Efeito da autocorrelação residual na avaliação genética de cabras para a produção de leite e para o formato da curva de lactação / Effect of residual autocorrelation in the genetic evaluation of goats for milk yield and the shape of the lactation curve

Avaliou-se o efeito da autocorrelação residual sobre a qualidade das estimativas dos parâmetros genéticos para produção total de leite (PL) e para os coeficientes a, b e c do modelo de Wood e, consequentemente, sobre a classificação dos animais para estas características. O modelo de Wood foi ajustado às lactações de cabras considerando-se três situações de estrutura residual: (EI) - erros independentes, (AR1) - erros autorregressivos de primeira ordem e (EI - AR1) - erros AR1 somente para as lactações que apresentaram autocorrelação residual significativa e EI para as demais. As estimativas dos coeficientes a, b e c e PL foram utilizadas como variáveis dependentes em um modelo animal multicaracterístico, o qual incluiu os efeitos aleatórios de animal e de ambiente permanente e os efeitos fixos de grupo contemporâneo, número de crias por parto, grupos genéticos e ordem de parto, além das covariáveis duração da lactação e a idade da cabra ao parto. As diferentes estruturas residuais afetaram as estimativas dos parâmetros genéticos e as classificações dos animais para as características estudadas. Portanto, a seleção dos animais pode ser modificada pela presença da autocorrelação residual, sendo a estrutura EI-AR1 uma alternativa para contornar este problema.(AU)

The objective of this study was to evaluate the residual autocorrelation effect on the estimates of genetic parameters for total milk yield (MY) and the coefficients a, b and c of Wood's model and, consequently, the animal's classification for these traits. Wood's model was fitted to the lactation of goats considering three cases of residual structure: (IE) - independent errors, (AR1) - first order autoregressive errors, and (IE - AR1) - AR1 errors only for lactations that had significant residual autocorrelation and IE for others. Estimates of the coefficients a, b and c and PL were used as dependent variables in a multivariate animal model, which included the random effects of animal and permanent environmental and fixed effects of contemporary group, number of foals per birth, genetic groups and order of calving, besides the covariates of lactation length (linear) and age at parturition (linear and quadratic). The different residual structures affected the estimates of genetic parameters and the classification of animals for the traits studied. Therefore, the selection of animals can be modified with the presence of residual autocorrelation and the structure IE-AR1 is presented as an alternative to solve this problem.(AU)

Controlling Bacillus cereus adherence to stainless steel with different cleaning and sanitizing procedures used in dairy plants / Controle do processo de adesão de Bacillus cereus ao aço inoxidável após diferentes procedimentos de limpeza e sanitização usados na indústria de laticínios

Bacillus cereus adherence to stainless steel used to milk contact surfaces was observed, depending on the cleaning and sanitizing procedures applied and the physicochemical properties of the surfaces. Numbers of surviving B. cereus after hygiene procedures were affected by temperature, the concentrations of both alkaline and acid washes, and the pH of the chlorine solution. The adhesion of B. cereus to the stainless steel was not thermodynamically favorable, and the adherence of this microorganism occurred in lower number, in accordance to the thermodynamic aspect of adhesion.(AU)

Foi observada a adesão de Bacillus cereus em superfície de aço inoxidável em contato com o leite, segundo o procedimento de limpeza, a sanitização e as propriedades físico-químicas da superfície. O número de B. cereus viáveis, após os procedimentos de higienização, foi afetado pela temperatura, pela concentração das soluções alcalinas e ácidas e pelo pH da solução clorada. A adesão de B. cereus em aço inoxidável não foi termodinamicamente favorável, e ocorreu pouca adesão desse microrganismo, de acordo com os aspectos termodinâmicos da adesão.(AU)

Comportamento de componentes bioquímicos do sangue em equinos submetidos à ozonioterapia / Profile of blood biochemistry components in horses treated with ozone therapy

O comportamento de constituintes bioquímicos sanguíneos (glicose, fibrinogênio, creatina fosfoquinase e gama-glutamiltransferase) foi monitorado, in vivo, em 12 equinos mestiços (seis machos e seis fêmeas), com idade entre 4 e 20 anos, submetidos à ozonioterapia. O tratamento foi realizado mediante administração de 500 ou 1000mL da mistura de oxigênio-ozônio (O2-O3) por via intravenosa, a cada três dias, durante 24 dias. Os equinos foram distribuídos em quatro grupos: MT500 constituído por três machos tratados com 500mL; MT1000 por três machos tratados com 1000mL; FT500, por três fêmeas tratadas com 500mL e FT1000, por três fêmeas tratadas com 1000mL. A ozonioterapia por via intravenosa não ocasionou alterações clínicas nos equinos. Os valores médios mínimos e máximos de glicose, fibrinogênio, creatina fosfoquinase e gama-glutamiltransferase mantiveram-se dentro dos limites de referência para a espécie equina. Houve diminuição nas concentrações da glicose e gama-glutamiltransferase ao longo dos períodos de aplicação e aumento nos valores do fibrinogênio. A creatina fosfoquinase não sofreu efeito do tratamento.(AU)

The profile of blood biochemistry variables (glucose, fibrinogen, creatine phosphokinase, and gamma glutamyltransferase) was in vivo monitored in 12 crossbred horses (six males and six females), aging from four to 20-years-old treated with ozone therapy. Treatments were carried out by applying 500 or 1000mL of the mixture oxygen-ozone (O2-O3) via intravenous route, every three days, during 24 days. Horses were assigned to four groups: MT500 (three males given 500mL), MT1000 (three males given 1000mL), FT500 (three females given 500mL) and FT1000 (three females given 1000mL). Ozone therapy by intravenous route caused no clinical changes in the horses. Minimum and maximum mean values of glucose, fibrinogen, creatine phosphokinase, and gamma glutamyltransferase were within the range considered as normal reference for the equine species. There was decrease in glucose and gamma glutamyltransferase concentrations over the period of application, whereas fibrinogen increased and creatine phosphokinase was not affected by the treatment.(AU)

Valores biométricos obtidos por ultra-sonografia dos tendões flexores e ligamentos acessório inferior e suspensório da região metacárpica palmar de cavalos Mangalarga Marchador / Biometric values obtained by ultrasonography of flexor tendons and inferior accessory and suspensory ligaments of the palmar metacarpal region in Mangalarga Marchador horses

Determinou-se a área transversal (AT) dos tendões e ligamentos da região metacárpica palmar de 15 cavalos da raça Mangalarga Marchador. As áreas transversais do tendão do músculo flexor digital superficial (TFDS), do tendão do músculo flexor digital profundo (TFDP), do ligamento acessório inferior (LA) e do ligamento suspensório (LS) foram determinadas mediante ultra-sonografia, em sete zonas distintas (1A, 1B, 2A, 2B, 3A, 3B e 3C). Os valores médios da AT para TFDS foram: zona 1A, 1,07±0,13; zona 1B, 0,97±0,12; zona 2A, 0,77±0,08; zona 2B, 0,68±0,12; zona 3A, 0,74±0,10; zona 3B, 0,86±0,10; e zona 3C, 1,33±0,24. Para TFDP foram: zona 1A, 1,09±0,12; zona 1B, 0,99±0,14; zona 2A, 0,72±0,11; zona 2B, 0,63±0,10; zona 3A, 0,71±0,14; zona 3B, 0,87±0,14; e zona 3C, 1,39±0,20. Para LA foram: zona 1A, 1,17±0,14; zona 1B, 0,85±0,11; zona 2A, 0,73±0,12; zona 2B, 0,60±0,16; e zona 3A, 0,42±0,15. Para LS foram: zona 1A, 0,82±0,14; zona 1B, 1,23±0,15; zona 2A, 1,21±0,15; zona 2B, 1,18±0,14; e zona 3A, 1,20±0,31. A AT de cada estrutura avaliada foi similar entre membros torácicos, considerando a mesma zona estudada. Não houve diferença significativa entre a AT do TFDS e a do TFDP.(AU)

The transversal area (TA) of tendons and ligaments located in the palmar metacarpal region was studied in 15 Mangalarga Marchador horses without locomotor pathology. The superficial digital flexor tendon (SDFT), deep digital flexor tendon (DDFP), accessory ligament of the deep digital flexor tendon (AL-DDFP), and suspensory ligament (TIOM) were examined by ultrasonography, at seven different zones (1A, 1B, 2A, 2B, 3A, 3B e 3C), to determine the TA. The mean TA values for SDFT were: zone 1A, 1.07±0.13; zone 1B, 0.97±0.12; zone 2A, 0.77±0.08; zone 2B, 0.68±0.12; zone 3A, 0.74±0.10; zone 3B, 0.86±0.10; and zone 3C, 1.33±0.24. For DDFT were: zone 1A, 1.09±0.12; zone 1B, 0.99±0.14; zone 2A, 0.72±0.11; zone 2B, 0.63±0.10; zone 3A, 0.71±0.14; zone 3B, 0.87±0.14; and zone 3C, 1.39±0.20. For AL-DDFT were: zone 1A, 1.17±0.14; zone 1B, 0.85±0.11; zone 2A, 0.73±0.12; zone 2B, 0.60±0.16; and zone 3A, 0.42±0.15. For TIOM were: zone 1A, 0.82±0.14; zone 1B, 1.23±0.15; zone 2A, 1.21±0.15; zone 2B, 1.18±0.14; and zone 3A, 1.20±0.31. The TA of each structure examined was similar between the thoracic members in each of the studied zones. No significant difference was found among the TA of the SDFT and that of the DDFP.(AU)

Variabilidade genética e limite da seleção em populações de diferentes tipos de acasalamento / Genetic variability and selection limit in populations of different mating designs

Populações de cinco diferentes tipos de acasalamento, submetidas à seleção baseada no melhor preditor linear não-viesado (BLUP), foram avaliadas quanto às perdas genéticas por fixação de alelos desfavoráveis e limite da seleção, durante 50 gerações. Foram utilizados dados simulados na obtenção do genoma dos indivíduos de todas as populações. Uma característica quantitativa de herdabilidade 0,10 foi estudada em populações de seleção, com a seguinte estrutura de dados: razão sexual de 10, 20, 25 e 50 e tamanho efetivo da população de 36,36, 19,05, 15,38, e 7,84, respectivamente. Para cada razão sexual, formaram-se populações correspondentes aos tipos de acasalamento efetuados entre os reprodutores, em todas as gerações: acasalamentos preferenciais entre meios-irmãos e irmãos completos, acasalamentos preferenciais entre meios-irmãos, acasalamentos ao acaso, exclusão de acasalamentos entre irmãos completos e exclusão de acasalamentos entre meios-irmãos e irmãos completos. Valores percentuais mais baixos para locos fixados desfavoravelmente e limite da seleção mais alto foram observados na menor razão sexual (d= 10), na qual houve também melhor distinção entre os tipos de acasalamento estudados.(AU)

Populations of five different mating designs, submitted to selection based on best linear unbiased predicto (BLUP)r, were evaluated regarding to genetic losses by fixation of unfavorable alleles and selection limit, during 50 generations. Simulated data were used to obtain the genome of all individuals of the populations. A quantitative trait with heritability of 0.10 was studied in the selected populations, with the following structure: sexual ratio of 10, 20, 25, and 50 and effective population size of 36.36, 19.05, 15.38 and 7.84, respectively. For each sexual ratio different populations were generated corresponding to the following mating designs: preferential matings between half and full sibs, preferential matings between half sibs, random matings, exclusion of matings between full sibs and exclusion of matings of half and full sibs. Smallest percentage of unfavorably fixed loci and the highest selection limit were observed in the lower sexual ratio (d= 10). Better differentiation between the studied mating designs was also observed for the lower sexual ratio.(AU)

Efeitos da seleção individual e da seleção baseada no BLUP em populações diferentes, quanto ao tipo de acasalamento / Individual selection and selection based on BLUP effects in different populations, according to mating design

Dados simulados foram utilizados para avaliar o desempenho da seleção individual e da seleção baseada no melhor preditor linear não-viesado (BLUP), em populações que diferiam entre si, quanto ao tipo de acasalamento, no decorrer de 50 gerações. Estudou-se uma característica quantitativa com herdabilidade igual a 0,10, em populações de 600 indivíduos, que apresentaram a seguinte estrutura: valores de razão sexual (d), de 10 e 50, tamanhos efetivos de população (Ne), de 36,36 e 7,84 e intensidade de seleção dos machos (im), de 2,23 e 2,82. Em cada valor de d, formaram-se populações correspondentes ao tipo de acasalamento, em todas as gerações: acasalamentos preferenciais de meios-irmãos e irmãos completos, acasalamentos preferenciais entre meios-irmãos, acasalamentos ao acaso, exclusão de acasalamentos entre irmãos completos e exclusão de acasalamentos de meios-irmãos e irmãos completos. As características avaliadas ao longo das gerações foram: valores fenotípicos médios, consangüinidade média, perda percentual por fixação de alelos desfavoráveis e limite da seleção. Observou-se que o BLUP, o tipo de acasalamento, excluindo acasalamentos entre irmãos e a menor razão sexual, juntos, proporcionaram os melhores resultados de valores fenotípicos, durante 45 gerações de seleção. Nessa estratégia de seleção, verificou-se também atraso no número de gerações necessárias para se atingir determinado nível de consangüinidade.(AU)

The performance of individual selection and of selection based on best linear unbiased prediction (BLUP) for simulated data of a low heritability trait (h2=.10) selected for fifty generation in a population of 600 animals with different mating structures were evaluated. The mating structures evaluated were: mating ratio (d) of 10 and 50, population size (Ne) 36.36 and 7.84 and male selection intensity (im ) of 2.23 and 2.82. For each d level half and full sib matings, half sib matings, random mating systems and the exclusion of full sib and of half and full sib matings were also evaluated. The average phenotypic value, average inbreeding, percentage of loss by fixation of undesirable alleles and selection limit were studied. The results suggested that BLUP, mating systems with exclusion of between sib matings, and the smallest mating ratio resulted in higher phenotypic value along the 45 generation of selection and the number of generations to reach a specific inbreeding coefficient considering this selection strategy increased.(AU)

Efeito da violação de pressuposições da metodologia de modelos mistos na avaliação genética animal / Effect of assumption violations of the mixed model methodology on the genetic evaluation

Estudos de simulação foram conduzidos para verificar o efeito da violação de pressuposições da metodologia de modelos mistos, variâncias genéticas conhecidas sem erro e distribuição normal dos erros aleatórios sobre os ganhos genéticos obtidos durante 10 gerações de seleção. Outros parâmetros, como valor fenotípico e acurácia, também foram avaliados. Inicialmente, foi simulado um genoma constituído de uma única característica quantitativa governada por 500 locos. 0 genoma foi utilizado na construção de uma população-base, na qual a característica quantitativa possuía herdabilidade inicial de 0,10. Para se obter uma estrutura de parentesco a partir das populações-base, foi gerada uma população inicial a partir da qual o processo de seleção teve início e os erros nos componentes de variâncias e as distribuições dos efeitos de ambiente foram introduzidos. Para pressuposição de que a variância genética era conhecida, utilizaram-se as intensidades de erro de 0 por cento, -10 por cento, -30 por cento, -50 por cento, 10 por cento, 30 por cento e 50 por cento, enquanto que para a pressuposição de que a distribuição dos erros aleatórios era normal, utilizaram-se as distribuições normal, exponencial, poisson e uniforme. A cada geração foram selecionados 20 machos e 100 fêmeas, acasalados ao acaso, cada macho acasalado com cinco fêmeas, produzindo cinco descendentes por acasalamento. Esse processo foi repetido 30 vezes para minimização dos efeitos da flutuação gênica. Para a primeira pressuposição, não foi verificado efeito das intensidades de erro, aplicadas ao componente de variância genética aditiva sobre o ganho genético durante as 10 gerações de seleção. 0 mesmo resultado foi verificado para a distribuição dos erros aleatórios, ou seja, não houve influência de diferentes distribuições nos ganhos genéticos verificados (AU)

Simulation studies were conducted to evaluate the effects of two assumption violations of the methodology of mixed models (the variances are known without errors and normal distribution of the random errors) on the genetic gains. Phenotypic values and accuracy during 10 generations of selection were also studied. Initially, a genome of only one quantitative trait governed by 500 loci was simulated. The genome was used to construct the base population in which the initial heritability of the quantitative trait was 0.10. To obtain a relationship structure from the base population, a initial population was generated. To this population a selection process and the errors in the components of variance and the distribution of the environment effects were introduced. To violate the assumption that the genetic variance is known without errors, the following errors intensities 0%, -10%, -30%, -50%, 10%, 30% and 50% were tested, and to violate the assumption that the distribution of the random errors is normal, the following distribution were considered: normal, exponential, poisson and uniform. In each generation 20 males and 100 females were selected and they were mated in the ratio of one male to five females and five offspring per each mating. To minimize random drift this process was reapeted 30 times. There was no evidence of the effect of both assumption violations on the genetic gain, the phenotypic value and accuracy over 10 generations of selection. (AU)