Expression analysis of transcription factors in sugarcane during cold stress / Análise de expressão de fatores de transcrição em cana-de-açúcar sob estresse por frio

Transcription factors (TF) are a wide class of genes in plants, and these can regulate the expression of other genes in response to various environmental stresses (biotic and abiotic). In the current study, transcription factor activity in sugarcane was examined during cold stress. Initially, RNA transcript reads of two sugarcane cultivars (ROC22 and GT08-1108) under cold stress were downloaded from SRA NCBI database. The reads were aligned into a reference genome and the differential expression analyses were performed with the R/Bioconductor edgeR package. Based on our analyses in the ROC22 cultivar, 963 TF genes were significantly upregulated under cold stress among a total of 5649 upregulated genes, while 293 TF genes were downregulated among a total of 3,289 downregulated genes. In the GT08-1108 cultivar, 974 TF genes were identified among 5,649 upregulated genes and 283 TF genes were found among 3,289 downregulated genes. Most transcription factors were annotated with GO categories related to protein binding, transcription factor binding, DNA-sequence-specific binding, transcription factor complex, transcription factor activity in RNA polymerase II, the activity of nucleic acid binding transcription factor, transcription corepressor activity, sequence-specific regulatory region, the activity of transcription factor of RNA polymerase II, transcription factor cofactor activity, transcription factor activity from plastid promoter, transcription factor activity from RNA polymerase I promoter, polymerase II and RNA polymerase III. The findings of above results will help to identify differentially expressed transcription factors during cold stress. It also provides a comprehensive analysis of the regulation of the transcription activity of many genes. Therefore, this study provides the molecular basis for improving cold tolerance in sugarcane and other economically important grasses.

Fatores de transcrição (FT) são uma ampla classe de genes em plantas e podem regular a expressão de outros genes em resposta a vários estresses ambientais (estresses bióticos e abióticos). No presente estudo, a atividade do fator de transcrição na cana-de-açúcar foi examinada durante o estresse pelo frio. Inicialmente, as leituras de transcrição de RNA de duas cultivares de cana-de-açúcar (ROC22 e GT08-1108) sob estresse frio foram baixadas do banco de dados SRA NCBI. As leituras foram alinhadas em um genoma de referência e as análises de expressão diferencial foram realizadas com o pacote R / Bioconductor edgeR. Com base em nossas análises no cultivar ROC22, 963 genes TF foram significativamente regulados positivamente sob estresse pelo frio entre um total de 5.649 genes regulados positivamente, enquanto 293 genes TF foram regulados negativamente entre um total de 3.289 genes regulados negativamente. No cultivar GT08-1108, 974 genes TF foram identificados entre 5.649 genes regulados positivamente e 283 genes TF foram encontrados entre 3.289 genes regulados negativamente. Os fatores de transcrição, em sua maioria, foram anotados com categorias GO relacionadas à ligação de proteína, ligação de fator de transcrição, ligação específica de sequência de DNA, complexo de fator de transcrição, atividade de fator de transcrição em RNA polimerase II, atividade de fator de transcrição de ligação de ácido nucleico, atividade de corepressor de transcrição, sequência específica da região reguladora, atividade do fator de transcrição da RNA polimerase II, atividade do cofator do fator de transcrição, atividade do fator de transcrição do promotor do plastídio, atividade do fator de transcrição do promotor da RNA polimerase I, polimerase II e RNA polimerase III. As descobertas dos resultados acima ajudarão a identificar fatores de transcrição expressos diferencialmente durante o estresse pelo frio. Ele também fornece uma análise abrangente da regulação da atividade [...].

Expression analysis of transcription factors in sugarcane during cold stress

Abstract Transcription factors (TF) are a wide class of genes in plants, and these can regulate the expression of other genes in response to various environmental stresses (biotic and abiotic). In the current study, transcription factor activity in sugarcane was examined during cold stress. Initially, RNA transcript reads of two sugarcane cultivars (ROC22 and GT08-1108) under cold stress were downloaded from SRA NCBI database. The reads were aligned into a reference genome and the differential expression analyses were performed with the R/Bioconductor edgeR package. Based on our analyses in the ROC22 cultivar, 963 TF genes were significantly upregulated under cold stress among a total of 5649 upregulated genes, while 293 TF genes were downregulated among a total of 3,289 downregulated genes. In the GT08-1108 cultivar, 974 TF genes were identified among 5,649 upregulated genes and 283 TF genes were found among 3,289 downregulated genes. Most transcription factors were annotated with GO categories related to protein binding, transcription factor binding, DNA-sequence-specific binding, transcription factor complex, transcription factor activity in RNA polymerase II, the activity of nucleic acid binding transcription factor, transcription corepressor activity, sequence-specific regulatory region, the activity of transcription factor of RNA polymerase II, transcription factor cofactor activity, transcription factor activity from plastid promoter, transcription factor activity from RNA polymerase I promoter, polymerase II and RNA polymerase III. The findings of above results will help to identify differentially expressed transcription factors during cold stress. It also provides a comprehensive analysis of the regulation of the transcription activity of many genes. Therefore, this study provides the molecular basis for improving cold tolerance in sugarcane and other economically important grasses.

Resumo Fatores de transcrição (FT) são uma ampla classe de genes em plantas e podem regular a expressão de outros genes em resposta a vários estresses ambientais (estresses bióticos e abióticos). No presente estudo, a atividade do fator de transcrição na cana-de-açúcar foi examinada durante o estresse pelo frio. Inicialmente, as leituras de transcrição de RNA de duas cultivares de cana-de-açúcar (ROC22 e GT08-1108) sob estresse frio foram baixadas do banco de dados SRA NCBI. As leituras foram alinhadas em um genoma de referência e as análises de expressão diferencial foram realizadas com o pacote R / Bioconductor edgeR. Com base em nossas análises no cultivar ROC22, 963 genes TF foram significativamente regulados positivamente sob estresse pelo frio entre um total de 5.649 genes regulados positivamente, enquanto 293 genes TF foram regulados negativamente entre um total de 3.289 genes regulados negativamente. No cultivar GT08-1108, 974 genes TF foram identificados entre 5.649 genes regulados positivamente e 283 genes TF foram encontrados entre 3.289 genes regulados negativamente. Os fatores de transcrição, em sua maioria, foram anotados com categorias GO relacionadas à ligação de proteína, ligação de fator de transcrição, ligação específica de sequência de DNA, complexo de fator de transcrição, atividade de fator de transcrição em RNA polimerase II, atividade de fator de transcrição de ligação de ácido nucleico, atividade de corepressor de transcrição, sequência específica da região reguladora, atividade do fator de transcrição da RNA polimerase II, atividade do cofator do fator de transcrição, atividade do fator de transcrição do promotor do plastídio, atividade do fator de transcrição do promotor da RNA polimerase I, polimerase II e RNA polimerase III. As descobertas dos resultados acima ajudarão a identificar fatores de transcrição expressos diferencialmente durante o estresse pelo frio. Ele também fornece uma análise abrangente da regulação da atividade de transcrição de muitos genes. Portanto, este estudo fornece base molecular para melhorar a tolerância ao frio em cana-de-açúcar e outras gramíneas economicamente importantes.

Expression analysis of transcription factors in sugarcane during cold stress / Análise de expressão de fatores de transcrição em cana-de-açúcar sob estresse por frio

Abstract Transcription factors (TF) are a wide class of genes in plants, and these can regulate the expression of other genes in response to various environmental stresses (biotic and abiotic). In the current study, transcription factor activity in sugarcane was examined during cold stress. Initially, RNA transcript reads of two sugarcane cultivars (ROC22 and GT08-1108) under cold stress were downloaded from SRA NCBI database. The reads were aligned into a reference genome and the differential expression analyses were performed with the R/Bioconductor edgeR package. Based on our analyses in the ROC22 cultivar, 963 TF genes were significantly upregulated under cold stress among a total of 5649 upregulated genes, while 293 TF genes were downregulated among a total of 3,289 downregulated genes. In the GT08-1108 cultivar, 974 TF genes were identified among 5,649 upregulated genes and 283 TF genes were found among 3,289 downregulated genes. Most transcription factors were annotated with GO categories related to protein binding, transcription factor binding, DNA-sequence-specific binding, transcription factor complex, transcription factor activity in RNA polymerase II, the activity of nucleic acid binding transcription factor, transcription corepressor activity, sequence-specific regulatory region, the activity of transcription factor of RNA polymerase II, transcription factor cofactor activity, transcription factor activity from plastid promoter, transcription factor activity from RNA polymerase I promoter, polymerase II and RNA polymerase III. The findings of above results will help to identify differentially expressed transcription factors during cold stress. It also provides a comprehensive analysis of the regulation of the transcription activity of many genes. Therefore, this study provides the molecular basis for improving cold tolerance in sugarcane and other economically important grasses.

Resumo Fatores de transcrição (FT) são uma ampla classe de genes em plantas e podem regular a expressão de outros genes em resposta a vários estresses ambientais (estresses bióticos e abióticos). No presente estudo, a atividade do fator de transcrição na cana-de-açúcar foi examinada durante o estresse pelo frio. Inicialmente, as leituras de transcrição de RNA de duas cultivares de cana-de-açúcar (ROC22 e GT08-1108) sob estresse frio foram baixadas do banco de dados SRA NCBI. As leituras foram alinhadas em um genoma de referência e as análises de expressão diferencial foram realizadas com o pacote R / Bioconductor edgeR. Com base em nossas análises no cultivar ROC22, 963 genes TF foram significativamente regulados positivamente sob estresse pelo frio entre um total de 5.649 genes regulados positivamente, enquanto 293 genes TF foram regulados negativamente entre um total de 3.289 genes regulados negativamente. No cultivar GT08-1108, 974 genes TF foram identificados entre 5.649 genes regulados positivamente e 283 genes TF foram encontrados entre 3.289 genes regulados negativamente. Os fatores de transcrição, em sua maioria, foram anotados com categorias GO relacionadas à ligação de proteína, ligação de fator de transcrição, ligação específica de sequência de DNA, complexo de fator de transcrição, atividade de fator de transcrição em RNA polimerase II, atividade de fator de transcrição de ligação de ácido nucleico, atividade de corepressor de transcrição, sequência específica da região reguladora, atividade do fator de transcrição da RNA polimerase II, atividade do cofator do fator de transcrição, atividade do fator de transcrição do promotor do plastídio, atividade do fator de transcrição do promotor da RNA polimerase I, polimerase II e RNA polimerase III. As descobertas dos resultados acima ajudarão a identificar fatores de transcrição expressos diferencialmente durante o estresse pelo frio. Ele também fornece uma análise abrangente da regulação da atividade de transcrição de muitos genes. Portanto, este estudo fornece base molecular para melhorar a tolerância ao frio em cana-de-açúcar e outras gramíneas economicamente importantes.

Expression analysis of transcription factors in sugarcane during cold stress / Análise de expressão de fatores de transcrição em cana-de-açúcar sob estresse por frio

Transcription factors (TF) are a wide class of genes in plants, and these can regulate the expression of other genes in response to various environmental stresses (biotic and abiotic). In the current study, transcription factor activity in sugarcane was examined during cold stress. Initially, RNA transcript reads of two sugarcane cultivars (ROC22 and GT08-1108) under cold stress were downloaded from SRA NCBI database. The reads were aligned into a reference genome and the differential expression analyses were performed with the R/Bioconductor edgeR package. Based on our analyses in the ROC22 cultivar, 963 TF genes were significantly upregulated under cold stress among a total of 5649 upregulated genes, while 293 TF genes were downregulated among a total of 3,289 downregulated genes. In the GT08-1108 cultivar, 974 TF genes were identified among 5,649 upregulated genes and 283 TF genes were found among 3,289 downregulated genes. Most transcription factors were annotated with GO categories related to protein binding, transcription factor binding, DNA-sequence-specific binding, transcription factor complex, transcription factor activity in RNA polymerase II, the activity of nucleic acid binding transcription factor, transcription corepressor activity, sequence-specific regulatory region, the activity of transcription factor of RNA polymerase II, transcription factor cofactor activity, transcription factor activity from plastid promoter, transcription factor activity from RNA polymerase I promoter, polymerase II and RNA polymerase III. The findings of above results will help to identify differentially expressed transcription factors during cold stress. It also provides a comprehensive analysis of the regulation of the transcription activity of many genes. Therefore, this study provides the molecular basis for improving cold tolerance in sugarcane and other economically important grasses.(AU)

Fatores de transcrição (FT) são uma ampla classe de genes em plantas e podem regular a expressão de outros genes em resposta a vários estresses ambientais (estresses bióticos e abióticos). No presente estudo, a atividade do fator de transcrição na cana-de-açúcar foi examinada durante o estresse pelo frio. Inicialmente, as leituras de transcrição de RNA de duas cultivares de cana-de-açúcar (ROC22 e GT08-1108) sob estresse frio foram baixadas do banco de dados SRA NCBI. As leituras foram alinhadas em um genoma de referência e as análises de expressão diferencial foram realizadas com o pacote R / Bioconductor edgeR. Com base em nossas análises no cultivar ROC22, 963 genes TF foram significativamente regulados positivamente sob estresse pelo frio entre um total de 5.649 genes regulados positivamente, enquanto 293 genes TF foram regulados negativamente entre um total de 3.289 genes regulados negativamente. No cultivar GT08-1108, 974 genes TF foram identificados entre 5.649 genes regulados positivamente e 283 genes TF foram encontrados entre 3.289 genes regulados negativamente. Os fatores de transcrição, em sua maioria, foram anotados com categorias GO relacionadas à ligação de proteína, ligação de fator de transcrição, ligação específica de sequência de DNA, complexo de fator de transcrição, atividade de fator de transcrição em RNA polimerase II, atividade de fator de transcrição de ligação de ácido nucleico, atividade de corepressor de transcrição, sequência específica da região reguladora, atividade do fator de transcrição da RNA polimerase II, atividade do cofator do fator de transcrição, atividade do fator de transcrição do promotor do plastídio, atividade do fator de transcrição do promotor da RNA polimerase I, polimerase II e RNA polimerase III. As descobertas dos resultados acima ajudarão a identificar fatores de transcrição expressos diferencialmente durante o estresse pelo frio. Ele também fornece uma análise abrangente da regulação da atividade [...].(AU)

A neotype for Hyla x-signata Spix, 1824 (Amphibia, Anura, Hylidae)

The uncertain identity of Hyla x-signata Spix, 1824 has been a pervasive problem in the taxonomy of the genus Scinax. A species supposedly distributed from northeastern Brazil northwards to Colombia and Venezuela, described in a few lines without much information and with an accompanying figure, and its type specimen lost during World War II, combined to produce a curious situation. Twenty-one of the 39 species of the S. ruber Clade described in the last 50 years were considered to require a diagnosis from S. x-signatus by their authors. In most cases these had no other alternative than to gather information about this species from indirect sources, frequently pointing out the problems associated with its uncertain identity. In this paper, we review the taxonomic history of Hyla x-signata, designate a neotype, provide a redescription including advertisement call and sequence data, and diagnose it from all other species of the S. ruber Clade.

A neotype for Hyla x-signata Spix, 1824 (Amphibia, Anura, Hylidae)

Abstract The uncertain identity of Hyla x-signata Spix, 1824 has been a pervasive problem in the taxonomy of the genus Scinax. A species supposedly distributed from northeastern Brazil northwards to Colombia and Venezuela, described in a few lines without much information and with an accompanying figure, and its type specimen lost during World War II, combined to produce a curious situation. Twenty-one of the 39 species of the S. ruber Clade described in the last 50 years were considered to require a diagnosis from S. x-signatus by their authors. In most cases these had no other alternative than to gather information about this species from indirect sources, frequently pointing out the problems associated with its uncertain identity. In this paper, we review the taxonomic history of Hyla x-signata, designate a neotype, provide a redescription including advertisement call and sequence data, and diagnose it from all other species of the S. ruber Clade.

A neotype for Hyla x-signata Spix, 1824 (Amphibia, Anura, Hylidae)

The uncertain identity of Hyla x-signata Spix, 1824 has been a pervasive problem in the taxonomy of the genus Scinax. A species supposedly distributed from northeastern Brazil northwards to Colombia and Venezuela, described in a few lines without much information and with an accompanying figure, and its type specimen lost during World War II, combined to produce a curious situation. Twenty-one of the 39 species of the S. ruber Clade described in the last 50 years were considered to require a diagnosis from S. x-signatus by their authors. In most cases these had no other alternative than to gather information about this species from indirect sources, frequently pointing out the problems associated with its uncertain identity. In this paper, we review the taxonomic history of Hyla x-signata, designate a neotype, provide a redescription including advertisement call and sequence data, and diagnose it from all other species of the S. ruber Clade.(AU)

Soroepidemiologia e distribuição espacial da infecção por Leptospira spp. em caprinos do estado de Pernambuco, Brasil / Seroepidemiology and spatial distribution of Leptospira spp. infection among goats in the state of Pernambuco, Brazil / Seroepidemiología y distribuición espacial de la infección por Leptospira spp. en caprinos del estado de Pernambuco, Brasil

Objetivou-se com este trabalho analisar os aspectos epidemiológicos relacionados à infecção por Leptospira spp. em caprinos no Agreste e do Sertão do Estado de Pernambuco, Brasil. Foram coletadas 476 amostras de sangue de animais com idade igual ou superior a um ano, não vacinados. A pesquisa de anticorpos foi realizada pela técnica de Soroaglutinação Microscópica (SAM). Para o estudo dos fatores de risco aplicou-se um questionário investigativo padronizado, constituído por perguntas objetivas ao criador, referentes às características de manejo produtivo, reprodutivo e sanitário. Das 476 amostras analisadas, 27,3% (130/476; I.C. 23,4% -31,6%) foram positivas. Em relação às propriedades, observou-se que 87,5%, apresentaram ao menos um animal positivo. O sorovar mais prevalente foi o Autumnalis (54,1%), que também apresentou maior distribuição nos diferentes pontos de estudo. Na análise de fatores de risco, a variável sexo (macho) apresentou diferença significativa (OR=0,40; I.C. 0,18 –0,88; p=0,023). Observou-se neste estudo uma elevada prevalência da infecção por Leptospira spp. em caprinos e que a mesma ocorre nas diferentes regiões do estudo. Desta forma, sugere-se que medidas de profilaxia sejam implementadas visando à redução da prevalência nos rebanhos e consequentemente perdas econômicas para o produtor, assim como risco para Saúde Pública.(AU)

The aim of the present study was to analyze the epidemiological aspects associated with Leptospira spp. infection among goats in the Agreste and Sertão regions of the state of Pernambuco, Brazil. In total, 476 blood samples were collected from non-vaccinated animals aged one year or more. The antibody research was carried out using the Microscopic Agglutination Test (MAT). In order to determine risk factors, a standardized investigative questionnaire was used to ask the owner objective questions about the productive, reproductive and sanitary management characteristics of the property. Of the 476 samples analyzed, 27.3% (130/476; C.I. 23.4% -31.6%) were positive. Regarding the properties, it was observed that 87.5% presented at least one positive animal. The most common serovar was Autumnalis (54.1%), which also exhibited the greatest distribution in the different points of the study. In the risk factor analysis, a significant difference (OR=0.40; C.I. 0.18 –0.88; p=0.023) was found for the variable gender (male). Thus, it is suggested that prophylactic measures are implemented in order to reduce the prevalence in herds and consequently economic losses for producers, as well as risk to public health.(AU)

El objetivo de este trabajo fué analisar los aspectos epidemiológicos relacionados con la infección por Leptospira spp. en caprinos en la región Agreste y Sertão del Estado de Pernambuco, Brasil. Fueran analisadas 476 muestras de caprinos no vacunados y con edad igual o superior a un año. La búsqueda de anticuerpos ha sido hecha en la técnica de aglutinación sérica Microscópica. Para la análisis de riesgo, inicialmente se aplicó un cuestionário stándar con preguntas a los ganaderos, relacionadas con las características de manejo productivo, reproductivo y sanitario. De las 476 muestras analisadas, 27,3% (130/476; I.C. 23,4% -31,6%) fueran positivas. En cuanto a las propiedades, se observó que el 87,5%, presentó por lo menos un animal positivo.El serovar más prevalente fué Autumnalis (54,1%), que también presentó una distribuición más elevada en los distintos puntos del estudio. En la análisis de los factores de riesgo, el sexo masculino presentó diferencia significativa (OR=0,40; I.C. 0,18 –0,88; p=0,023). Se observó en este estudio una alta prevalencia de infección por Leptospira spp. en caprinos y que la misma ocurre en las distintas regiones de este estudio. En conclusión, és importante implementar medidas de profilaxia con el objetivo de reducir la prevalencia de la infección en los rebaños y las pérdidas económicas para el ganadero y también el riego para la Salud Pública.(AU)

Soroepidemiologia e distribuição espacial da infecção por Leptospira spp. em caprinos do estado de Pernambuco, Brasil / Seroepidemiology and spatial distribution of Leptospira spp. infection among goats in the state of Pernambuco, Brazil / Seroepidemiología y distribuición espacial de la infección por Leptospira spp. en caprinos del estado de Pernambuco, Brasil

Objetivou-se com este trabalho analisar os aspectos epidemiológicos relacionados à infecção por Leptospira spp. em caprinos no Agreste e do Sertão do Estado de Pernambuco, Brasil. Foram coletadas 476 amostras de sangue de animais com idade igual ou superior a um ano, não vacinados. A pesquisa de anticorpos foi realizada pela técnica de Soroaglutinação Microscópica (SAM). Para o estudo dos fatores de risco aplicou-se um questionário investigativo padronizado, constituído por perguntas objetivas ao criador, referentes às características de manejo produtivo, reprodutivo e sanitário. Das 476 amostras analisadas, 27,3% (130/476; I.C. 23,4% -31,6%) foram positivas. Em relação às propriedades, observou-se que 87,5%, apresentaram ao menos um animal positivo. O sorovar mais prevalente foi o Autumnalis (54,1%), que também apresentou maior distribuição nos diferentes pontos de estudo. Na análise de fatores de risco, a variável sexo (macho) apresentou diferença significativa (OR=0,40; I.C. 0,18 –0,88; p=0,023). Observou-se neste estudo uma elevada prevalência da infecção por Leptospira spp. em caprinos e que a mesma ocorre nas diferentes regiões do estudo. Desta forma, sugere-se que medidas de profilaxia sejam implementadas visando à redução da prevalência nos rebanhos e consequentemente perdas econômicas para o produtor, assim como risco para Saúde Pública.

The aim of the present study was to analyze the epidemiological aspects associated with Leptospira spp. infection among goats in the Agreste and Sertão regions of the state of Pernambuco, Brazil. In total, 476 blood samples were collected from non-vaccinated animals aged one year or more. The antibody research was carried out using the Microscopic Agglutination Test (MAT). In order to determine risk factors, a standardized investigative questionnaire was used to ask the owner objective questions about the productive, reproductive and sanitary management characteristics of the property. Of the 476 samples analyzed, 27.3% (130/476; C.I. 23.4% -31.6%) were positive. Regarding the properties, it was observed that 87.5% presented at least one positive animal. The most common serovar was Autumnalis (54.1%), which also exhibited the greatest distribution in the different points of the study. In the risk factor analysis, a significant difference (OR=0.40; C.I. 0.18 –0.88; p=0.023) was found for the variable gender (male). Thus, it is suggested that prophylactic measures are implemented in order to reduce the prevalence in herds and consequently economic losses for producers, as well as risk to public health.

El objetivo de este trabajo fué analisar los aspectos epidemiológicos relacionados con la infección por Leptospira spp. en caprinos en la región Agreste y Sertão del Estado de Pernambuco, Brasil. Fueran analisadas 476 muestras de caprinos no vacunados y con edad igual o superior a un año. La búsqueda de anticuerpos ha sido hecha en la técnica de aglutinación sérica Microscópica. Para la análisis de riesgo, inicialmente se aplicó un cuestionário stándar con preguntas a los ganaderos, relacionadas con las características de manejo productivo, reproductivo y sanitario. De las 476 muestras analisadas, 27,3% (130/476; I.C. 23,4% -31,6%) fueran positivas. En cuanto a las propiedades, se observó que el 87,5%, presentó por lo menos un animal positivo.El serovar más prevalente fué Autumnalis (54,1%), que también presentó una distribuición más elevada en los distintos puntos del estudio. En la análisis de los factores de riesgo, el sexo masculino presentó diferencia significativa (OR=0,40; I.C. 0,18 –0,88; p=0,023). Se observó en este estudio una alta prevalencia de infección por Leptospira spp. en caprinos y que la misma ocurre en las distintas regiones de este estudio. En conclusión, és importante implementar medidas de profilaxia con el objetivo de reducir la prevalencia de la infección en los rebaños y las pérdidas económicas para el ganadero y también el riego para la Salud Pública.

Seroepidemiología y distribuición espacial de la infección por Leptospira spp. en caprinos del Estado de Pernambuco, Brasil / Seroepidemiology and spatial distribution of Leptospira spp. infection among goats in the State of Pernambuco, Brazil / Soroepidemiologia e distribuição espacial da infecção por Leptospira spp. em caprinos do Estado de Pernambuco, Brasil

RESUMEN: El objetivo de este trabajo fué analisar los aspectos epidemiológicos relacionados com la infección por Leptospira spp. en caprinos el la región Agreste y Sertão del Estado de Pernambuco, Brasil. Fueran analisadas 476 muestras de caprinos no vacunados y con edad igual o superior a un año. La búsqueda de anticuerpos ha sido hecha en la técnica de Soroaglutinación Microscópica. Para la análisi de riesgo, inicialmente se aplicó un cuestionário stándar con preguntas a los ganaderos, relacionadas con las características de manejo productivo, reproductivo y sanitario. De las 476 muestras analisadas, 27,3% (130/476; I.C. 23,4% - 31,6%) fueran positivas. En cuanto a las propiedades, se observó que el 87,5%, presentó menos un animal positivo. El serovar más prevalente fué Autumnalis (54,1%), que también presentó una distribuición más elevada en los distintos puntos del estudio. En la análisis de los factores de riesgo, el sexo masculino presentó diferencia significativa (OR=0,40; I.C. 0,18 0,88; p=0,023). Se observó en este estudio una alta prevalencia de infección por Leptospira spp. en caprinos y que la misma ocurre en las distintas regiones de este estudio. En conclusión, és importante implementar medidas de profilaxia con el objetivo de reducir la prevalencia de la infección en los rebaños y las pérdidas económicas para el ganadero y también el riego para la Salud Pública

ABSTRACT: The aim of the present study was to analyze epidemiological aspects associated with Leptospira spp. infection among goats in the Agreste and Sertão regions of the state of Pernambuco, Brazil. In total, 476 samples were collected from non-vaccinated animals aged one year or more. The antibody research was carried out using the Microscopic Agglutination Test (MAT). In order to determine risk factors, a standardized investigative questionnaire was used to ask the owner objective questions about the productive, reproductive and sanitary management characteristics of the property. Of the 476 samples analyzed, 27.3% (130/476; C.I. 23.4% - 31.6%) were positive. Regarding the properties, it was observed that 87.5% presented at least one positive animal. The most common serovar was Autumnalis (54.1%), which also exhibited the greatest distribution in the different points of the study. In the risk factor analysis, a significant difference (OR=0.40; C.I. 0.18 0.88; p=0.023) was found for the variable gender (male). Thus, it is suggested that prophylactic measures are implemented in order to reduce the prevalence in herds and consequently economic losses for producers, as well as risk to public health.

RESUMO: Objetivou-se com este trabalho analisar os aspectos epidemiológicos relacionados à infecção por Leptospira spp. em caprinos no Agreste e do Sertão do Estado de Pernambuco, Brasil. Foram coletadas 476 amostras de animais com idade igual ou superior a um ano, não vacinados. A pesquisa de anticorpos foi realizada pela técnica de Soroaglutinação Microscópica (SAM). Para o estudo dos fatores de risco aplicou-se um questionário investigativo padronizado, constituído por perguntas objetivas ao criador, referentes às características de manejo produtivo, reprodutivo e sanitário. Das 476 amostras analisadas, 27,3% (130/476; I.C. 23,4% - 31,6%) foram positivas. Em relação às propriedades, observou-se que 87,5%, apresentaram ao menos um animal positivo. O sorovar mais prevalente foi o Autumnalis (54,1%), que também apresentou maior distribuição nos diferentes pontos de estudo. Na análise de fatores de risco, o variável sexo (macho) apresentou diferença significativa (OR=0,40; I.C. 0,18 0,88; p=0,023). Observou-se neste estudo uma elevada prevalência da infecção por Leptospira spp. em caprinos e que a mesma ocorre nas diferentes regiões do estudo. Desta forma, sugere-se que medidas de profilaxia sejam implementadas visando à redução da prevalência nos rebanhos e consequentemente perdas econômicas para o produtor, assim como risco para Saúde Pública.