PCR como técnica para sexagem molecular em aves / PCR as technique for molecular sexing in birds

O presente estudo avaliou a PCR como técnica para sexagem molecular em aves, a qual empregou os primers P2/P8, relacionados com os cromossomos sexuais (Z/W) das aves. Os produtos da PCR foram submetidos à corrida eletroforética, e esta revelou que o tamanho dos pares de base (pb) variou entre as espécies: de 246 a 396 pb para o alelo Z e de 254 a 412 pb para o W. Os resultados mostraram 76 machos (49,31%) e 78 fêmeas (50,69%), totalizando 154 aves. Esta situação propõe desvios meramente casuais ao teste χ² (P > 0,05), pois sendo a variável estudada dicotômica, a relação 1:1 está dentro de um universo amostral. Tais dados mostram que esta técnica, utilizando DNA extraído tanto de penas quanto de sangue, é segura e eficaz para a determinação sexual das aves.(AU)

This study evaluated PCR as a technique for molecular sexing in birds using the primers P2/P8, related to the sex chromosomes (Z/W) of birds. The PCR products under electrophoresis showing the size of the base pairs (bp) varying between species: 246 to 396 bp for the allele Z and 254 to 412 for W. The results identified 76 males (49,31%) and 78 females (50,69%), totalizing 154 birds. This situation proposes casual deviations, Test χ² (p>0.05), as being the dicotomic variable studied the 1:1 ratio is within a sampling universe. The data show that the technique is accurate and effective for sex determination of birds, both using DNA extracted from feathers and blood. (AU)

PCR como técnica para sexagem molecular em aves / PCR as technique for molecular sexing in birds

O presente estudo avaliou a PCR como técnica para sexagem molecular em aves, a qual empregou os primers P2/P8, relacionados com os cromossomos sexuais (Z/W) das aves. Os produtos da PCR foram submetidos à corrida eletroforética, e esta revelou que o tamanho dos pares de base (pb) variou entre as espécies: de 246 a 396 pb para o alelo Z e de 254 a 412 pb para o W. Os resultados mostraram 76 machos (49,31%) e 78 fêmeas (50,69%), totalizando 154 aves. Esta situação propõe desvios meramente casuais ao teste χ² (P > 0,05), pois sendo a variável estudada dicotômica, a relação 1:1 está dentro de um universo amostral. Tais dados mostram que esta técnica, utilizando DNA extraído tanto de penas quanto de sangue, é segura e eficaz para a determinação sexual das aves.

This study evaluated PCR as a technique for molecular sexing in birds using the primers P2/P8, related to the sex chromosomes (Z/W) of birds. The PCR products under electrophoresis showing the size of the base pairs (bp) varying between species: 246 to 396 bp for the allele Z and 254 to 412 for W. The results identified 76 males (49,31%) and 78 females (50,69%), totalizing 154 birds. This situation proposes casual deviations, Test χ² (p>0.05), as being the dicotomic variable studied the 1:1 ratio is within a sampling universe. The data show that the technique is accurate and effective for sex determination of birds, both using DNA extracted from feathers and blood.

Testes bioquímico (albumina e proteína de ligação da vitamina D) e molecular (gene KIT) para detecção de marcadores genéticos para pelagem tobiana em cavalos pampa e paint / Biochemical (albumin and vitamin D-binding protein) and molecular (KIT gene) tests for detection of genetic markers for tobiano coat color in pampa and paint horses

Foram utilizados 159 cavalos Pampa, registrados na Associação Brasileira dos Criadores de Cavalo Pampa, e um grupo-controle, de 32 cavalos da raça Paint, ambos os grupos provenientes de plantéis de diferentes regiões brasileiras, com o objetivo de comparar os testes bioquímico e molecular para detecção de marcadores genéticos para pelagem tobiana em cavalos Pampa. Houve diferença significativa (P<0,001) entre os testes bioquímico e molecular, nos cavalos Pampa, mas o mesmo fato não ocorreu com os da raça Paint. Os resultados mostraram que o marcador molecular (KIT) foi mais eficiente na identificação dos prováveis cavalos homozigotos do que os marcadores bioquímicos albumina (Al) e proteína de ligação da vitamina D (Gc), em ambas as raças.(AU)

In this study, 159 Pampa horses, registered at the Associação Brasileira dos Criadores de Cavalo Pampa, and a control group of 32 Paint horses, both coming from herds located in different Brazilian regions, were used to compare biochemical and molecular tests for detection of genetic markers for the Tobiano coat color pattern in Pampa horses. Difference (P<0.001) between biochemical and molecular tess in Pampa horses was observed, but not for the Paint horses. The results showed that the molecular marker (KIT) was more efficient to identify the probable homozygous dominant horses than the biochemical markers albumin (Al) and vitamin D-binding Protein (Gc), in both breeds.(AU)

Sexagem molecular em aves silvestres / Molecular sexing in wild birds

A identificação do sexo em aves silvestres é imprescindível para a produção e comercialização destas em criadouros conservacionistas ou comerciais. Estima-se que cerca da metade das espécies existentes no mundo não possui dimorfismo sexual e, quando existe, é geralmente sutil, podendo ocorrer somente a partir do período de maturidade sexual. Por meio da técnica da PCR, é possível realizar a sexagem pela detecção dos genes CHD-Z e CHD-W, que estão localizados nos cromossomos sexuais de todas as aves. O CHD-W, localiza-se no cromossomo W, somente nas fêmeas, e o gene CHD-Z é encontrado no cromossomo Z, ocorrendo em ambos os sexos. A técnica é simples, conveniente, barata, rápida e segura, podendo apresentar várias vantagens, como: reduz custos de manutenção de aves jovens, evita a formação de casais do mesmo sexo, ou entre parentes próximos ou casais ao acaso, facilita o manejo genético em criações com sistema de produção de aves por separação por sexo.(AU)

Sex identification in wild birds is essential for the production and marketing of these in conservation or breeding business. It is estimated that approximately half of the species in the world has no sexual dimorphism, and where there is usually subtle and may only occur from the period of sexual maturity. Through the technique of PCR is possible to detect the genes CHD-Z and CHD-W, located in the sexual chromosomes of all the birds. The gene CHD-W is located on the W chromosome, only in females and the gene CHD-Z is found on the Z chromosome occurring in both sexes. The technique is simple, convenient, cheap, fast and safe and may provide several advantages, such as reduction costs of maintenance of young birds to prevent the formation of same-sex couples, or between close relatives or couples at random, to facilitate management in genetic creations with poultry production system for separation for sex.(AU)

Sexagem molecular em aves silvestres / Molecular sexing in wild birds

A identificação do sexo em aves silvestres é imprescindível para a produção e comercialização destas em criadouros conservacionistas ou comerciais. Estima-se que cerca da metade das espécies existentes no mundo não possui dimorfismo sexual e, quando existe, é geralmente sutil, podendo ocorrer somente a partir do período de maturidade sexual. Por meio da técnica da PCR, é possível realizar a sexagem pela detecção dos genes CHD-Z e CHD-W, que estão localizados nos cromossomos sexuais de todas as aves. O CHD-W, localiza-se no cromossomo W, somente nas fêmeas, e o gene CHD-Z é encontrado no cromossomo Z, ocorrendo em ambos os sexos. A técnica é simples, conveniente, barata, rápida e segura, podendo apresentar várias vantagens, como: reduz custos de manutenção de aves jovens, evita a formação de casais do mesmo sexo, ou entre parentes próximos ou casais ao acaso, facilita o manejo genético em criações com sistema de produção de aves por separação por sexo.

Sex identification in wild birds is essential for the production and marketing of these in conservation or breeding business. It is estimated that approximately half of the species in the world has no sexual dimorphism, and where there is usually subtle and may only occur from the period of sexual maturity. Through the technique of PCR is possible to detect the genes CHD-Z and CHD-W, located in the sexual chromosomes of all the birds. The gene CHD-W is located on the W chromosome, only in females and the gene CHD-Z is found on the Z chromosome occurring in both sexes. The technique is simple, convenient, cheap, fast and safe and may provide several advantages, such as reduction costs of maintenance of young birds to prevent the formation of same-sex couples, or between close relatives or couples at random, to facilitate management in genetic creations with poultry production system for separation for sex.

Teste de marcadores bioquímicos na identificação de prováveis indivíduos homozigotos dominantes para o gene tobiano em cavalos Pampa / Biochemical markers test to identify probable homozygous dominant for the tobiano gene in Pampa horses

Utilizaram-se 195 cavalos Pampa e um grupo-controle de 41 cavalos da raça Paint, provenientes de plantéis de várias regiões brasileiras, com o objetivo de avaliar a eficiência do teste mediante uso de marcadores bioquímicos: albumina (Al) e proteína de ligação da vitamina D (Gc), para identificação dos possíveis indivíduos homozigotos dominantes para o padrão de pelagem tobiano nos cavalos Pampa. Não foram encontrados genótipos AlBB e GcSS, revelando indício de quebra de ligação gênica entre tais locos e o loco tobiano e a ineficácia do teste bioquímico na detecção dos prováveis indivíduos homozigotos dominantes para o padrão de pelagem tobiano nos cavalos Pampa(AU)

One hundred and ninety five Pampa horses and a control group of 41 Paint Horses originated from herds located in different Brazilian regions were used to objective of evaluate the efficiency of the biochemical markers albumin (Al) and vitamin D binding protein (Gc) to identify the probable homozygous dominant for the tobiano coat color pattern in Pampa horses. It was not found any genotype AlBB and GcSS, indicating a possible break of the genetic linkage between these loci and the locus Tobiano, as well as the inefficacy of the biochemical test in the detection of the probable homozygous dominant for the tobiano color pattern in Pampa horses(AU)

Caracterização genética de seis plantéis comerciais de tilápia ( Oreochromis ) utilizando marcadores microssatélites / Genetic characterization of six commercial stocks of tilapia ( Oreochromis spp ) using microsatellite markers

Foram caracterizados geneticamente, utilizando-se cinco locos de microssatélites, 235 indivíduos de seis plantéis de tilápia (Ceará, Chitralada, Israel, Nilótica, Taiwan e Vermelha) da região Sudeste do Brasil. Verificou-se diferença genética entre os seis plantéis, obtida pelo cálculo do índice de fixação de alelos (Fst=0,3263). De modo geral, está ocorrendo perda de heterozigose nos plantéis, segundo mostrou a estimativa do coeficiente de endogamia intrapopulacional (Fis=0,0486). Os plantéis Israel e Nilótica foram os mais semelhantes geneticamente (Ig=0,6663). Os plantéis Chitralada e Taiwan foram os que menos apresentaram genes em comum (Ig=0,2463). O plantel denominado Vermelha foi o mais distinto entre todos.(AU)

Two hundred and thirty five individuals from six commercial stocks of tilapias (Ceará, Chitralada, Israel, Nilótica, Taiwan and Red) from the Southeastern region of the country were genetically characterized using five microsatellite loci. The results suggest large genetic difference among the stocks, estimated through the fixation allele index (Fst = 0.3263), and a considerable loss of heterozigosity accurs in most of the stocks, according to the population inbreeding coefficient (Fis=0.0486). The Israel and Nilótica stocks were genetically similar (Ig=0.6663), while Chitralada and Taiwan showed less genes in common (Ig=0.2463). The Red stock was the most distinct stock.(AU)

Comparação entre métodos de estocagem de DNA extraído de amostras de sangue, sêmen e pêlos e entre técnicas de extração / Comparison between storage methods of DNA extracted from blood, semen and hair and between the techniques of extraction

DNA samples of six bovines obtained from three tissues (blood, semen and hair) were extracted using two different techniques. After the extraction procedures the samples were divided in six fractions. Three were stored at -20º C and three at 4º C. Every three months one sample of each tissue/extraction procedure was analyzed in spectrophotometer, to determine the quantity of the DNA and the extract was amplified using the primer RM 29. No differences in the DNA quantity or in the level of protein contamination among the three periods of analyses were observed. All the DNA extracted by quick extraction technique showed good amplification patterns during the nine months, meaning that this technique can be used in laboratory routine instead of the permanent extraction technique. The extract obtained from blood, using the permanent extraction technique, showed the higher quantity of DNA with the smaller index of protein contamination. The high quantity of protein contamination found in the semen samples preserved in egg yolk demanded modifications in both extraction techniques. After that the results were positive, showing good amplification patterns.(AU)

Teste de DNA para verificação de parentesco em cães: avaliação do método não automatizado com o auxílio do primer CMR S

To evaluate the precision of the DNA tests using the non-automatized technique for individual identification and parentage tests, 105 Rottweiler dogs were studied using the primer CMR S. The sample was composed of 39 animals belonging to 11 complete families and their progenies, and 66 non related individuals until the second generation, derived from kennels located in the states of Minas Gerais and São Paulo. The CMR S primer was used for the Polimerase Chain Reaction (PCR). The results showed the inefficiency of the technique, even when analyzed through the automated gel analysis system. Also showed the impossibility of its commercial use due to the fact of does not permit the storage of data for subsequent use.

Microssatélites BM2113, ILSTS005, ILSTS008, ETH131 e RM88 em testes de verificação de parentesco para bovinos da raça Gir / Microsatellites BM2113, ILSTS005, ILSTS008, ETH131 and RM88 for parentage tests in bovines of Gir breed

Foram utilizados 46 animais da raça Gir, registrados na Associação Brasileira de Criadores de Zebu, provenientes de cinco fazendas situadas no Estado de Minas Gerais, com o objetivo de avaliar a eficiência dos microssatélites BM2113, ILSTS005, ILSTS008, ETH131 e RM88 em testes de verificação de parentesco. Os locos BM2113, ILSTS005, ETH131 e RM88 mostraram-se eficientes, apresentando valores de PE2 (probabilidade de exclusão quando os dois progenitores são genotipados) entre 0,62 e 0,69 e PIC2 (conteúdo de informação polimórfica quando os dois progenitores são genotipados) entre 0,78 e 0,83. O mesmo não ocorreu para o loco ILSTS008, o qual apresentou baixos valores de PE2 (0,24) e PIC2 (0,41).(AU)

Forty six animals of the Gir breed, registered at the Brazilian Association of Zebu Breeders, coming from five farms located in Minas Gerais State, were used to analyze the efficiency of the microsatellites BM2113, ILSTS005, ILSTS008, ETH131 and RM88 in parentage tests. The loci BM2113, ILSTS005, ETH131 and RM88 showed to be efficient, presenting values of PE2 (exclusion probability when both parents are genotiped) between 0.62 and 0.69 and PIC2 (polymorphic information contents when both parents are genotiped) between 0.78 and 0.83. The same was not observed for the locus ILSTS008 that showed low values of PE2 (0.24) and PIC2 (0.41).(AU)