeding programs in Brazil has brought significant results in the productivity of tilapia. However, the insertion of native species with great potential (such as Tambaqui Colossoma macropomum) in these programs is still recent, and thus requires genetic information for monitoring and enabling their consolidation into the programs. The objective of the present study was to evaluate the genetic diversity of the parental generation (G0) and two consecutive generations (G1 and G2) in the C. macropomum genetic improvement program, located in the municipality of Sorriso, Mato Grosso, Brazil. Ninety caudal fin samples were collected (30 samples per generation) for DNA extraction. The genetic study implemented seven microsatellite markers (Cm1A8, Cm1A11, Cm1D1, Cm1E3, Cm1F4, Cm1F5, and Cm1H8). A total of 17 alleles were amplified, with variations in the mean number between four to two alleles per locus. The size per locus ranged from 170 to 360 bp. The average inbreeding coefficient was 0.126 (G0), -0.040 (G1), and 0.131 (G2). No null or exclusive alleles were found. The observed heterozygosity values for G1 and G2 demonstrated the preservation of genetic variability (0.453 and 0.409, respectively). In conclusion, the genetic diversity of the parental generation (G0) and the two progenies generations (G1 and G2) were adequate, which demonstrates that the genetic improvement program was conducted correctly; however, it is important to continue to evaluations the genetic diversity of the future progeny.(AU)


A implantação de programas de melhoramento genético de peixes do Brasil tem trazido resultados significativos na produtividade de peixes como na Tilápia. No entanto, a inserção desses programas em espécies nativas de grande potencial como o Tambaqui (Colossoma macropomum) ainda é recente, sendo necessárias informações genéticas que permitam seu monitoramento e viabilizem sua consolidação. O objetivo do presente estudo foi avaliar a diversidade genética da geração parental (G0) e duas gerações consecutivas (G1 e G2) do programa de melhoramento genético de Colossoma macropomum, localizado no município de Sorriso Mato Grosso, Brasil. Noventa amostras de nadadeira caudal foram coletadas (30 amostras por geração) para a extração do DNA. O estudo genético foi conduzido implementando-se um total de sete loci microssatélites (Cm1A8, Cm1A11, Cm1D1, Cm1E3, Cm1F4, Cm1F5 e Cm1H8). Um total de 17 alelos foram amplificados, com variações no número médio entre quatro a dois alelos por locus. O tamanho por loci variou entre 170 a 360 pares de bases. O coeficiente de endogamia médio foi 0,126 (G0), -0,040 (G1) e 0,131 (G2). Não foram encontrados alelos nulos nem alelos exclusivos. Os valores de heterozigosidade observada para G1 e G2 demonstraram preservação da variabilidade genética (0,453 e 0,409, respectivamente). Em conclusão a diversidade genética tanto da geração parental (G0) como das duas gerações (G1 e G2) foi adequada, o que demostra que o programa de melhoramento genético está sendo conduzido de maneira correta sendo importante dar continuidade com avaliações de diversidade genética nas progênies futuras.(AU)


Assuntos
Animais , Caraciformes/genética , Melhoramento Genético
5.
Semina ciênc. agrar ; 41(05, supl. 01): 2297-2306, 2020. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1501637

Resumo

The Amazonian Jundiá (Leiarius marmoratus) (Siluliformes: Pimelodidae) is a species of catfish with social and economic importance in some South American countries such as Brazil and Colombia. Genetic evaluation of this species is limited due to the lack of specific molecular markers, hindering studies on genetic diversity and structure in animals under captive conditions or in natural populations. The objective of the present study was to evaluate the transferability of heterologous microsatellite markers in Leiarius marmoratus. Thirty-two heterologous primers were tested in L. marmoratus. The primers that presented the best standards were applied to 20 specimens, and the number of alleles (Na), number of effective alleles (Ne), gene diversity per Locus (GdL) and percentage of amplification failure (Md) were calculated. Eleven primers demonstrated satisfactory transferability patterns, all from the fish of the Pimelodidae family, of which, seven were monomorphic and four polymorphic. The eleven markers presented low percentage of Md (mean was 5.9% samples per locus). Na varied from one to two alleles per locus, revealing low polymorphism in the evaluated samples. The mean Ne and GdL numbers were 1.77 and 0.32, respectively. The transferability of the heterologous microsatellite loci in L. marmoratus was shown to be possible. However, further tests are needed to apply these markers inpopulation genetic studies.


O Jundiá da Amazônia (Leiarius marmoratus) (Siluliformes: Pimelodidae) é uma espécie de catfish com importância social e econômica em alguns países Sul americanos como Brasil e Colômbia. A avaliação genética dessa espécie é limitada devido a ausência de marcadores moleculares específicos para L. marmoratus, dificultando estudos sobre a diversidade e estrutura genética em animais em condições de cativeiro ou em populações naturais. O objetivo do presente estudo foi avaliar a transferibilidade de 32 marcadores microssatélites heterólogos em Leiarius marmoratus. Os primers que apresentaram melhores padrões foram aplicados em 20 espécimes, sendo calculados o número de alelos (Na), número de alelos efetivos (Ne), diversidade gênica por Locus (GdL) e porcentagem de falha na amplificação (Md). Onze primers demonstraram padrões satisfatórios de transferibilidade, todos oriundos de peixes da família Pimelodidae, dos quais sete foram monomórficos e quatro polimórficos. Os onze marcadores apresentaram baixa porcentagem de Md (média 5,9% amostras por loco). O Na variou deum a dois alelos por loco, revelando baixo polimorfismo nas amostras avaliadas. O número médio de Ne e GdL foram 1,77 e 0,32, respectivamente. Estudos genéticos envolvendo indivíduos de diferentes regiões poderão apresentar novos alelos e maior número de loci polimórficos. A transferibilidade de loci microssatélites heterólogos em L. marmoratus se mostrou possível, no entanto, novos testes são necessários para aplicação desses marcadores em estudos genéticos populacionais.


Assuntos
Animais , DNA , Peixes/genética , Repetições de Microssatélites/genética
6.
Semina Ci. agr. ; 41(05, supl. 01): 2297-2306, 2020. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-764803

Resumo

The Amazonian Jundiá (Leiarius marmoratus) (Siluliformes: Pimelodidae) is a species of catfish with social and economic importance in some South American countries such as Brazil and Colombia. Genetic evaluation of this species is limited due to the lack of specific molecular markers, hindering studies on genetic diversity and structure in animals under captive conditions or in natural populations. The objective of the present study was to evaluate the transferability of heterologous microsatellite markers in Leiarius marmoratus. Thirty-two heterologous primers were tested in L. marmoratus. The primers that presented the best standards were applied to 20 specimens, and the number of alleles (Na), number of effective alleles (Ne), gene diversity per Locus (GdL) and percentage of amplification failure (Md) were calculated. Eleven primers demonstrated satisfactory transferability patterns, all from the fish of the Pimelodidae family, of which, seven were monomorphic and four polymorphic. The eleven markers presented low percentage of Md (mean was 5.9% samples per locus). Na varied from one to two alleles per locus, revealing low polymorphism in the evaluated samples. The mean Ne and GdL numbers were 1.77 and 0.32, respectively. The transferability of the heterologous microsatellite loci in L. marmoratus was shown to be possible. However, further tests are needed to apply these markers inpopulation genetic studies.(AU)


O Jundiá da Amazônia (Leiarius marmoratus) (Siluliformes: Pimelodidae) é uma espécie de catfish com importância social e econômica em alguns países Sul americanos como Brasil e Colômbia. A avaliação genética dessa espécie é limitada devido a ausência de marcadores moleculares específicos para L. marmoratus, dificultando estudos sobre a diversidade e estrutura genética em animais em condições de cativeiro ou em populações naturais. O objetivo do presente estudo foi avaliar a transferibilidade de 32 marcadores microssatélites heterólogos em Leiarius marmoratus. Os primers que apresentaram melhores padrões foram aplicados em 20 espécimes, sendo calculados o número de alelos (Na), número de alelos efetivos (Ne), diversidade gênica por Locus (GdL) e porcentagem de falha na amplificação (Md). Onze primers demonstraram padrões satisfatórios de transferibilidade, todos oriundos de peixes da família Pimelodidae, dos quais sete foram monomórficos e quatro polimórficos. Os onze marcadores apresentaram baixa porcentagem de Md (média 5,9% amostras por loco). O Na variou deum a dois alelos por loco, revelando baixo polimorfismo nas amostras avaliadas. O número médio de Ne e GdL foram 1,77 e 0,32, respectivamente. Estudos genéticos envolvendo indivíduos de diferentes regiões poderão apresentar novos alelos e maior número de loci polimórficos. A transferibilidade de loci microssatélites heterólogos em L. marmoratus se mostrou possível, no entanto, novos testes são necessários para aplicação desses marcadores em estudos genéticos populacionais.(AU)


Assuntos
Animais , Peixes/genética , Repetições de Microssatélites/genética , DNA
7.
Ci. Rural ; 45(12): 2187-2192, Dec. 2015. tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-29139

Resumo

O objetivo deste trabalho foi estimar os parâmetros genéticos e fenotípicos para ocorrência da mastite clínica (MC) e para a produção de leite acumulada até 305 dias (PR305) e estudar as associações genéticas entre elas, usando informações de 11.738 lactações de 5.084 vacas de um rebanho da raça Holandesa, paridas entre 1995 a 2010. Os componentes de covariância foram obtidos por abordagem Bayesiana, sob modelo animal. As estimativas de herdabilidade para a PR305 e para a MC foram de 0,16 (0,02) e 0,11 (0,02), respectivamente, e as repetibilidades foram 0,34 (0,012) e 0,21 (0,02), para PR305 e MC, respectivamente. A correlação genética entre a PR305 e a MC foi negativa e de baixa magnitude (-0,21±0,13). As estimativas de herdabilidade para PR305 e MC indicam que estas características são influenciadas por fatores ambientais, entretanto há suficiente variabilidade genética para obtenção de ganhos através da seleção.(AU)


The objective of this study was to estimate genetic and phenotypic parameters for the occurrence of clinical mastitis (MC) and milk production during lactation (PR305) and study the genetic associations between them, using information from 11,738 lactations of 5,084 Holstein herd cows, that calved from 1995 to 2010. The covariance components were estimated by Bayesian inference using the animal model. Heritability estimates for the PR305 and the MC were 0.16 (0.02) and 0.11 (0.02), respectively and repeatability were 0.34 (0.012) for PR305 and 0.21 (0.02) for MC. The genetic correlation between the PR305 and the MC was negative and of low magnitude (-0.21±0.13). Heritability estimates for PR305 and MC indicate that these characteristics are influenced by environmental factors, however there is enough genetic variability to obtain gains through selection.(AU)


Assuntos
Animais , Feminino , Bovinos , Doenças dos Bovinos , Mastite Bovina/genética , Substitutos do Leite Humano , Correlação de Dados
8.
Semina Ci. agr. ; 35(5): 2843-2858, set.-out. 2014. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-28811

Resumo

Objetivou-se estimar parâmetros genéticos para peso corporal, ganho em peso diário (GPD) ecaracterísticas morfométricas em tilápias do Nilo da variedade GIFT por meio de modelos de regressãoaleatória. Foram testados modelos com ordens 2, 3 e 4 do polinômio de Legendre para o efeito genéticoaditivo, e ordens 2 e 3 para a idade, efeitos de ambiente permanente e de família. Testaram-se aindamodelos com variância residual homogênea e heterogênea. Para os efeitos de ambiente permanente ede família, os polinômios de terceira ordem proporcionaram melhor ajuste em todas as características,bem como para o efeito genético para peso, GPD, comprimento e largura. Para altura e tamanho decabeça foram necessários polinômios de quarta ordem. Para ganho em peso, altura e cabeça o melhormodelo foi o que considerou variância residual homogênea para largura, variância heterogênea com trêsclasses de idade e para peso e comprimento, variância heterogênea com nove classes de idade. A maiorherdabilidade para peso foi 0,34 entre 240 e 311 dias, e para GPD foi 0,69 aos 311 dias. Para cabeça ecomprimento a maior herdabilidade ocorreu aos 270 dias, sendo igual a 0,27 e 0,21, respectivamente.A maior herdabilidade para o comprimento foi 0,20 aos 254 dias e para largura a maior herdabilidadefoi 0,54 aos 311 dias. Uma vez que as maiores herdabilidades foram para GPD e largura aos 311 dias,a seleção baseada nestas características nestas idades levaria as maiores ganhos genéticos. As altascorrelações genéticas entre idades superiores aos 200 dias de idade denotam a possibilidade de seutilizar como critério de seleção, idades pouco menores que as usuais (300 dias) sem diminuir o ganhogenético. Como a largura apresentou herdabilidade de média magnitude na maior parte do períodoavaliado, a seleção baseada na largura em qualquer idade levaria a um ganho genético satisfatório nessacaracterística no final do período de cultivo. (AU)


The aim of the current study was to estimate the genetic parameters for weight gain and bodymeasurements in the GIFT (Genetically Improved Farmed Tilapia) strain of Nile tilapia by randomregression models. Several orders of Legendre polynomials were tested for random effects and modeledwith 1, 3, 6 and 9 classes of residual variance. For the effects of permanent environmental and family,third-order polynomials were adjusted in all traits, as well as for the genetic effects of weight, weightgain, length and width. For genetic effects of height and head, fourth-order polynomials were required.To gain weight, height and head, the best model was one that considered the homogenous residualvariance; however for width and weight, heterogeneous variance with 3 and 9 age classes was required,respectively. The highest heritability for weight was 0.34 at 240–311 days, and for weight gain it was0.69 at 311 days. For head and length, the highest heritability was around 270 days at 0.27 and 0.21,respectively. The highest heritability found for length was 0.20 at 254 days, 0.2 at 254 days for height,and for width the heritability was 0.54 at 311 days. Since the largest heritabilities were found for weightgain and width at 311 days, selection at these ages, based on these traits, would lead to greater geneticgains. Genetic correlations were higher between adjacent ages and, in general, selections at ages ofless than 200 days did not lead to genetic gain correlated with traits at 300 days. The exception wasfor width, because high correlations were obtained between final and initial ages and the heritabilitywas median in the majority of the period. Thus, selection based on the width at any age would lead tosatisfactory genetic gain in this trait at the end of the growing season.(AU)


Assuntos
Animais , Ciclídeos/anatomia & histologia , Ciclídeos/crescimento & desenvolvimento , Peso Corporal , Aumento de Peso/genética , Hereditariedade , Análise de Regressão , Estudos Longitudinais
9.
Ci. Rural ; 44(11): 2058-2063, Nov. 2014. tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-27465

Resumo

Foram utilizadas 3.202 primeiras lactações de vacas da raça Holandesa de quatro fazendas da região Sudeste, para verificar a influência da estrutura de dados de produção de leite sobre os parâmetros genéticos. Foram testados quatro arquivos com diferentes estruturas: controles semanais (CS), arquivo mensal (CM), bimestral (CB) e trimestral (CT), com 122.842, 30.883, 15.837 e 12.702 controles, respectivamente. Um modelo de regressão aleatória foi empregado nas análises, considerando os efeitos genético aditivo e o de ambiente permanente de animal, como aleatórios. Os efeitos fixos, grupos de contemporâneos (GC) foram comuns para todos os arquivos de dados e foram compostos por fazenda, mês e ano do controle, além da co-variável idade da vaca ao parto (regressão linear e quadrática). As estimativas de herdabilidade apresentaram tendências mais semelhantes entre os arquivos de dados CS, CM e CB. O arquivo de dados CB apresentou estimativas de parâmetros genéticos com as mesmas tendências e magnitudes que os arquivos CS e CM, permitindo afirmar que não houve influência da estrutura dos dados sobre as estimativas dos componentes de (co)variância e que o controle leiteiro poderia ser realizado em uma estrutura CB.(AU)


A total of 3.035 lactations of Holstein cows from four farms in the Southeast, to check the influence of data structure of milk yield on the genetic parameters. Four dataset with different structures were tested, weekly controls (CW) with 122.842 controls, monthly controls (CM) 30.883, bimonthly controls (CB) with 15,837 and quarterly controls (CQ) with 12,702. The random regression model was used and was considered as random additive genetic and permanent environment effects, fixed effects of the contemporary groups (herd-year-month of test-day) and age of cow (linear and quadratic effects). Heritability estimates showed similar trends among the data files analyzed, with the greatest similarity between dataset CS, CM and CB. The dataset submitted all the CB estimates of genetic parameters analyzed with the same trend and similar magnitude to the CS and CM dataset, allowing the claim that there was no influence of the data structure on estimates of covariance components for the dataset CS, CM and CB. Thus, milk recording could be accomplished in a CB structure.(AU)


Assuntos
Animais , Feminino , Bovinos , Análise de Regressão , Perfil Genético , Leite , Análise de Dados
10.
Bol. ind. anim. (Impr.) ; 70(2): 132-139, 2013. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: biblio-1434342

Resumo

O objetivo deste estudo foi verificar as frequências de mastite clínica (MC) em vacas Holandesas de alta produção de leite, bem como os fatores ambientais que influenciam sua incidência. A média da produção de leite aos 305 dias de acordo com a classe de mastite foi estimada pelo método de quadrados mínimos. As frequências de MC foram analisadas de acordo com as ordens do parto (1 a 6), ano do parto, estação do ano, fase da lactação, e quarto infectado (anterior direito, anterior esquerdo, posterior direito, posterior esquerdo). A frequência da MC por ordem de parto variou de 11,39% no primeiro parto a 21,18% no terceiro parto. 58,56 % dos casos de mastite ocorreram no período das águas e 41,44% no período da seca. O terço final da lactação foi o período com maior ocorrência de casos de MC (45,33%). Os quartos posteriores apresentaram maior frequência de MC (54,25%). Os animais com maiores níveis de produção de leite aos 305 dias (9.466,42 Kg) foram os que apresentaram maior incidência de mastite clínica. Deve-se encontrar um ponto de equilíbrio entre a produção de leite e a mastite a fim de aumentar a rentabilidade da produção. O estudo dos períodos de maior frequência de ocorrência de mastite clínica é fundamental para a pecuária leiteira, para o direcionamento de um programa de controle dessa doença.


The objective of this study was to evaluate the frequency of clinical mastitis (CM), in high production Holstein cows, as well as the environmental factors that favoring its incidence. The average milk production of 305 days, according to the class of mastitis was estimated by the method of least squares. The frequencies of clinical mastitis (CM) events were analyzed according to the calving sequences (1-6), year of calving, season and stage of lactation, and infected quarter (right anterior, left anterior, right posterior, left posterior). The frequency of CM ranged from 11.39% in the first calving to 21.18% in the third. 58.56% of mastitis cases occurred in the wet season, and 41.44% occurred in the dry season. The final lactation stage (200 to 300 days) was the period with the highest occurrence of CM (45.33%). The quarter posterior had a higher frequency CM (54.25%). Animals with higher levels of milk production of 305 days showed highest occurrence of CM. We must find a balance between milk production and mastitis in order to increase profitability. The study of the periods of greatest frequency clinical mastitis events is essential for dairy farming, to direct a program to control this disease.


Assuntos
Animais , Feminino , Bovinos , Contagem de Células Sanguíneas/veterinária , Leite/citologia , Mastite Bovina/etiologia , Mastite Bovina/epidemiologia , Fatores Desencadeantes
11.
Jaboticabal; s.n; 26/02/2010. 71 p.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-3592

Resumo

Parâmetros genéticos para a produção de leite no dia do controle (PLDC) de primeiras lactações de vacas da raça Holandesa foram estimados utilizando os modelos multicaracterísticas e modelos de regressão aleatória (MRA). Para os modelos multicaracterísticas foram analisados 15.896 controles mensais de produção de leite de 1.820 primeiras lactações de vacas da raça Holandesa. As análises foram realizadas por meio de sete modelos: multicaracterísticas padrão, três modelos de posto reduzido ajustando os primeiros 2,3 e 4 componentes principais genéticos e três modelos utilizando análise de fatores com 2,3 e 4 fatores. Para todos os modelos foram considerados os efeitos aleatórios genético aditivo e residual, e os efeitos sistemáticos do grupo de contemporâneo e da idade da vaca ao parto (efeito linear e quadrática) e do número de dias em lactação (efeito linear). A matriz de (co)variâncias residual, para todos os modelos, foi assumida ter posto completo. Os resultados indicam que somente dois componentes principais são requeridos para modelar a estrutura de (co)variâncias genéticas entre as produções de leite no dia do controle. Além disso, o modelo de posto reduzido diminui consideravelmente o número de parâmetros, sem reduzir a qualidade de ajuste. Para os MRA foram analisados 152.145 controles semanais de produção de leite de 7.317 primeiras lactações de vacas da raça Holandesa, provenientes de rebanhos da região Sudeste do Brasil. As produções de leite no dia do controle (PLDC) foram consideradas em 44 classes semanais de dia em lactação. Os grupos de contemporâneos foram definidos como rebanho-ano-semana do controle compondo 2.539 classes e, contendo, no mínimo, seis animais. O modelo utilizado incluiu os efeitos aleatórios genético aditivo direto, de ambiente permanente e o residual. Foram considerados como efeitos fixos, o grupo de ...


Genetic parameters for first lactation test-day milk yields of Holstein cattle were estimated using multivariate and random regression models (RRM). For multivariate model a total of 15,896 individual monthly test-day milk yields (10 test-days), from 1,820 complete first lactations of Holstein cattle. A standard multivariate analysis, reduced rank analyses fitting the first 2, 3 and 4 genetic principal components, and analyses that fitted a factor analytic structure considering 2, 3 and 4 factors, were carried out. All models included also fixed effects of the contemporary groups, age of cow (linear and quadratic effects) and days in milk (linear effect). The residual covariance matrix was assumed to have full rank throughout. The results indicate that only two principal components are required to model the genetic covariance structure among the test-days milk yield. Furthermore, reduced rank model allows decreasing the number of parameter without reducing the goodness of fit considerably. For RRM A total of 152,145 weekly test-day milk yield records from 7,317 first lactations of Holstein cows distributed across 93 herds in southeastern Brazil were analyzed. Test-day milk yields were classified into 44 weekly classes of days in milk (DIM). The contemporary groups were defined as herd-year-week of test-day. The model included direct additive genetic, permanent environmental and residual effects as random and fixed effects of contemporary group and age of cow at calving as covariable. Mean trends were modeled by a cubic regression on orthogonal polynomials of DIM, and additive genetic and permanent environmental effects were estimated using B-splines. Residual variances were modeled by step function with 6 variance classes. Although all the model selection criteria utilized indicated the model employing cubic B-splines to both random effects, with 6 knots, a more parsimonious model ...

12.
Semina ciênc. agrar ; 35(5): 2843-2858, 2014. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1499705

Resumo

Objetivou-se estimar parâmetros genéticos para peso corporal, ganho em peso diário (GPD) ecaracterísticas morfométricas em tilápias do Nilo da variedade GIFT por meio de modelos de regressãoaleatória. Foram testados modelos com ordens 2, 3 e 4 do polinômio de Legendre para o efeito genéticoaditivo, e ordens 2 e 3 para a idade, efeitos de ambiente permanente e de família. Testaram-se aindamodelos com variância residual homogênea e heterogênea. Para os efeitos de ambiente permanente ede família, os polinômios de terceira ordem proporcionaram melhor ajuste em todas as características,bem como para o efeito genético para peso, GPD, comprimento e largura. Para altura e tamanho decabeça foram necessários polinômios de quarta ordem. Para ganho em peso, altura e cabeça o melhormodelo foi o que considerou variância residual homogênea para largura, variância heterogênea com trêsclasses de idade e para peso e comprimento, variância heterogênea com nove classes de idade. A maiorherdabilidade para peso foi 0,34 entre 240 e 311 dias, e para GPD foi 0,69 aos 311 dias. Para cabeça ecomprimento a maior herdabilidade ocorreu aos 270 dias, sendo igual a 0,27 e 0,21, respectivamente.A maior herdabilidade para o comprimento foi 0,20 aos 254 dias e para largura a maior herdabilidadefoi 0,54 aos 311 dias. Uma vez que as maiores herdabilidades foram para GPD e largura aos 311 dias,a seleção baseada nestas características nestas idades levaria as maiores ganhos genéticos. As altascorrelações genéticas entre idades superiores aos 200 dias de idade denotam a possibilidade de seutilizar como critério de seleção, idades pouco menores que as usuais (300 dias) sem diminuir o ganhogenético. Como a largura apresentou herdabilidade de média magnitude na maior parte do períodoavaliado, a seleção baseada na largura em qualquer idade levaria a um ganho genético satisfatório nessacaracterística no final do período de cultivo.


The aim of the current study was to estimate the genetic parameters for weight gain and bodymeasurements in the GIFT (Genetically Improved Farmed Tilapia) strain of Nile tilapia by randomregression models. Several orders of Legendre polynomials were tested for random effects and modeledwith 1, 3, 6 and 9 classes of residual variance. For the effects of permanent environmental and family,third-order polynomials were adjusted in all traits, as well as for the genetic effects of weight, weightgain, length and width. For genetic effects of height and head, fourth-order polynomials were required.To gain weight, height and head, the best model was one that considered the homogenous residualvariance; however for width and weight, heterogeneous variance with 3 and 9 age classes was required,respectively. The highest heritability for weight was 0.34 at 240–311 days, and for weight gain it was0.69 at 311 days. For head and length, the highest heritability was around 270 days at 0.27 and 0.21,respectively. The highest heritability found for length was 0.20 at 254 days, 0.2 at 254 days for height,and for width the heritability was 0.54 at 311 days. Since the largest heritabilities were found for weightgain and width at 311 days, selection at these ages, based on these traits, would lead to greater geneticgains. Genetic correlations were higher between adjacent ages and, in general, selections at ages ofless than 200 days did not lead to genetic gain correlated with traits at 300 days. The exception wasfor width, because high correlations were obtained between final and initial ages and the heritabilitywas median in the majority of the period. Thus, selection based on the width at any age would lead tosatisfactory genetic gain in this trait at the end of the growing season.


Assuntos
Animais , Aumento de Peso/genética , Ciclídeos/anatomia & histologia , Ciclídeos/crescimento & desenvolvimento , Hereditariedade , Peso Corporal , Análise de Regressão , Estudos Longitudinais
13.
Jaboticabal; s.n; 22/02/2006. 74 p.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-9499

Resumo

Parâmetros genéticos para a produção de leite no dia do controle (PLDC) de primeiras lactações de vacas da raça Holandesa foram estimados utilizando os modelos de dimensão finita (TOMO) e modelos de regressão aleatória (MRA). A produção acumulada em 305 dias (P305) também foi analisada. Para os TOMO foram analisadas 10 características por meio de modelos uni e bi-características, que continham como aleatórios, o efeito genético aditivo e o efeito residual e, como efeitos fixos, o grupo de contemporâneos e as covariáveis idade da vaca ao parto e dias em lactação. Para os MRA, foram considerados os efeitos aleatórios genético aditivo direto, de ambiente permanente e o residual. Foram considerados como efeitos fixos, o grupo de contemporâneos, os efeitos linear e quadrático da covariável idade da vaca ao parto e a curva média de lactação da população, modelada por meio de polinômios ortogonais de Legendre de quarta ordem. Os efeitos aleatórios genético aditivo e de ambiente permanente foram modelados por meio de regressão aleatória sobre polinômios ortogonais de Legendre. Alternativamente, uma função de correlação paramétrica, estacionária e não estacionária, associada a uma função de variâncias foi utilizada para modelar a estrutura de (co)variâncias de ambiente permanente. As variâncias residuais foram consideradas através de funções de variâncias de terceira a sétima ordem ou 1, 13, 17 e 44 classes de variâncias. Um MRA com polinômio de Legendre de sétima ordem tanto para o efeito genético aditivo como para efeito de ambiente permanente e contendo 17 classes de variâncias residuais foi indicado como o melhor pelos testes comparativos, todavia um modelo com polinômio de sexta ordem para o efeito genético aditivo e sétima ordem para efeito de ambiente permanente poderia ser suficiente. As estimativas de herdabilidade (h2) para PLOC oscilaram entre 0,07 e 0,19 em análises uni-características, 0


Genetic parameters for first lactation test-day milk yields of Holstein cattle were estimated using Test-day models (TOM) and Random regression models (RRM). Total milk yield (M305) was also analyzed. Ten different test-day milk yields using were analyzed uni and bi-trait animal models, that included the additive genetic as random effect and the fixed effects of contemporary group, age of cow (linear and quadratic) and days in milk (linear) as covariables. RRM included the additive genetic, permanent environmental and residual as random effects, the fixed effects of contemporary group, age of cow as covariable (linear and quadratic effects) and a 4th order Legendre orthogonal polynomials of days in milk, to model the mean trend. The additive genetic and permanent environmental effects was fitted by Legendre orthogonal polynomials. Alternatively, changes in permanent environmental effect were modeled by a variance function combined to a parametric correlation function. Different structures of residual variances were used, step functions with 1, 13, 17 and 44 variances or 3nd to ih order variance functions fitting Legendre orthogonal polynomials. The seventh order random regression model for both additive genetic and permanent environmental effects, and a step function with 17 classes fitted best, however, a sixth order covariance function for the additive genetic effects and a seventh order covariance function for the permanent environmental effect could be sufficient. Heritability estimates obtained by TOM varied from 0.07 to 0.19 by uni-trait and from 0.12 to 0.22 by bi-trait analysis

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