Multidrug resistance in Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) isolated from broiler chickens at slaughter / Resistência a múltiplos antimicrobianos em Escherichia coli shigatoxigênica (STEC) isoladas de frangos de corte ao abate

Broiler chickens and derived products are a key source of Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) in humans. This pathotype is responsible for causing severe episodes of diarrhea, which can progress to systemic complications. A rapid and accurate diagnosis of the disease, and early treatment of the infection with antimicrobials, can prevent it worsening. However, multidrug-resistant strains have potentially negative implications for treatment success. In this context, the aim of the present study was to isolate and identify multidrug-resistant STEC strains from broiler chickens and carcasses. Of 171 E. coli strains, isolated by conventional microbiological techniques and submitted to Polymerase Chain Reaction (PCR), for detection of stx1 and stx2 genes, 21.05% (36/171) were STEC pathotype, and most of them (66.67% - 24/36) carried both stx1 and eae genes. The multidrug resistance pattern was observed in 75% (27/36) of STEC strains. The presence of STEC in broiler chickens and carcasses reinforces that these sources may act as reservoirs for this pathotype. Multidrug-resistant bacteria contaminating animal products represent a public health issue because of the possibility of spread of multidrug-resistant determinants in the food chain and a higher risk of failure in human treatment when antimicrobials are needed.(AU)

Frangos de corte e seus produtos são importantes componentes na cadeia de transmissão de Escherichia coli do patotipo Shigatoxigênico (STEC) para humanos. Este patotipo é responsável por causar episódios de diarréia severos, que podem evoluir para complicações sistêmicas. O diagnóstico rápido e preciso da doença, e o tratamento com antimicrobianos ainda no início da infecção, podem evitar seu agravamento. Porém, cepas resistentes a múltiplos antimicrobianos podem ter implicações potencialmente negativas em relação ao sucesso do tratamento. Neste contexto, este estudo teve como objetivo isolar e identificar cepas STEC resistentes a múltiplos antimicrobianos em frangos de corte e carcaças. Das 171 cepas de E. coli isoladas pelo método bacteriológico convencional, e submetidas à Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), para detecção dos genes stx1 e stx2, 21.05% (36/171) pertenciam ao patotipo STEC, a maioria (66.67% - 24/36) portando o gene stx1 associado ao gene eae. O perfil de multirresistência foi observado em 75% (27/36) das cepas STEC. A presença de cepas STEC no material estudado reforça o fato de que frangos vivos e carcaças devem ser considerados como reservatórios deste patotipo. A presença de cepas resistentes a múltiplos antimicrobianos, contaminando produtos de origem animal, representa um risco à Saúde Pública pela possibilidade de disseminação de determinantes de multirresistência e maior risco de insucesso no tratamento de indivíduos infectados.(AU)

Mycoplasma spp. in captive snakes (Boa constrictor and Bothrops atrox) from Brazil / Mycoplasma spp. em cobras de cativeiro (Boa constrictor e Bothrops atrox) do Brasil

Although rare, mycoplasmas are included among the causes of respiratory diseases in reptiles and, in the order Squamata, three reports of these microorganisms causing diseases in pythons have already been reported. This study aimed to evaluate the occurrence of Mycoplasma species in captive snakes. A total of 26 snakes of the families Pythonidae (13), Boidae (7), Viperidae (5) and Colubridae (1) from RioZoo, Brazil, were evaluated. Animals were examined to determine clinical signs consistent with any infectious disease. Tracheal swab samples from snakes were collected in Frey medium and analyzed for the presence of Mycoplasma spp.by isolation and a genus-specific PCR. DNA sequencing analyses of six positive samples by PCR were carried out to identify the species. Using isolation 19.23% (5/26) was positive, while 65.38% (17/26) of the animals were positive by PCR. Based on the analyses of the six sequences obtained, there was similarity with a Mycoplasma spp. previously described in a phyton and, M. agassizii and M. testudineum reported in chelonians. This is the first report of Mycoplasma spp. in animals of the families Boidae and Viperidae. Mycoplasma spp. were detected in snakes with and without clinical signs. The mycoplasmas reported resented identity (range, 95% to 100%) to others already described in reptiles. There was no relationship between the presence of Mycoplasma spp. and clinical signs.(AU)

Embora raros, os micoplasmas estão incluídos entre as causas de doenças respiratórias em répteis e, na ordem Squamata, já foram realizados três relatos destes microrganismos causando doença em pítons. Este estudo teve como objetivo avaliar a ocorrência de espécies de Mycoplasma em serpentes em cativeiro. Foram avaliadas 26 serpentes das famílias Pythonidae (13), Boidae (7), Viperidae (5) e Colubridae (1) do RioZoo, Brasil. Os animais foram examinados para determinar sinais clínicos consistentes com qualquer doença infecciosa. Amostras de swab traqueal de cobras foram coletadas em meio Frey e analisadas por isolamento microbiológico e pela técnica da PCR para identificar Mycoplasma spp. As amostras positivas para o gênero Mycoplasma spp. foram submetidas ao sequenciamento genético para identificação das espécies. No isolamento, 19,23% (5/26) foram positivos, enquanto 65,38% (17/26) dos animais foram positivos por PCR. Com base nas análises das seis sequências obtidas, houve similaridade com o Mycoplasma spp. descrito anteriormente em um píton e M. agassizii e M. testudineum encontrados em quelônios. Este é o primeiro relato de Mycoplasma spp. em animais das famílias Boidae e Viperidae. Mycoplasma spp. foi detectado em serpentes com e sem sinais clínicos. Os micoplasmas encontrados apresentaram semelhança genética com outros já descritos em répteis. Não houve relação entre a presença de Mycoplasma spp. e sinais clínicos.(AU)

Evaluation of two DNA extraction techniques in the detection of Mycoplasma hyopneumoniae by PCR in lungs samples of pigs with and without pneumonia / Avaliação de duas técnicas de extração de DNA na detecção de Mycoplasma hyopneumoniaepor PCR em amostras de pulmões de suínos com e sem lesão de pneumonia

Swine Enzootic Pneumonia (PES) has as the primary etiologic agent the Mycoplasma hyopneumoniae. The diagnosis of PES involves clinical manifestations on farms, macroscopic lesions visualized in the slaughterhouse and laboratory techniques, such as isolation by culture, histopathology, immunohistochemistry, ELISA and other serological tests and PCR. This work aimed to establish the comparison between PCR results and typical macroscopic findings in lungs with PES and to evaluate the efficacy of PCR results with extraction by phenol-chloroform and commercial kit in fragments of swine lungs. The efficacy of PCR was evaluated by comparing the classic method of DNA extraction by phenol-chloroform and by commercial Kit. Fragments of lungs of 18 pigs with characteristic lesions of PES and 17 without lesions were subjected to DNA extraction and posterior PCR. The pulmonary lesions with PES were PCR-positive in 94.44%, compared to 76.47% of the non-PES lungs. Kappa concordance between macroscopic and PCR was 18%, which was not significant (P > 0.05). Of the 35 lung fragments processed by phenol-chloroform, 85.71% were positive by PCR, compared to 28.57% by the commercial kit. Kappa agreement between DNA extraction methods was 57%, which was statistically significant (p <0.05), but Odds ratio was 15 (CI 4.52 to 49.68), which means that the probability of PCR positivity by the phenol-chloroform method was 15 times higher than that by the commercial kit. Macroscopy and PCR results were discordant, with phenol-chloroform extraction being the best between both procedures.

A Pneumonia Enzoótica Suína (PES) tem como agente etiológico primário a bactéria Mycoplasma hyopneumoniae. O diagnóstico da PES envolve manifestações clínicas na granja, lesões macroscópicas visualizadas no frigorífico e técnicas laboratoriais, tais como isolamento por cultura, histopatologia, imunoistoquímica, ELISA e outros testes sorológicos e PCR. O objetivo deste trabalho foi estabelecer a comparação entre resultados da PCR e achados macroscópicos típicos em pulmão com PES e avaliar a eficácia dos resultados da PCR com extração por fenol-clorofórmio e kit comercial, em fragmentos de pulmão de suínos. A eficácia da PCR foi avaliada pela comparação entre o método clássico de extração de DNA por fenol-clorofórmio e por Kit comercial. Fragmentos de pulmões de 18 suínos com lesões características de PES e 17 sem lesões foram submetidos a extração de DNA e posterior PCR. As lesões pulmonares com PES foram PCR positivas na PCR em 94.44%, contra 76.47% dos pulmões sem PES. A concordância por Kappa entre macroscopia e PCR foi 18%, não significativo, (p>0.05). Dos 35 fragmentos de pulmões processados por fenol-clorofórmio, 85.71% foram positivos por PCR, contra 28.57% pelo kit comercial. A concordância por Kappa entre os métodos de extração de DNA foi 57%, estatisticamente significativa (p<0,05), mas, o Odds ratio foi 15 (CI 4.52 to 49.68), o que significa dizer que a probabilidade de positividade por PCR pelo método de fenol-clorofórmio foi 15 vezes maior do que pelo kit comercial. Os resultados da macroscopia e PCR foram discordantes, sendo a extração por fenol-clorofórmio o melhor entre ambos os procedimentos usados.

Evaluation of two DNA extraction techniques in the detection of Mycoplasma hyopneumoniae by PCR in lungs samples of pigs with and without pneumonia / Avaliação de duas técnicas de extração de DNA na detecção de Mycoplasma hyopneumoniaepor PCR em amostras de pulmões de suínos com e sem lesão de pneumonia

Swine Enzootic Pneumonia (PES) has as the primary etiologic agent the Mycoplasma hyopneumoniae. The diagnosis of PES involves clinical manifestations on farms, macroscopic lesions visualized in the slaughterhouse and laboratory techniques, such as isolation by culture, histopathology, immunohistochemistry, ELISA and other serological tests and PCR. This work aimed to establish the comparison between PCR results and typical macroscopic findings in lungs with PES and to evaluate the efficacy of PCR results with extraction by phenol-chloroform and commercial kit in fragments of swine lungs. The efficacy of PCR was evaluated by comparing the classic method of DNA extraction by phenol-chloroform and by commercial Kit. Fragments of lungs of 18 pigs with characteristic lesions of PES and 17 without lesions were subjected to DNA extraction and posterior PCR. The pulmonary lesions with PES were PCR-positive in 94.44%, compared to 76.47% of the non-PES lungs. Kappa concordance between macroscopic and PCR was 18%, which was not significant (P > 0.05). Of the 35 lung fragments processed by phenol-chloroform, 85.71% were positive by PCR, compared to 28.57% by the commercial kit. Kappa agreement between DNA extraction methods was 57%, which was statistically significant (p <0.05), but Odds ratio was 15 (CI 4.52 to 49.68), which means that the probability of PCR positivity by the phenol-chloroform method was 15 times higher than that by the commercial kit. Macroscopy and PCR results were discordant, with phenol-chloroform extraction being the best between both procedures.(AU)

A Pneumonia Enzoótica Suína (PES) tem como agente etiológico primário a bactéria Mycoplasma hyopneumoniae. O diagnóstico da PES envolve manifestações clínicas na granja, lesões macroscópicas visualizadas no frigorífico e técnicas laboratoriais, tais como isolamento por cultura, histopatologia, imunoistoquímica, ELISA e outros testes sorológicos e PCR. O objetivo deste trabalho foi estabelecer a comparação entre resultados da PCR e achados macroscópicos típicos em pulmão com PES e avaliar a eficácia dos resultados da PCR com extração por fenol-clorofórmio e kit comercial, em fragmentos de pulmão de suínos. A eficácia da PCR foi avaliada pela comparação entre o método clássico de extração de DNA por fenol-clorofórmio e por Kit comercial. Fragmentos de pulmões de 18 suínos com lesões características de PES e 17 sem lesões foram submetidos a extração de DNA e posterior PCR. As lesões pulmonares com PES foram PCR positivas na PCR em 94.44%, contra 76.47% dos pulmões sem PES. A concordância por Kappa entre macroscopia e PCR foi 18%, não significativo, (p>0.05). Dos 35 fragmentos de pulmões processados por fenol-clorofórmio, 85.71% foram positivos por PCR, contra 28.57% pelo kit comercial. A concordância por Kappa entre os métodos de extração de DNA foi 57%, estatisticamente significativa (p<0,05), mas, o Odds ratio foi 15 (CI 4.52 to 49.68), o que significa dizer que a probabilidade de positividade por PCR pelo método de fenol-clorofórmio foi 15 vezes maior do que pelo kit comercial. Os resultados da macroscopia e PCR foram discordantes, sendo a extração por fenol-clorofórmio o melhor entre ambos os procedimentos usados.(AU)