Bayesian modeling of the coffee tree growth curve / Modelagem bayesiana da curva de crescimento do cafeeiro

When modeling growth curves, it should be considered that longitudinal data may show residual autocorrelation, and, if this characteristic is not considered, the results and inferences may be compromised. The Bayesian approach, which considers priori information about studied phenomenon has been shown to be efficient in estimating parameters. However, as it is generally not possible to obtain marginal distributions analytically, it is necessary to use some method, such as the weighted resampling method, to generate samples of these distributions and thus obtain an approximation. Among the advantages of this method, stand out the generation of independent samples and the fact that it is not necessary to evaluate convergence. In this context, the objective of this work research was: to present the Bayesian nonlinear modeling of the coffee tree height growth, irrigated and non-irrigated (NI), considering the residual autocorrelation and the nonlinear Logistic, Brody, von Bertalanffy and Richard models. Among the results, it was found that, for NI plants, the Deviance Information Criterion (DIC) and the Criterion of density Predictive Ordered (CPO), indicated that, among the evaluated models, the Logistic model is the one that best describes the height growth of the coffee tree over time. For irrigated plants, these same criteria indicated the Brody model. Thus, the growth of the non-irrigated and irrigated coffee tree followed different growth patterns, the height of the non-irrigated coffee tree showed sigmoidal growth with maximum growth rate at 726 days after planting and the irrigated coffee tree starts its development with high growth rates that gradually decrease over time.

Na modelagem de curvas de crescimento deve-se considerar que dados longitudinais podem apresentar autocorrelação residual, sendo que, se tal característica não é considerada, os resultados e inferências podem ser comprometidos. A abordagem bayesiana, que considera informações à priori sobre o fenômeno em estudo tem se mostrado eficiente na estimação de parâmetros. No entanto, como geralmente não é possível obter as distribuições marginais de forma analítica, faz-se necessário a utilização de algum método, como o método de reamostragem ponderada, para gerar amostras dessas distribuições e assim obter uma aproximação para as mesmas. Dentre as vantagens desse método, destaca-se a geração de amostras independentes e o fato de não ser necessário avaliar convergência. Diante desse contexto, o objetivo deste trabalho foi apresentar a modelagem não linear bayesiana do crescimento em altura de plantas do cafeeiro, irrigadas e não irrigadas (NI), considerando a autocorrelação residual e os modelos não lineares Logístico, Brody, von Bertalanffy e Richards. Em vista dos resultados, verificou-se que, para as plantas NI, o DIC e CPOc, indicaram que, dentre os modelos avaliados, o modelo Logístico é o que melhor descreve o crescimento em altura do cafeeiro ao longo do tempo. E, para as plantas irrigadas, esses mesmos critérios indicaram o modelo Brody. Assim, o crescimento da planta do cafeeiro não irrigado e irrigado seguiram padrões de crescimento distintos, a altura do cafeeiro não irrigado apresentou crescimento sigmoidal com taxa máxima de crescimento aos 726 dias após o plantio, já o cafeeiro irrigado inicia seu desenvolvimento com altas taxas de crescimento que vão diminuindo aos poucos com o tempo.

Estimation of plot size for experiments with tissue culture in grape / Estimação do tamanho de parcela para experimento com cultura de tecidos em videira

The improvement of experimental techniques of in vitro culture may provide better identification and multiplication of most promising materials. The aim of this study was to estimate the plot size (explants numbers) for in vitro micropropagation grape. 15 tests were conducted uniformity formed by combinations of three rootstock vine with five different culture media. Nodes segments were used with about 2.5 cm, were excised and inoculated. After 90 days of inoculation, the variables shoot number, shoot length, shoot fresh weight, and fresh weight of callus were evaluated. For each assay, was simulated plots of differents sizes , with each tube containing one explant was considered as a basic unit. For estimation the optimum plot size we used the modified maximum curvature method and the least significant difference between means was obtained by the method of Hatheway. The results showed that the estimates of the plot size ranged from five (5) to 12 explants (tubes) in accordance with the variable used. For these variables, the optimal plot size should be formed by 12 explants.(AU)

O aprimoramento das técnicas experimentais do cultivo in vitro pode auxiliar em melhor identificação e multiplicação de materiais mais promissores. O objetivo desse trabalho foi a estimação do tamanho de parcelas (número de explantes) para micropropagação de videira in vitro. Foram conduzidos 15 ensaios de uniformidade formados pelas combinações de três porta-enxertos de videira com cinco diferentes meios de cultivo. Foram usados segmentos nodais com cerca 2,5 cm que foram excisados e inoculados. Após 90 dias de inoculação, foram feitas avaliações das variáveis: número de brotos, comprimento da parte aérea, a massa fresca da parte aérea e massa fresca de calos. Para cada ensaio, foram formados diversos tamanhos de parcelas, em que cada tubo, contendo um explante, foi considerado como uma unidade básica. Para a estimação do tamanho ótimo de parcela empregou-se o método da máxima curvatura modificado e as diferenças mínimas significativas entre médias foram obtidas pelo método de Hatheway. Os resultados mostraram que as estimativas do tamanho de parcela variaram de cinco (5) a 12 explantes (tubos) em acordo com a variável utilizada. Para as variáveis estudadas, o tamanho de parcela ótimo deve ser formado por 12 explantes.(AU)

Estimation of plot size for experiments with tissue culture in grape / Estimação do tamanho de parcela para experimento com cultura de tecidos em videira

The improvement of experimental techniques of in vitro culture may provide better identification and multiplication of most promising materials. The aim of this study was to estimate the plot size (explants numbers) for in vitro micropropagation grape. 15 tests were conducted uniformity formed by combinations of three rootstock vine with five different culture media. Nodes segments were used with about 2.5 cm, were excised and inoculated. After 90 days of inoculation, the variables shoot number, shoot length, shoot fresh weight, and fresh weight of callus were evaluated. For each assay, was simulated plots of differents sizes , with each tube containing one explant was considered as a basic unit. For estimation the optimum plot size we used the modified maximum curvature method and the least significant difference between means was obtained by the method of Hatheway. The results showed that the estimates of the plot size ranged from five (5) to 12 explants (tubes) in accordance with the variable used. For these variables, the optimal plot size should be formed by 12 explants.

O aprimoramento das técnicas experimentais do cultivo in vitro pode auxiliar em melhor identificação e multiplicação de materiais mais promissores. O objetivo desse trabalho foi a estimação do tamanho de parcelas (número de explantes) para micropropagação de videira in vitro. Foram conduzidos 15 ensaios de uniformidade formados pelas combinações de três porta-enxertos de videira com cinco diferentes meios de cultivo. Foram usados segmentos nodais com cerca 2,5 cm que foram excisados e inoculados. Após 90 dias de inoculação, foram feitas avaliações das variáveis: número de brotos, comprimento da parte aérea, a massa fresca da parte aérea e massa fresca de calos. Para cada ensaio, foram formados diversos tamanhos de parcelas, em que cada tubo, contendo um explante, foi considerado como uma unidade básica. Para a estimação do tamanho ótimo de parcela empregou-se o método da máxima curvatura modificado e as diferenças mínimas significativas entre médias foram obtidas pelo método de Hatheway. Os resultados mostraram que as estimativas do tamanho de parcela variaram de cinco (5) a 12 explantes (tubos) em acordo com a variável utilizada. Para as variáveis estudadas, o tamanho de parcela ótimo deve ser formado por 12 explantes.