Using community phylogenetics to assess phylogenetic structure in the Fitzcarrald region of Western Amazonia

Here we explore the use of community phylogenetics as a tool to document patterns of biodiversity in the Fitzcarrald region, a remote area in Southwestern Amazonia. For these analyses, we subdivide the region into basin-wide assemblages encompassing the headwaters of four Amazonian tributaries (Urubamba, Yuruá, Purús and Las Piedras basins), and habitat types: river channels, terra firme (non-floodplain) streams, and floodplain lakes. We present a robust, well-documented collection of fishes from the region including 272 species collected from 132 field sites over 63 field days and four years, comprising the most extensive collection of fishes from this region to date. We conduct a preliminary community phylogenetic analysis based on this collection and recover results largely statistically indistinguishable from the random expectation, with only a few instances of phylogenetic structure. Based on these results, and of those published in other recent biogeographic studies, we conclude that the Fitzcarrald fish species pool accumulated over a period of several million years, plausibly as a result of dispersal from the larger species pool of Greater Amazonia.(AU)

Aquí exploramos el uso de la filogenética de comunidades como herramienta para documentar patrones de biodiversidad en la región de Fitzcarrald, un área remota en el suroeste de la Amazonía. Para estos análisis subdividimos la región en grupos de toda la cuenca que abarcan las cabeceras de cuatro tributarios del Amazonas (cuencas Urubamba, Yuruá, Purús y Las Piedras) y en los tipos de hábitat: canales fluviales, arroyos de tierra firme (sin planicie aluvial) y lagos de planicie aluvial. Presentamos una colección de peces robusta y bien documentada que incluye 272 especies, colectadas a lo largo de cuatro años y 63 días de campo, en 132 puntos de monitoreo. Convirtiéndose en la colección más extensa de peces de esta región hasta la fecha. Realizamos un análisis filogenético preliminar de la comunidad basado en esta recopilación y recuperamos resultados en gran medida estadísticamente indistinguibles de la expectativa aleatoria, con sólo unos pocos casos de estructura filogenética. Basándonos en estos resultados y los publicados en otros estudios biogeográficos recientes, concluimos que el grupo de especies de peces de Fitzcarrald acumulado durante un período de varios millones de años, se debe posiblemente al resultado de la dispersión del mayor grupo de especies de la Gran Amazonia.(AU)

Using community phylogenetics to assess phylogenetic structure in the Fitzcarrald region of Western Amazonia

RESUMEN Aquí exploramos el uso de la filogenética de comunidades como herramienta para documentar patrones de biodiversidad en la región de Fitzcarrald, un área remota en el suroeste de la Amazonía. Para estos análisis subdividimos la región en grupos de toda la cuenca que abarcan las cabeceras de cuatro tributarios del Amazonas (cuencas Urubamba, Yuruá, Purús y Las Piedras) y en los tipos de hábitat: canales fluviales, arroyos de tierra firme (sin planicie aluvial) y lagos de planicie aluvial. Presentamos una colección de peces robusta y bien documentada que incluye 272 especies, colectadas a lo largo de cuatro años y 63 días de campo, en 132 puntos de monitoreo. Convirtiéndose en la colección más extensa de peces de esta región hasta la fecha. Realizamos un análisis filogenético preliminar de la comunidad basado en esta recopilación y recuperamos resultados en gran medida estadísticamente indistinguibles de la expectativa aleatoria, con sólo unos pocos casos de estructura filogenética. Basándonos en estos resultados y los publicados en otros estudios biogeográficos recientes, concluimos que el grupo de especies de peces de Fitzcarrald acumulado durante un período de varios millones de años, se debe posiblemente al resultado de la dispersión del mayor grupo de especies de la Gran Amazonia.

ABSTRACT Here we explore the use of community phylogenetics as a tool to document patterns of biodiversity in the Fitzcarrald region, a remote area in Southwestern Amazonia. For these analyses, we subdivide the region into basin-wide assemblages encompassing the headwaters of four Amazonian tributaries (Urubamba, Yuruá, Purús and Las Piedras basins), and habitat types: river channels, terra firme (non-floodplain) streams, and floodplain lakes. We present a robust, well-documented collection of fishes from the region including 272 species collected from 132 field sites over 63 field days and four years, comprising the most extensive collection of fishes from this region to date. We conduct a preliminary community phylogenetic analysis based on this collection and recover results largely statistically indistinguishable from the random expectation, with only a few instances of phylogenetic structure. Based on these results, and of those published in other recent biogeographic studies, we conclude that the Fitzcarrald fish species pool accumulated over a period of several million years, plausibly as a result of dispersal from the larger species pool of Greater Amazonia.

Phylogenetic relationships of the family Tarumaniidae (Characiformes) based on nuclear and mitochondrial data

Characiformes is an order of freshwater fishes that includes many commercially important and emblematic species from South America and Africa, such as the popular piranhas, hatchetfishes, African tiger fishes and tetras. The order is split into two suborders with a total of 24 families, 282 genera and ca. 2,100 species. Here, we present an expanded phylogeny of characiform fishes, including data for 520 species and three genes (12S, 16S and RAG1), and the recently described family Tarumaniidae, which has not been examined by previous molecular analysis. Although our genetic coverage is limited to three gene fragments, the tree inferred based on maximum likelihood and Bayesian inference supports the monophyly of all characiform families and is largely congruent with results from recent studies that sampled less taxa but more genes. Also in agreement with a morphological hypothesis, our results strongly support the sister-group relationships between the family Tarumaniidae and Erythrinidae. Based on our results and that of the other molecular analyses, we propose a revised circumscription of the superfamily Erythrinoidea to include the families Tarumaniidae and Erythrinidae only.(AU)

Characiformes es un orden de peces de agua dulce que incluye un gran numero de especies emblemáticas y de importancia comercial en Sur América y África como lo son las populares pirañas, los peces voladores, los peces tigre de África y los tetras. El orden se divide en dos subórdenes con un total de 24 familias, 282 géneros y cerca de 2100 especies. Aquí, presentamos una filogenia expandida de Characiformes, que incluye datos de 520 especies, tres genes (12S, 16S y RAG1) y la recientemente descrita familia Tarumaniidae, la cual no ha sido examinada en previos análisis moleculares. Aunque nuestra cobertura genética esta limitada a tres genes, el árbol inferido basado en máxima verosimilitud e inferencia bayesiana apoya la monófila de todas las familias de Characiformes y es en gran medida congruente con los resultados de estudios recientes que examinaron menos especies pero más genes. También de acuerdo con una hipótesis morfológica, nuestros resultados apoyan firmemente las relaciones de grupos hermanos entre las familias Tarumaniidae y Erythrinidae. Con base en nuestros resultados y el de otros estudios moleculares, proponemos una circunscripción revisada de la superfamilia Erythrinoidea que incluye solo a las familias Tarumaniidae y Erythrinidae.(AU)

Phylogenetic relationships of the family Tarumaniidae (Characiformes) based on nuclear and mitochondrial data

Characiformes is an order of freshwater fishes that includes many commercially important and emblematic species from South America and Africa, such as the popular piranhas, hatchetfishes, African tiger fishes and tetras. The order is split into two suborders with a total of 24 families, 282 genera and ca. 2,100 species. Here, we present an expanded phylogeny of characiform fishes, including data for 520 species and three genes (12S, 16S and RAG1), and the recently described family Tarumaniidae, which has not been examined by previous molecular analysis. Although our genetic coverage is limited to three gene fragments, the tree inferred based on maximum likelihood and Bayesian inference supports the monophyly of all characiform families and is largely congruent with results from recent studies that sampled less taxa but more genes. Also in agreement with a morphological hypothesis, our results strongly support the sister-group relationships between the family Tarumaniidae and Erythrinidae. Based on our results and that of the other molecular analyses, we propose a revised circumscription of the superfamily Erythrinoidea to include the families Tarumaniidae and Erythrinidae only.(AU)

Characiformes es un orden de peces de agua dulce que incluye un gran numero de especies emblemáticas y de importancia comercial en Sur América y África como lo son las populares pirañas, los peces voladores, los peces tigre de África y los tetras. El orden se divide en dos subórdenes con un total de 24 familias, 282 géneros y cerca de 2100 especies. Aquí, presentamos una filogenia expandida de Characiformes, que incluye datos de 520 especies, tres genes (12S, 16S y RAG1) y la recientemente descrita familia Tarumaniidae, la cual no ha sido examinada en previos análisis moleculares. Aunque nuestra cobertura genética esta limitada a tres genes, el árbol inferido basado en máxima verosimilitud e inferencia bayesiana apoya la monófila de todas las familias de Characiformes y es en gran medida congruente con los resultados de estudios recientes que examinaron menos especies pero más genes. También de acuerdo con una hipótesis morfológica, nuestros resultados apoyan firmemente las relaciones de grupos hermanos entre las familias Tarumaniidae y Erythrinidae. Con base en nuestros resultados y el de otros estudios moleculares, proponemos una circunscripción revisada de la superfamilia Erythrinoidea que incluye solo a las familias Tarumaniidae y Erythrinidae.(AU)

New species of Metynnis Cope, 1878 (Characiformes: Characidae) from the rio Paraguay basin, Mato Grosso State, Brazil

A new species of Metynnis is described from the rio Cuiabá and rio Manso drainages, in the upper rio Paraguay basin, Mato Grosso State, Brazil. This laterally compressed species, which rarely exceeds 140 mm in SL, is readily distinguished from other members of the genus Metynnis by having 100-110 lateral-line scales, 48-56 rows of scales above the lateral line, 32-36 circumpeduncular scales, 22-24 gill rakers, 38 vertebrae, singular color pattern, and relatively smaller snout, width, and head length.(AU)

Uma nova espécie de Metynnis é descrita das drenagens dos rios Cuiabá e Manso, bacia do alto rio Paraguai, Estado do Mato Grosso, Brasil. Essa espécie de corpo comprimido lateralmente, que raramente excede os 140 mm de comprimento padrão, é prontamente diagnosticada dos outros membros do gênero Metynnis por possuir 100-110 escamas na linha lateral, 48-56 séries de escamas acima da linha lateral, 32-36 escamas circumpedunculares, 22-24 rastros branquiais, 38 vértebras, padrão de colorido distinto, e comprimento do focinho, largura e comprimento da cabeça relativamente menores.(AU)

Comments on the type status of Laemolyta (Characiformes: Anostomidae) specimens described by Garman, 1890 and Borodin, 1931

The type status of the specimens of the genus Laemolyta described by S. Garman and N. Borodin are reviewed. The species involved were described as Anostomus varius nitens Garman, 1890, A. varius Garman, 1890, A. proximus Garman, 1890, and A. garmani Borodin, 1931. Several lots were subsequently erroneously designated as types and their status are corrected.(AU)

O status dos exemplares tipo do gênero Laemolyta descritos por S. Garman e N. Borodin são revisados. As espécies envolvidas foram descritas como Anostomus varius nitens Garman, 1890, A. varius Garman, 1890, A. proximus Garman, 1890 e A. garmani Borodin, 1931. Vários lotes foram erroneamente designados subsequentemente como tipos e seus status são corrigidos.(AU)

Harttia merevari, a new species of catfish (Siluriformes: Loricariidae) from Venezuela

Harttia merevari, a new species of loricariid catfish, is described from eight specimens captured in the upper Caura River, Orinoco River basin, Venezuela. The new species is recognized by the following combination of characters: abdomen naked; two or three preanal plates; a bony plate before each branchial opening; seven lateral plates between the pectoral and pelvic fins; maxillary barbel short and attached to the oral disk by a fleshy fold; head dorsal surface and anterior portion of the body light or dark yellow with numerous, round black spots; posterior region of the body light or dark yellow with five black transverse bands, dorsal central area of the two anterior bands diffused. The discovery of this new species extends the distribution of the genus northwest to include the Orinoco River basin on the northern slope of the Guyana shield.

Harttia merevari, uma espécie nova de bagre loricarideo é descrita com base em oito exemplares capturados no alto rio Caura, bacia do rio Orinoco, Venezuela. A espécie nova se distingue pela seguinte combinação de caracteres: abdome nu; duas ou três placas preanais; presença de uma placa óssea anterior a cada abertura branquial; sete placas laterais entre as nadadeiras peitorais e pélvicas; barbilhão maxilar curto e unido ao disco oral por uma dobra carnosa; superfície dorsal da cabeça e região anterior do corpo amarelo escuro ou marrom claro com numerosos pontos negros arredondados, região dorsal e posterior do corpo amarelo escuro ou marrom claro com cinco bandas transversais negras, as duas bandas anteriores com a parte dorsocentral difusa. A descoberta desta espécie nova estende a distribuição do gênero ao noroeste incluindo a bacia do rio Orinoco na vertente norte do Escudo das Guianas.

Harttia merevari, a new species of catfish (Siluriformes: Loricariidae) from Venezuela

Harttia merevari, a new species of loricariid catfish, is described from eight specimens captured in the upper Caura River, Orinoco River basin, Venezuela. The new species is recognized by the following combination of characters: abdomen naked; two or three preanal plates; a bony plate before each branchial opening; seven lateral plates between the pectoral and pelvic fins; maxillary barbel short and attached to the oral disk by a fleshy fold; head dorsal surface and anterior portion of the body light or dark yellow with numerous, round black spots; posterior region of the body light or dark yellow with five black transverse bands, dorsal central area of the two anterior bands diffused. The discovery of this new species extends the distribution of the genus northwest to include the Orinoco River basin on the northern slope of the Guyana shield.

Harttia merevari, uma espécie nova de bagre loricarideo é descrita com base em oito exemplares capturados no alto rio Caura, bacia do rio Orinoco, Venezuela. A espécie nova se distingue pela seguinte combinação de caracteres: abdome nu; duas ou três placas preanais; presença de uma placa óssea anterior a cada abertura branquial; sete placas laterais entre as nadadeiras peitorais e pélvicas; barbilhão maxilar curto e unido ao disco oral por uma dobra carnosa; superfície dorsal da cabeça e região anterior do corpo amarelo escuro ou marrom claro com numerosos pontos negros arredondados, região dorsal e posterior do corpo amarelo escuro ou marrom claro com cinco bandas transversais negras, as duas bandas anteriores com a parte dorsocentral difusa. A descoberta desta espécie nova estende a distribuição do gênero ao noroeste incluindo a bacia do rio Orinoco na vertente norte do Escudo das Guianas.

Policultivo de Matrinchã (Brycon sp.) e Jaraqui (Semaprochilodus sp.) em pequenas represas

Potyculture with "matrinchã" (Brycon sp.) and "jaraqui" (Semaprockilodus sp.) was carried out in two "terra firme" stream impoundments near Manaus with a water surface of approximately 6500 and 1500 m2 each. Dams were stocked with fingerlings captured in nature at a stocking rate of approximately 0.4 - 0.5 fish/m2 for each species. Fish were fed on a commercial chicken diet (18.5% crude protein, 5.4% crude, fat) with a daily ratio of 4% o{ the BAycon sp. biomass, up to a mean body weight of 250 g, when the daily feeding rate was reduced to 3% of the biomass. Fish growth and water quality were checked monthly. After a period of 307 days for one dam and 364 days for the second, a total biomass of 1035 kg and 506 kg was achieved, corresponding to a total calculated production of 3.7 and 3.4 t/ha/y, respectively.

Foi estudado o crescimento de matrinchã (Brycon sp.) e jaraqui (Semaprochilodus sp.) em sistema de policultivo em duas pequenas represas de igarapés de terra firme, nos arredores de Manaus, com superfícies de água de aproximadamente 6500 e 1500 m2 . As represas foram povoadas com alevinos capturados na natureza numa taxa de esfocagem de aproximadanente 0,4 - 0,5 peixe/m2 para cada espécie. Os peixes foram alimentados com uma ração comercial para aves poedeiras (18,5% proteína bruto, 5,4% extrato etéreo), sendo a quantidade diária inicial de 4% da biomassa dos matrinchãs até atingirem um peso médio de 250 g e, poste lio rmente, de 3% da biomassa dos mesmos. Mensalmente foi feita amostragem dos peixes e da água, que é quimicamente pobre. Em 307 e 364 dias de experimento nas duas represas foram obtidos, respectivamente, 2035 kg e 506 kg de biomassa total de peixes, o que corresponde a uma produção total calculada de 3,7 t/ha/ano e 3,4 t/ ha/ano.

Policultivo de Matrinchã (Brycon sp.) e Jaraqui (Semaprochilodus sp.) em pequenas represas

Potyculture with "matrinchã" (Brycon sp.) and "jaraqui" (Semaprockilodus sp.) was carried out in two "terra firme" stream impoundments near Manaus with a water surface of approximately 6500 and 1500 m2 each. Dams were stocked with fingerlings captured in nature at a stocking rate of approximately 0.4 - 0.5 fish/m2 for each species. Fish were fed on a commercial chicken diet (18.5% crude protein, 5.4% crude, fat) with a daily ratio of 4% o{ the BAycon sp. biomass, up to a mean body weight of 250 g, when the daily feeding rate was reduced to 3% of the biomass. Fish growth and water quality were checked monthly. After a period of 307 days for one dam and 364 days for the second, a total biomass of 1035 kg and 506 kg was achieved, corresponding to a total calculated production of 3.7 and 3.4 t/ha/y, respectively.

Foi estudado o crescimento de matrinchã (Brycon sp.) e jaraqui (Semaprochilodus sp.) em sistema de policultivo em duas pequenas represas de igarapés de terra firme, nos arredores de Manaus, com superfícies de água de aproximadamente 6500 e 1500 m2 . As represas foram povoadas com alevinos capturados na natureza numa taxa de esfocagem de aproximadanente 0,4 - 0,5 peixe/m2 para cada espécie. Os peixes foram alimentados com uma ração comercial para aves poedeiras (18,5% proteína bruto, 5,4% extrato etéreo), sendo a quantidade diária inicial de 4% da biomassa dos matrinchãs até atingirem um peso médio de 250 g e, poste lio rmente, de 3% da biomassa dos mesmos. Mensalmente foi feita amostragem dos peixes e da água, que é quimicamente pobre. Em 307 e 364 dias de experimento nas duas represas foram obtidos, respectivamente, 2035 kg e 506 kg de biomassa total de peixes, o que corresponde a uma produção total calculada de 3,7 t/ha/ano e 3,4 t/ ha/ano.