Phylogeny of canine coronavirus (CCoV) from Brazilian dogs based on membrane protein partial sequences / Filogenia de Coronavírus canino (CCoV) de cães brasileiros com base em sequências parciais da proteína de membrana

Este artigo descreve a anteriormente desconhecida diversidade molecular de amostras brasileiras de Coronavírus canino (CCoV). Vinte e duas amostras foram submetidas à análise da sequência parcial do gene codificador da proteína de membrana, sendo 12 classificadas como CCoV Tipo II e 10 como CCoV Tipo I e uma possível sublinhagem tipicamente brasileira foi encontrada para o CCoV Tipo II.(AU)

Detection of Genetic characterization of Porcine circovirus 2 (PCV2) in Brazilian wildlife boars

A semi-intensive wildlife boars farm presented a clinical history of high mortality in 70 - 90 days-old pigs (> 50 %). Two 90 days-old animals with weight loss and wasting were necropsied and the samples tested for PCV2 by polymerase chain reaction (PCR). The genetic material of PCV2 was sequenced and classified into the PCV2a genotype together with PCV2 sequences obtained from samples of Poland, Brazil, Slovenia and Greece wild boars.

Detection of Genetic characterization of Porcine circovirus 2 (PCV2) in Brazilian wildlife boars

A semi-intensive wildlife boars farm presented a clinical history of high mortality in 70 - 90 days-old pigs (> 50 %). Two 90 days-old animals with weight loss and wasting were necropsied and the samples tested for PCV2 by polymerase chain reaction (PCR). The genetic material of PCV2 was sequenced and classified into the PCV2a genotype together with PCV2 sequences obtained from samples of Poland, Brazil, Slovenia and Greece wild boars.

Identification of Porcine parvovirus from wild boars by partial sequencing of the VP-2 coding gene / Identificação de parvovírus suíno em javalis a partir do sequenciamento parcial do gene VP-2

Este estudo descreve a detecção e a identificação de DNA de parvovírus suíno (PVS) em amostras de órgãos de dois javalis, por PCR e sequenciamento direcionado ao gene VP-2. Pools de órgãos (baço, rins, fígado, linfonodos e tonsila) de três javalis adultos e assintomáticos de Paraguaçu Paulista, SP, criados com propósitos comerciais, foram submetidos à detecção de PVS, resultando em duas amostras positivas após reações de nested-PCR direcionadas aos genes NS-1 e VP-2. Os fragmentos parciais de VP-2 foram sequenciados e comparados a sequências homólogas de cepas NADL-2 e Kresse, demonstrando identidade nucleotídica de 100%. Com relação a 29 cepas de PVS previamente isoladas no Brasil, o grau de identidade nucleotídica variou de 99 a 100% (uma a três substituições de nucleotídeos). Estes resultados demonstram, pela primeira vez, a detecção direta por PCR de parvovírus suíno em javalis, confirmada por análise de sequenciamento genético.(AU)

First isolation of equine herpesvirus type 1 from a horse with neurological disease in brazil

ABSTRACT This report describes the first Brazilian equine herpesvirus type 1 (EHV-1) isolation from a single fatal equine herpes myeloencephalopathy case in a mare. The isolation of EHV-1 was confirmed from the first passage of cerebrospinal fluid (CSF) sample in Vero cells by PCR and virus neutralization assay. As virus isolation from CSF is unlikely to be successful, as has been shown in several case reports, this circumstantial evidence suggests that the neurological disease was caused by particularly neurovirulent strain of EHV-1.

RESUMO O presente relato refere-se ao primeiro isolamento no Brasil do herpesvírus eqüino tipo 1 (HVE-1) proveniente de um caso clínico de mieloncefalopatia herpética em uma égua, que evoluiu para o óbito. O isolado do HVE-1, denominado 07/05, foi obtido a partir de uma amostra de líquor na primeira passagem em células Vero, confirmando-se sua identidade pela PCR e pela prova de neutralização viral. Como o isolamento viral a partir do líquor geralmente não é bem sucedido, conforme demonstrado em vários relatos de casos, o presente achado sugere que a doença neurológica foi causada por uma amostra particularmente neurovirulenta de HVE-1.

Circovírus suíno tipo 2 (pcv-2)

ABSTRACT Porcine circovirus-2 (PCV-2) is an icosahedric nonenveloped virus with a diameter of from 15 to 17 nm. It is the smallest animal virus and is associated with many swine syndromes, responsible for economic losses for pig farms. The high variability of the enconding genes for the structural proteins associated with the co-infections makes the diagnosis and prevention of this virus more difficult.

RESUMO O Circovírus suíno-2 (Porcine circovirus type 2 PCV-2) é um vírus não envelopado, apresenta simetria icosaédrica e mede de 15 a 17 nm de diâmetro. É o menor vírus animal descrito e está relacionado a várias síndromes que acometem suínos, responsável por perdas econômicas nas granjas. A alta variabilidade da região do genoma que codifica as proteínas estruturais associada às co-infecções, dificulta o seu diagnóstico e sua prevenção.

Mixed infections by bovine coronavirus, rotavirus and cryptosporidium parvum in an outbreak of neonatal diarrhea in beef cattle

ABSTRACT This article describes the role of bovine coronavirus, rotavirus and Cryptosporidium parvum in an outbreak of beef calf diarrhea in Presidente Epitácio, São Paulo State. Two out 9 fecal samples were positive to BCoV, 6 to C. parvum and 6 to rotavirus, with 4 rotavirus-C. parvumco-infections, 1 BCoV-C. parvumco-infection and 1 rotavirus-BCoV co-infection. These results show the need for a detailed survey of the etiology of diarrheas, aiming to evaluate the agents spread in a flock, allowing the design of prophylactic measures against gastroenteritis outbreaks.

RESUMO Estudou-se a participação de coronavírus bovino (BCoV) rotavírus e Cryptosporidium parvum em um surto de diarréia em bezerros de corte no Município de Presidente Epitácio, Estado de São Paulo. Das 9 amostras colhidas, 2 foram positivas para BCoV, 6 para C. parvum e 6 para rotavírus, sendo 4 co-infecções por rotavírus e C. parvum, 1 coinfecção por BCoV e C. parvume 1 co-infecção por rotavírus e coronavírus. Estes resultados reiteram a necessidade de que se pesquise de um modo abrangente a etiologia de diarréias, com o intuito de se avaliarem os agentes circulantes no rebanho, o que possibilita uma abordagem profilática mais exata para impedir o aparecimento de surtos epidêmicos de gastroenterites.

Detecção de ácidos nucléicos de Brucella spp., Leptospira spp., herpesvirus bovino e vírus da diarréia viral bovina, em fetos bovinos abortados e em animais mortos no perinatal / Detection of Brucella spp., Leptospira spp., bovine herpesvirus and bovine viral diarrhea virus nucleic acids in aborted fetuses and bovines dead perinatal

Samples of 114 bovine fetuses and 10 calves, which dead in perinatal period, were examined for detection of DNA. The most common detected agent was Brucella spp. in 17 samples (13.7%) followed by Leptospira spp. in 4 cases (3.2%),bovine herpesvirus (BHV) and bovine viral diarrhea (BVDV) in 3 animals (2.4%) each, and 1 for the association of BVDV and BHV. In 77.4 % (96/124) of the samples it was not possible to detect any agent.(AU)

Detecção dos genes das toxinas alfa (α), beta (β) e épsilon (ε) em amostras de clostridium perfringens isoladas de bovinos pela reação em cadeia da polimerase (pcr) / Detection of alfa, beta and epsilon toxins genes in clostridium perfringens strains isolated from bovines by the polimerase chain reaction

RESUMO O Clostridium perfringens, microrganismo anaeróbio, está presente no solo e no trato intestinal dos mamíferos. Provoca gangrena gasosa e intoxicação alimentar nos seres humanos e doenças enterotoxêmicas nos animais domésticos. O C. perfringens é classificado em 5 tipos (A, B, C, D e E) mediante a produção de quatro toxinas principais (alfa-α, beta-β, gama-γ, delta-δ e épsilon-ε). A identificação destas toxinas é realizada através da reação de soroneutralização em animais utilizando anti-soros específicos, os quais, além do alto custo, são de difícil obtenção em laboratórios de referência internacionais. Visando contribuir para a tipificação de amostras de C. perfringens, em nosso meio, o presente trabalho teve como objetivo avaliar a reação em cadeia da polimerase (PCR) na detecção dos genes que codificam as toxinas alfa (cpa), beta (cpb) e épsilon (etx) em isolamentos provenientes de bovinos. A sensibilidade analítica da técnica de PCR padronizada a partir do DNA total bacteriano foi de 2,27 ng/?L para o gene cpa e 227 pg/?L para os genes cpb e etx. Das 35 amostras de C. perfringens isoladas e tipificadas por PCR, 16 (45,7%) foram do tipo A, 18 (51,4%) foram do tipo C e 1 (2,9%) foi do tipo B.

ABSTRACT The Clostridium perfringens, an aerobic microorganism, is present in soil and intestinal tracts of mammals. It causes gaseous gangrene and food intoxication in human beings and enterotoxemic diseases in domestic animals.C. perfringens is classified into 5 types (A,B,C,D and E) according to the production of four main toxins: (alfa-α, beta-β, gama-γ, delta-δ e épsilon-ε). The identification of these toxins is made through serum neutralization test in animals, using specific anti-sera, however these reagents are of high cost and difficult to be obtained from international reference laboratories. To aid in the typing of the C. perfringens strains in our environment, the present work aimed to assess the use of the polymerase chain reaction (PCR) for the detection of the genes coding the alpha (cpa), beta (cpb) and epsilon (etx) toxins in bovines isolates.The analytical sensitivity of the PCR technique, standardized from the total bacterial DNA, was 2.27 ng/?L for the cpa gene and 227 pg/?L for the cpb and etx genes. Among the 35 C. perfringens isolates typed by PCR, 16 (45.7%) were of type A, 18 (51.4%) of type C, and 1 (2.9%) belonged to type B.

Detection of Leptospira spp. from pure cultures and from experimentally contaminated bovine semen by polymerase chain reaction / Detecção de Leptospira spp. através da reação em cadeia pela polimerase (PCR) em sêmen bovino experimentalmente contaminado

Due to the high importance of the venereal transmission of bovine leptospirosis, this study aimed to test the ability of PCR to detect Leptospira interrogans serovar hardjo DNA in experimentally contaminated bovine semen. Employing primers directed to the 16S rRNA gene, 10 bacteria/ml of semen could be detected by PCR. Results achieved in this work show that PCR can have a great potential to detect Leptospira spp. in insemination centers. (AU)

Considerando a importância do sêmen na transmissão da leptospira bovina, foi realizado o presente estudo que teve como objetivo aplicar a reação em cadeia pela polimerase (PCR) para a detecção de leptospiras em sêmen bovino experimentalmente contaminado. A reação de PCR foi capaz de amplificar um fragmento de DNA específico de 330 pares de bases a partir de cultivos puros de 26 sorovares de Leptospira spp. A contaminação experimental de sêmen com Leptospira interrogans serovar hardjo revelou que a técnica de PCR conseguiu detectar 10 bactérias/ml, concentração sensivelmente mais baixa que as 1.000 bactérias/ml detectadas através do cultivo microbiológico. Os resultados observados revelam o grande potencial da reação de PCR para a detecção de Leptospira spp. em sêmen bovino, notadamente em centrais de inseminação artificial.(AU)

DETECTION OF FELINE INFECTIOUS PERITONITIS VIRUS (FIPV) USING PCR. / DETECÇÃO DO VÍRUS DA PERITONITE INFECCIOSA FELINA (FIPV) POR MEIO DA PCR.

A peritonite infecciosa dos felinos (PIF) é uma doença geralmente fatal de felinos selvagens e domésticos. O agente etiológico da PIF (Feline Infectious Peritonitis Virus, FIPV) é um coronavírus; um RNA vírus envelopado de fita simples da família Coronaviridae. O presente artigo relata a padronização e a aplicação de um método de diagnóstico de PIF baseado em PCR do gene codificador da proteína S do FIPV. Amostras de efusão pleural ou peritonial de 11 gatos e 1 leoa e amostras de soro sangüíneo de 10 gatos com efusão cavitária foram enviadas ao Laboratório de Virologia da FMVZ-USP. Das 22 amostras testadas, apenas uma, referente a uma efusão pleural, mostrou-se positiva pela PCR. Hipóteses ligadas ao diagnóstico clínico, à dinâmica da infecção viral e a características intrínsecas das amostras podem ser utilizadas para explicar o número de amostras negativas. A técnica de PCR aqui descrita apresenta-se como uma alternativa para o diagnóstico da peritonite infecciosa dos felinos. Aliada aos diagnósticos sorológico e histopatológico, é uma ferramenta que vem ajudar a esclarecer a etiologia e a epidemiologia da doença em diversas espécies, permitindo um entendimento da cadeia de transmissão e da dinâmica e patogenia virais e da necessidade de vacinas.PALAVRAS-CHAVE: Peritonite. Felina. Diagnóstico. PCR.