B4GALT1, LHR, FSHR and IGF2 polymorphisms and scrotal circumference in Nellore bulls / Polimorfismos dos genes B4GALT1, LHR, FSHR e IGF2 e perímetro escrotal em touros da raça Nelore

We assessed whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the genes beta 1,4- galactosyltransferase (B4GALT1), luteinizing hormone receptor (LHR), follicle-stimulating hormone receptor (FSHR) and insulin-like growth factor 2 (IGF2) could be molecular markers for scrotal circumference (SC) in Nellore bulls. Animals with positive (+, n = 104) and negative (-, n = 74) expected progeny difference for scrotal circumference at 365 days (EPD SC 365) were selected and their SNPs were analyzed by restriction fragment length polymorphism (RFLP). The correlation between EPD SC 365 and expected progeny difference for age at first birth (EPD AFB) was also investigated. The SNPs in B4GALT1 and FSHR was not different between two groups analyzed. The CC genotype for LHR gene was most frequent in animals with EPD SC 365(+), whereas the TT was most frequent in the EPD SC 365(-). For IGF2 the CT and CC were the most frequent genotypes observed in animals with positive and negative EPD SC 365, respectively. The EPD SC 365 was negatively correlated with the EPD AFB (r = 0.23). We suggest that CC and TT genotypes for LHR and IGF2, respectively, could be possible molecular markers for SC selection in Nellore bulls, that can also predict for AFB.(AU)

Foram avaliados se polimorfismos de base única (SNPs) presentes nos genes beta-1,4- galactosiltransferase (B4GALT1), receptor de hormônio luteinizante (LHR), receptor de hormônio folículo estimulante (FSHR) e fator de crescimento semelhante à insulina 2 (IGF2) poderiam ser marcadores moleculares para o perímetro escrotal (PE) em touros da raça Nelore. Animais com diferença esperada de progênie positiva (+, n = 104) e negativa (-, n = 74) para PE aos 365 dias (DEP PE 365) foram selecionados e seus SNPs foram analisados utilizando a técnica de polimorfismo de comprimento de fragmentos de restrição (RFLP). A correlação entre DEP PE 365 e idade ao primeiro parto (DEP IPP) também foi investigada. Os SNPs dos genes B4GALT1 e FSHR não apresentaram diferença entre os dois grupos analisados. O genótipo CC para o gene LHR foi mais freqüente em animais com DEP PE 365 (+), enquanto o TT foi mais frequente no grupo com DEP PE 365 (-). Para o gene IGF2, os genótipos CT e CC foram mais freqüentes em animais com DEP PE 365 positiva e negativa, respectivamente. A DEP PE 365 foi negativamente correlacionada com a DEP IPP (r = -0,23). O genótipo CC para o gene LHR e genótipo TT para o gene IGF2 podem ser possíveis marcadores de PE para a seleção assistida em touros da raça Nelore, podendo ser ainda preditores para IPP.(AU)

B4GALT1, LHR, FSHR and IGF2 polymorphisms and scrotal circumference in Nellore bulls / Polimorfismos dos genes B4GALT1, LHR, FSHR e IGF2 e perímetro escrotal em touros da raça Nelore

We assessed whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the genes beta 1,4- galactosyltransferase (B4GALT1), luteinizing hormone receptor (LHR), follicle-stimulating hormone receptor (FSHR) and insulin-like growth factor 2 (IGF2) could be molecular markers for scrotal circumference (SC) in Nellore bulls. Animals with positive (+, n = 104) and negative (-, n = 74) expected progeny difference for scrotal circumference at 365 days (EPD SC 365) were selected and their SNPs were analyzed by restriction fragment length polymorphism (RFLP). The correlation between EPD SC 365 and expected progeny difference for age at first birth (EPD AFB) was also investigated. The SNPs in B4GALT1 and FSHR was not different between two groups analyzed. The CC genotype for LHR gene was most frequent in animals with EPD SC 365(+), whereas the TT was most frequent in the EPD SC 365(-). For IGF2 the CT and CC were the most frequent genotypes observed in animals with positive and negative EPD SC 365, respectively. The EPD SC 365 was negatively correlated with the EPD AFB (r = 0.23). We suggest that CC and TT genotypes for LHR and IGF2, respectively, could be possible molecular markers for SC selection in Nellore bulls, that can also predict for AFB.

Foram avaliados se polimorfismos de base única (SNPs) presentes nos genes beta-1,4- galactosiltransferase (B4GALT1), receptor de hormônio luteinizante (LHR), receptor de hormônio folículo estimulante (FSHR) e fator de crescimento semelhante à insulina 2 (IGF2) poderiam ser marcadores moleculares para o perímetro escrotal (PE) em touros da raça Nelore. Animais com diferença esperada de progênie positiva (+, n = 104) e negativa (-, n = 74) para PE aos 365 dias (DEP PE 365) foram selecionados e seus SNPs foram analisados utilizando a técnica de polimorfismo de comprimento de fragmentos de restrição (RFLP). A correlação entre DEP PE 365 e idade ao primeiro parto (DEP IPP) também foi investigada. Os SNPs dos genes B4GALT1 e FSHR não apresentaram diferença entre os dois grupos analisados. O genótipo CC para o gene LHR foi mais freqüente em animais com DEP PE 365 (+), enquanto o TT foi mais frequente no grupo com DEP PE 365 (-). Para o gene IGF2, os genótipos CT e CC foram mais freqüentes em animais com DEP PE 365 positiva e negativa, respectivamente. A DEP PE 365 foi negativamente correlacionada com a DEP IPP (r = -0,23). O genótipo CC para o gene LHR e genótipo TT para o gene IGF2 podem ser possíveis marcadores de PE para a seleção assistida em touros da raça Nelore, podendo ser ainda preditores para IPP.

Relação entre polimorfismo do gene do hormônio do crescimento e características de precocidade em novilhas da raça Nelore / Relationship between polymorphism of growth hormone and precocity traits in Nellore heifers

Avaliaram-se as relações entre o polimorfismo do gene do hormônio do crescimento (GH) e as características de precocidade, em novilhas da raça Nelore. Amostras de sangue periférico foram obtidas de 181 animais de três rebanhos distintos do estado da Bahia, nas quais foi realizada a extração de DNA e a amplificação por PCR, seguidas por digestão com enzima de restrição AluI. Os fragmentos resultantes da digestão enzimática foram analisados em gel de agarose 2 por cento para determinação dos respectivos genótipos. A frequência do alelo Leu nas amostras analisadas foi estimada em 100 por cento. Em decorrência da alta incidência de homozigose para o alelo Leu, sugere-se que o restriction fragment lenght polymorphism AluI do gene GH não possa ser considerado como marcador molecular para precocidade sexual em novilhas Nelore nesses rebanhos.(AU)

The relationships between polymorphism of growth hormone gene (GH) and precocity traits in Nellore heifers were evaluated. A total of 181 animals from three different farms of Bahia state, Brazil, were blood sampled. The DNA of each animal was extracted, amplified by PCR, and digested by "AluI" restriction enzyme, and the resultant fragments were analyzed in 2 percent agarose gel for genotype identification. The frequency of Leu allele in the analyzed samples was estimated in 100 percent. Due to the high incidence of homozygose for the Leu allele, it is suggested that the restriction fragment lenght polymorphism AluI of GH gene can not be considered as a molecular marker for sexual precocity in Nellore heifers of those herds.(AU)

Correlation of genome methylation of fig tree accessions with natural nematode and rust incidence / Correlação entre a metilação genômica de acessos de figueira e a incidência natural de nematoides e ferrugem

Commercial fig tree cultivation in Brazil involves a single cultivar, 'Roxo-de-Valinhos'. The use of a single cultivar results in serious diseases and related problems. The aim of this study was to characterize fig accessions by analyzing the natural root-knot nematode and leaf rust incidence in relation to the epigenomic profile of the plant, since epigenetic variations affect plant-pathogen interactions. All plants were attacked by nematodes, indicating susceptibility; Meloidogyne incognita was the root-knot nematode species involved. Joint analysis of data showed that methylation and leaf rust incidence were correlated when observed in the same phenological phase, presenting initial evidence of the same factorial pressure loads in genotypes, suggesting similar behavior within these genotypes.

O Brasil é o maior produtor de figos da América do Sul, porém o cultivo comercial brasileiro da figueira baseia-se na plantação de uma única cultivar, o Roxo-de-Valinhos, resultando em sérios problemas relativos a pragas e doenças. Uma vez que há variações epigenéticas na interação planta-patógeno, principalmente por meio da regulação gênica, o presente trabalho objetiva realizar a caracterização in vivo de acessos de figo, por meio da análise de incidência natural de nematoides formadores de galha e de incidência natural de ferrugem, correlacionada ao seu perfil epigenômico, a fim de subsidiar trabalhos de conservação, melhoramento genético e produção da cultura. A análise dos componentes principais dos dados da caracterização dos acessos foi realizada por meio da matriz de correlação residual obtida pela análise de variância conjunta utilizando o programa GENES. Pôde-se constatar que todas as plantas foram atacadas por este patógeno, evidenciando que são suscetíveis ao mesmo. Já a análise conjunta dos dados demonstrou que a metilação e a incidência de ferrugem em folhas, quando observadas na mesma fase fenológica da planta, se correlacionam, apresentando evidências iniciais de mesmas cargas fatoriais de pressão nos genótipos, com a premissa de comportamento semelhante nos mesmos, indicando que, além do fator genético, fatores abióticos também são responsáveis pelas alterações no fenótipo das plantas, evidenciando a plasticidade fenotípica das mesmas.