Resumo
O estudo da diversidade de Luffa cylindrica pode permitir triagens específicas para diferentes aplicações, visando uso e o melhoramento da espécie. Dados moleculares e de trinta descritores morfo-agronômicos foram utilizados em análises multivariadas na caracterização de 24 acessos de bucha provenientes de sete Estados brasileiros. Os resultados obtidos demonstraram que os acessos em estudo possuem ampla variabilidade potencial para todos os caracteres morfo-agronômicos analisados. Os caracteres que mais contribuíram para a divergência entre os acessos foram o comprimento dos frutos (62,32%) e a circunferência apical dos frutos (19,70%). Marcadores AFLP foram eficientes em agrupar os acessos de bucha provenientes de diferentes regiões brasileiras e apresentaram 66,8% de polimorfismo. O agrupamento obtido a partir da análise conjunta dos dados moleculares e morfo-agronômicos separou os acessos em quatro grupos e foi concordante com a análise bayesiana de agrupamento na separação dos acessos coletados no Norte com aqueles prospectados nas demais regiões brasileiras.
The study of the diversity of Luffa cylindrica may allow specific screening for different applications, aiming at the use and improvement of the species. Molecular data and thirty morpho-agronomic descriptors were used in multivariate analyzes to characterize 24 bushing accessions from seven Brazilian states. The results showed that the accessions under study have a wide potential variability for all the morpho-agronomic characters analyzed. The characters that most contributed to the divergence between the accessions were the fruit length (62.32%) and the apical circumference of the fruits (19.70%). AFLP markers were efficient in grouping the bushing access from different Brazilian regions and showed 66.8% of polymorphism. The clustering obtained from the joint analysis of molecular and morpho-agronomic data separated the accessions into four groups and was consistent with the Bayesian cluster analysis in the separation of accessions collected in the North with those prospected in the other Brazilian regions.
Assuntos
Luffa/genética , Melhoramento Vegetal , Variação Genética , Análise MultivariadaResumo
O estudo da diversidade de Luffa cylindrica pode permitir triagens específicas para diferentes aplicações, visando uso e o melhoramento da espécie. Dados moleculares e de trinta descritores morfo-agronômicos foram utilizados em análises multivariadas na caracterização de 24 acessos de bucha provenientes de sete Estados brasileiros. Os resultados obtidos demonstraram que os acessos em estudo possuem ampla variabilidade potencial para todos os caracteres morfo-agronômicos analisados. Os caracteres que mais contribuíram para a divergência entre os acessos foram o comprimento dos frutos (62,32%) e a circunferência apical dos frutos (19,70%). Marcadores AFLP foram eficientes em agrupar os acessos de bucha provenientes de diferentes regiões brasileiras e apresentaram 66,8% de polimorfismo. O agrupamento obtido a partir da análise conjunta dos dados moleculares e morfo-agronômicos separou os acessos em quatro grupos e foi concordante com a análise bayesiana de agrupamento na separação dos acessos coletados no Norte com aqueles prospectados nas demais regiões brasileiras.(AU)
The study of the diversity of Luffa cylindrica may allow specific screening for different applications, aiming at the use and improvement of the species. Molecular data and thirty morpho-agronomic descriptors were used in multivariate analyzes to characterize 24 bushing accessions from seven Brazilian states. The results showed that the accessions under study have a wide potential variability for all the morpho-agronomic characters analyzed. The characters that most contributed to the divergence between the accessions were the fruit length (62.32%) and the apical circumference of the fruits (19.70%). AFLP markers were efficient in grouping the bushing access from different Brazilian regions and showed 66.8% of polymorphism. The clustering obtained from the joint analysis of molecular and morpho-agronomic data separated the accessions into four groups and was consistent with the Bayesian cluster analysis in the separation of accessions collected in the North with those prospected in the other Brazilian regions.(AU)
Assuntos
Luffa/genética , Variação Genética , Melhoramento Vegetal , Análise MultivariadaResumo
Sacha inchi (Plukenetia volubilis) is native to the Amazon region and has a high seed content of mono and polyunsaturated fatty acids, making it interesting for the pharmaceutical and cosmetic industry. The purpose of this study was to analyze sacha inchi genetic diversity and describe accessions based on phenotypic characteristics. Fruits and seeds of 25 accessions from the sacha inchi genebank of Embrapa Amazônia Ocidental in Manaus, Amazonas state, were sampled and biometrically measured. The data were subjected to analysis of variance, Mahalanobis distance, canonical correlation, and genetic diversity among and within accessions by analysis of molecular variance (AMOVA). There were significant differences among the means of the analyzed traits, but no significant canonical correlation for the groups of traits. According to AMOVA, approximately 60% of the observed variation was within accessions. The results showed variability among accessions, and that the variation within accessions should be explored to obtain best results in breeding programs.
Sacha inchi (Plukenetia volubilis) é nativa da região amazônica e suas sementes tem um alto teor de ácidos graxos mono e poliinsaturados, tornando-a interessante para a indústria farmacêutica e cosmética. O objetivo deste estudo foi analisar a diversidade genética de sacha inchi e caracterizar os acessos com base em características fenotípicas. Foi realizada coleta e biometria de frutos e sementes de 25 acessos do banco de germoplasma de sacha inchi da Embrapa Amazônia Ocidental em Manaus-AM. Os dados foram submetidos a análise de variância, distância de Mahalanobis, correlação canônica e diversidade genética por análise de variância molecular (AMOVA). Houve diferenças significativas entre as médias das variáveis analisadas, contudo, não houve correlação canônica significativa para os grupos de variáveis. De acordo com AMOVA, aproximadamente 60% da variação observada esteve dentro de acessos. Os resultados mostram variabilidade entre acessos, sendo importante explorar a variação intra-acessos para obter melhores resultados em programas de melhoramento.
Assuntos
Ecossistema Amazônico , Euphorbiaceae , Variação Genética , Biometria , GenótipoResumo
Corynespora cassiicola is a cosmopolitan ascomycete widely known as phytopathogen in several crops, and more recently as an emerging pathogen in humans. In this study the genetic variability of 60 isolates of Corynespora cassiicola from different hosts and cities of Amazonas was evaluated, using AFLP molecular markers. Seven genetic groups were identified according to a dendrogram obtained by the Unweighted Pair Group Method using Arithmetical Averages, indicating significant variability among the isolates. Three isolates of different hosts (28, obtained from papaya; 55, obtained from cucumber; and 58, from tomato) remained as single individuals in distinct groups, suggesting marked genetic variation in comparison to the other isolates and possible specificity by the host.(AU)
Corynespora cassiicola é um ascomiceto cosmopolita amplamente conhecido como fitopatógeno em diversas culturas e, mais recentemente, como patógeno emergente em humanos. Na região Norte do Brasil é responsável por perdas significativas em cultivos tanto em casa de vegetação como em campo aberto. Neste estudo foi avaliada a variabilidade genética de 60 isolados de Corynespora cassiicola procedentes de diferentes hospedeiras e municípios do Amazonas, usando marcadores moleculares AFLP. Foram identificados sete grupos genéticos de acordo com dendrograma obtido pelo método de agrupamento UPGMA, indicando significativa variabilidade entre os isolados. Três isolados de diferentes hospedeiras (isolado 28, obtido de mamoeiro; isolado 55, obtido de pepineiro; e isolado 58, proveniente de tomateiro) permaneceram como indivíduos únicos em grupos distintos, sugerindo variação genética marcante em comparação com os demais e possível especificidade pela hospedeira de origem.(AU)
Assuntos
Fungos/patogenicidade , Noxas , Doenças das Plantas , Variação Biológica da PopulaçãoResumo
Corynespora cassiicola is a cosmopolitan ascomycete widely known as phytopathogen in several crops, and more recently as an emerging pathogen in humans. In this study the genetic variability of 60 isolates of Corynespora cassiicola from different hosts and cities of Amazonas was evaluated, using AFLP molecular markers. Seven genetic groups were identified according to a dendrogram obtained by the Unweighted Pair Group Method using Arithmetical Averages, indicating significant variability among the isolates. Three isolates of different hosts (28, obtained from papaya; 55, obtained from cucumber; and 58, from tomato) remained as single individuals in distinct groups, suggesting marked genetic variation in comparison to the other isolates and possible specificity by the host.(AU)
Corynespora cassiicola é um ascomiceto cosmopolita amplamente conhecido como fitopatógeno em diversas culturas e, mais recentemente, como patógeno emergente em humanos. Na região Norte do Brasil é responsável por perdas significativas em cultivos tanto em casa de vegetação como em campo aberto. Neste estudo foi avaliada a variabilidade genética de 60 isolados de Corynespora cassiicola procedentes de diferentes hospedeiras e municípios do Amazonas, usando marcadores moleculares AFLP. Foram identificados sete grupos genéticos de acordo com dendrograma obtido pelo método de agrupamento UPGMA, indicando significativa variabilidade entre os isolados. Três isolados de diferentes hospedeiras (isolado 28, obtido de mamoeiro; isolado 55, obtido de pepineiro; e isolado 58, proveniente de tomateiro) permaneceram como indivíduos únicos em grupos distintos, sugerindo variação genética marcante em comparação com os demais e possível especificidade pela hospedeira de origem.(AU)
Assuntos
Fungos/patogenicidade , Noxas , Doenças das Plantas , Variação Biológica da PopulaçãoResumo
Sacha inchi (Plukenetia volubilis) is native to the Amazon region and has a high seed content of mono and polyunsaturated fatty acids, making it interesting for the pharmaceutical and cosmetic industry. The purpose of this study was to analyze sacha inchi genetic diversity and describe accessions based on phenotypic characteristics. Fruits and seeds of 25 accessions from the sacha inchi genebank of Embrapa Amazônia Ocidental in Manaus, Amazonas state, were sampled and biometrically measured. The data were subjected to analysis of variance, Mahalanobis distance, canonical correlation, and genetic diversity among and within accessions by analysis of molecular variance (AMOVA). There were significant differences among the means of the analyzed traits, but no significant canonical correlation for the groups of traits. According to AMOVA, approximately 60% of the observed variation was within accessions. The results showed variability among accessions, and that the variation within accessions should be explored to obtain best results in breeding programs.(AU)
Sacha inchi (Plukenetia volubilis) é nativa da região amazônica e suas sementes tem um alto teor de ácidos graxos mono e poliinsaturados, tornando-a interessante para a indústria farmacêutica e cosmética. O objetivo deste estudo foi analisar a diversidade genética de sacha inchi e caracterizar os acessos com base em características fenotípicas. Foi realizada coleta e biometria de frutos e sementes de 25 acessos do banco de germoplasma de sacha inchi da Embrapa Amazônia Ocidental em Manaus-AM. Os dados foram submetidos a análise de variância, distância de Mahalanobis, correlação canônica e diversidade genética por análise de variância molecular (AMOVA). Houve diferenças significativas entre as médias das variáveis analisadas, contudo, não houve correlação canônica significativa para os grupos de variáveis. De acordo com AMOVA, aproximadamente 60% da variação observada esteve dentro de acessos. Os resultados mostram variabilidade entre acessos, sendo importante explorar a variação intra-acessos para obter melhores resultados em programas de melhoramento.(AU)
Assuntos
Ecossistema Amazônico , Euphorbiaceae , Variação Genética , Biometria , GenótipoResumo
Repeatability allows an estimation of the number of evaluations needed to optimize the selection of superior genotypes, with consequent effects on the research costs in terms of financial and human resources. The objective of this study was to estimate the coefficient of repeatability of biometric and yield traits, related to fruits and seeds of sacha inchi (Plukenetia volubilis), and to define the number of evaluations required for an efficient selection and evaluation of genotypes of the species. A total of 37 non-domesticated accessions were evaluated for 19 months in a randomized block design with 5 replications and 2 plants per plot. The total number of fruits, total number of seeds, total fruit weight, mean fruit weight, and number of seeds per fruit of the accessions were evaluated by monthly sampling. Additionally, seed biometry was assessed in a sample of 30 seeds per accession. Repeatability coefficients were estimated by analysis of variance, principal components and structural analysis. The principal component method based on the covariance matrix was the most appropriate for establishing repeatability estimates of sacha inchi, due to the cyclical nature of the crop. Superior genotypes of the species can be selected for yield-related traits with about 90% accuracy, from 5 harvests (months) onwards. To ensure this accuracy level, it would be necessary to evaluate a minimum of 5 and 25 fruits to determine mean fruit weight and number of seeds per fruit, respectively, and 39 seeds would be required to evaluate the biometric traits.(AU)
A repetibilidade permite estimar o número de avaliações para selecionar genótipos superiores com maior eficiência, o que tem reflexo direto sobre os gastos com recursos humanos e financeiros da pesquisa. O objetivo deste trabalho foi estimar o coeficiente de repetibilidade de características biométricas e de produção relacionadas aos frutos e sementes de sacha inchi (Plukenetia volubilis) e definir o número de avaliações necessárias para um eficiente processo de seleção e avaliação de genótipos da espécie. Um total de 37 acessos não domesticados foram avaliados em blocos casualizados com 5 repetições e 2 plantas por parcela durante 19 meses. Colheitas mensais avaliaram o número total de frutos, número total de sementes, peso total de frutos, peso médio de frutos e número de sementes por fruto dos acessos. Adicionalmente, foi realizada a biometria das sementes através de uma amostra de 30 sementes de cada acesso. Os coeficientes de repetibilidade foram estimados por meio dos métodos da análise de variância, componentes principais e análise estrutural. O método de componentes principais com uso da matriz de covariância se mostrou o mais indicado para obtenção de estimativas de repetibilidade em sacha inchi devido ao comportamento cíclico da cultura. Genótipos superiores da espécie podem ser selecionados, com acurácia de 90%, a partir de 5 colheitas (meses) para os caracteres de produtividade. Para mesma acurácia, seria necessária a avaliação de no mínimo 5 e 25 frutos para determinação do peso médio de frutos e número de sementes por fruto, respectivamente, e de 39 sementes para avaliação dos caracteres biométricos.(AU)